25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2096 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2096  perfringolysin O regulator protein, putative  100 
 
 
347 aa  668    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2608  regulatory protein PfoR  80.4 
 
 
347 aa  554  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2556  phosphotransferase system fructose-specific IIC component-like protein  80.4 
 
 
347 aa  554  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0152  regulatory protein pfoR  42.11 
 
 
343 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0155  hypothetical protein  42.11 
 
 
343 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.021711  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1819  perfringolysin O regulator protein  40.18 
 
 
340 aa  230  3e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000327403  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1244  hypothetical protein  41.18 
 
 
355 aa  229  7e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.254524  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1056  regulatory protein pfoR  42.21 
 
 
355 aa  229  7e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.630661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3882  membrane protein PfoR  40.46 
 
 
345 aa  224  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5459  membrane protein PfoR  41.12 
 
 
345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5065  membrane protein; regulatory protein  41.12 
 
 
345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5049  membrane protein; regulatory protein  41.12 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5489  membrane protein PfoR  41.12 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5546  membrane protein PfoR  41.12 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5497  membrane protein PfoR  41.12 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5615  membrane protein PfoR  40.79 
 
 
345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5217  membrane protein PfoR  40.79 
 
 
345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5461  membrane protein PfoR  40.46 
 
 
345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0078  perfringolysin O regulator protein  41.89 
 
 
342 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5162  membrane protein PfoR  40.58 
 
 
345 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0300  regulatory protein PfoR  42.99 
 
 
343 aa  216  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.503963  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0293  phosphotransferase system fructose-specific IIC component-like protein  42.99 
 
 
343 aa  216  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2836  putative regulatory protein  43.73 
 
 
347 aa  212  7e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1868  perfringolysin O regulator protein  35.17 
 
 
343 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0243  regulatory protein PfoR  35.64 
 
 
687 aa  109  6e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>