76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2009 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2009  protein of unknown function DUF479  100 
 
 
196 aa  395  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2033  protein of unknown function DUF479  32.16 
 
 
196 aa  91.7  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2184  protein of unknown function DUF479  30.99 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4924  hypothetical protein  26.86 
 
 
190 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2389  hypothetical protein  33.53 
 
 
222 aa  85.9  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000200832  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4505  hypothetical protein  31.49 
 
 
194 aa  84.7  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56600  hypothetical protein  26.59 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509431  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2071  hypothetical protein  28.65 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.110808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1921  protein of unknown function DUF479  29.02 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2704  hypothetical protein  27.91 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000930637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2334  hypothetical protein  31.95 
 
 
203 aa  82  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000761485  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1468  hypothetical protein  28.49 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0492  protein of unknown function DUF479  28.57 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2364  protein of unknown function DUF479  28.14 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2895  hypothetical protein  29.56 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.955163  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08831  hypothetical protein  31.52 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.777413  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1590  hypothetical protein  28.73 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146525  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1184  hypothetical protein  30.99 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0100066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2473  hypothetical protein  25.33 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1946  protein of unknown function DUF479  28.99 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2339  hypothetical protein  28.9 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.940774  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1399  hypothetical protein  26.29 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0629048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1285  hypothetical protein  27.17 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37780  hypothetical protein  27.17 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2195  hypothetical protein  27.67 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0492797 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3540  hypothetical protein  30.29 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0682699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0961  hypothetical protein  24.42 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4466  hypothetical protein  24.42 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0340975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3015  hypothetical protein  27.54 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0922  hypothetical protein  24.42 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0128  protein of unknown function DUF479  27.27 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00458554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4050  hypothetical protein  24.86 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682335  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1753  hypothetical protein  26.42 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00151115  hitchhiker  0.00163692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0988  hypothetical protein  25 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000194666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4355  hypothetical protein  24.86 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05934  hypothetical protein  27.01 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1122  hypothetical protein  23.26 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.886376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1928  protein of unknown function DUF479  25.28 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1066  protein of unknown function DUF479  31.21 
 
 
200 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.226058 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0087  hypothetical protein  25.61 
 
 
199 aa  58.2  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.906418  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000200  acyl carrier protein phosphodiesterase  27.54 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0363622  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2908  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  23.6 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0873  acyl carrier protein phosphodiesterase  25.42 
 
 
193 aa  54.7  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3116  hypothetical protein  23.08 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0710  hypothetical protein  23.46 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1921  hypothetical protein  23.6 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.506882  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0434  acyl carrier protein phosphodiesterase  24.05 
 
 
193 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3266  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  23.46 
 
 
202 aa  51.2  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00477241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3386  hypothetical protein  23.46 
 
 
202 aa  51.2  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0331175  normal  0.675474 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3125  acyl carrier protein phosphodiesterase  23.46 
 
 
193 aa  51.2  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0307905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0474  acyl carrier protein phosphodiesterase  24.05 
 
 
193 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00352  putative glycoprotein  24.05 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3205  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  24.05 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.711394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2810  hypothetical protein  18.93 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0120945  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00356  hypothetical protein  24.05 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0436  acyl carrier protein phosphodiesterase  24.05 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3229  acyl carrier protein phosphodiesterase  24.05 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923906  hitchhiker  0.000000145385 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1432  hypothetical protein  21.79 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.205377  hitchhiker  0.00400563 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1567  protein of unknown function DUF479  18.34 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0469994  hitchhiker  0.0000024358 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  21.24 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.953041  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2790  hypothetical protein  18.34 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237471  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3099  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  27.66 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.481027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0484  acyl carrier protein phosphodiesterase  23.57 
 
 
193 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2885  hypothetical protein  18.34 
 
 
209 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.210491  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1017  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  27.66 
 
 
193 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0323  acyl carrier protein phosphodiesterase  22.29 
 
 
193 aa  48.9  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1059  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  20.69 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0191008 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1444  hypothetical protein  20.51 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408257  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1379  hypothetical protein  20.9 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.670968  hitchhiker  0.000107714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0442  acyl carrier protein phosphodiesterase  23.7 
 
 
193 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0448  acyl carrier protein phosphodiesterase  23.7 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00566103  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2487  hypothetical protein  17.16 
 
 
211 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018845  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0443  acyl carrier protein phosphodiesterase  23.12 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0503  acyl carrier protein phosphodiesterase  23.12 
 
 
193 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0461  acyl carrier protein phosphodiesterase  23.12 
 
 
193 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146117  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1687  hypothetical protein  25.71 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144857  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>