25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1244 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1056  regulatory protein pfoR  98.87 
 
 		 355 aa  679    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.630661  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1244  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  685    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.254524  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0152  regulatory protein pfoR  72.99 
 
 		 343 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0155  hypothetical protein  72.99 
 
 		 343 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.021711  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1819  perfringolysin O regulator protein  64.41 
 
 		 340 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000327403  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3882  membrane protein PfoR  59.75 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5459  membrane protein PfoR  61.42 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5461  membrane protein PfoR  61.73 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5065  membrane protein; regulatory protein  61.42 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5049  membrane protein; regulatory protein  61.11 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5217  membrane protein PfoR  61.11 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5489  membrane protein PfoR  61.42 
 
 		 345 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5546  membrane protein PfoR  61.11 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5162  membrane protein PfoR  61.11 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5615  membrane protein PfoR  61.11 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5497  membrane protein PfoR  61.11 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2836  putative regulatory protein  65.48 
 
 		 347 aa  353  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0078  perfringolysin O regulator protein  56.01 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0300  regulatory protein PfoR  55.62 
 
 		 343 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.503963  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0293  phosphotransferase system fructose-specific IIC component-like protein  55.62 
 
 		 343 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1868  perfringolysin O regulator protein  48.39 
 
 		 343 aa  268  8e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2608  regulatory protein PfoR  44.8 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2556  phosphotransferase system fructose-specific IIC component-like protein  44.8 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2096  perfringolysin O regulator protein, putative  41.33 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0243  regulatory protein PfoR  48.4 
 
 		 687 aa  164  3e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>