76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3116 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3116  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  423  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1379  hypothetical protein  87.68 
 
 		 208 aa  377  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.670968  hitchhiker  0.000107714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1432  hypothetical protein  87.68 
 
 		 208 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.205377  hitchhiker  0.00400563 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1444  hypothetical protein  86.7 
 
 		 208 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408257  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1567  protein of unknown function DUF479  67.65 
 
 		 209 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0469994  hitchhiker  0.0000024358 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2810  hypothetical protein  67.16 
 
 		 209 aa  280  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0120945  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2885  hypothetical protein  67.65 
 
 		 209 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.210491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2790  hypothetical protein  67.16 
 
 		 209 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237471  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2487  hypothetical protein  65.69 
 
 		 211 aa  278  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018845  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1468  hypothetical protein  47.52 
 
 		 197 aa  192  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1399  hypothetical protein  48.28 
 
 		 200 aa  191  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0629048  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2704  hypothetical protein  47.78 
 
 		 198 aa  191  8e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000930637  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2339  hypothetical protein  47.52 
 
 		 197 aa  190  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.940774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2895  hypothetical protein  45.54 
 
 		 197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.955163  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1753  hypothetical protein  46.04 
 
 		 200 aa  177  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00151115  hitchhiker  0.00163692 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2195  hypothetical protein  42.57 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0492797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56600  hypothetical protein  28.27 
 
 		 190 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4924  hypothetical protein  28.27 
 
 		 190 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37780  hypothetical protein  29 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0710  hypothetical protein  27.66 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4050  hypothetical protein  30.48 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4355  hypothetical protein  29.32 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4466  hypothetical protein  29.84 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0340975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1122  hypothetical protein  31.96 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.886376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0961  hypothetical protein  28.5 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0922  hypothetical protein  28.87 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3540  hypothetical protein  29.41 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0682699 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000200  acyl carrier protein phosphodiesterase  25 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0363622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1059  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  28.04 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0191008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3099  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  28.43 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.481027  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2071  hypothetical protein  27.6 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2389  hypothetical protein  27.98 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000200832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2908  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  28.04 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08831  hypothetical protein  29.02 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.777413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1285  hypothetical protein  26.84 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1921  protein of unknown function DUF479  28.28 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1590  hypothetical protein  25 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05934  hypothetical protein  24.61 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  24.87 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.953041  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1017  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  25.4 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2033  protein of unknown function DUF479  25.39 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01963  hypothetical protein  27.75 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156408  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0988  hypothetical protein  28.43 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1184  hypothetical protein  29.23 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0100066  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0087  hypothetical protein  24 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.906418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1687  hypothetical protein  23.32 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2184  protein of unknown function DUF479  27.18 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1066  protein of unknown function DUF479  25.65 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226058 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0873  acyl carrier protein phosphodiesterase  26.32 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1946  protein of unknown function DUF479  29.52 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0492  protein of unknown function DUF479  22.34 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1928  protein of unknown function DUF479  25.37 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4505  hypothetical protein  23.2 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2009  protein of unknown function DUF479  23.08 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2334  hypothetical protein  25.13 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000761485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0484  acyl carrier protein phosphodiesterase  26.84 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0474  acyl carrier protein phosphodiesterase  26.84 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00356  hypothetical protein  26.84 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3205  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  26.84 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.711394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0434  acyl carrier protein phosphodiesterase  26.84 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00352  putative glycoprotein  26.84 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0436  acyl carrier protein phosphodiesterase  26.84 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3229  acyl carrier protein phosphodiesterase  26.84 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923906  hitchhiker  0.000000145385 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3386  hypothetical protein  25.93 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0331175  normal  0.675474 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0442  acyl carrier protein phosphodiesterase  25.79 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3266  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  25.93 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00477241  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0323  acyl carrier protein phosphodiesterase  26.84 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3125  acyl carrier protein phosphodiesterase  25.93 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0307905  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0443  acyl carrier protein phosphodiesterase  25.79 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2473  hypothetical protein  28.07 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0461  acyl carrier protein phosphodiesterase  25.79 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0503  acyl carrier protein phosphodiesterase  25.79 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0448  acyl carrier protein phosphodiesterase  25.79 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00566103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3015  hypothetical protein  22.63 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2364  protein of unknown function DUF479  23.98 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0128  protein of unknown function DUF479  24.84 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00458554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>