77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2908 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2908  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  100 
 
 
199 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3099  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  77.72 
 
 
201 aa  316  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.481027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1017  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  73.06 
 
 
193 aa  300  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  71.5 
 
 
193 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.953041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1059  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  66.49 
 
 
193 aa  267  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0191008 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3125  acyl carrier protein phosphodiesterase  66.32 
 
 
193 aa  247  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0307905  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3266  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  65.8 
 
 
202 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00477241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3386  hypothetical protein  65.28 
 
 
202 aa  244  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0331175  normal  0.675474 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3205  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  59.59 
 
 
193 aa  219  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.711394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00356  hypothetical protein  59.59 
 
 
193 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0436  acyl carrier protein phosphodiesterase  59.59 
 
 
193 aa  219  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3229  acyl carrier protein phosphodiesterase  59.59 
 
 
193 aa  219  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923906  hitchhiker  0.000000145385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00352  putative glycoprotein  59.59 
 
 
193 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0484  acyl carrier protein phosphodiesterase  59.59 
 
 
193 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0434  acyl carrier protein phosphodiesterase  59.59 
 
 
193 aa  218  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0474  acyl carrier protein phosphodiesterase  59.59 
 
 
193 aa  218  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0873  acyl carrier protein phosphodiesterase  59.07 
 
 
193 aa  217  7.999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0323  acyl carrier protein phosphodiesterase  60.1 
 
 
193 aa  216  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0448  acyl carrier protein phosphodiesterase  56.99 
 
 
193 aa  208  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00566103  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0503  acyl carrier protein phosphodiesterase  56.99 
 
 
193 aa  208  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0461  acyl carrier protein phosphodiesterase  56.99 
 
 
193 aa  208  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146117  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0443  acyl carrier protein phosphodiesterase  56.99 
 
 
193 aa  207  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0442  acyl carrier protein phosphodiesterase  56.48 
 
 
193 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0710  hypothetical protein  44.79 
 
 
193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000200  acyl carrier protein phosphodiesterase  43.01 
 
 
200 aa  155  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0363622  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05934  hypothetical protein  41.54 
 
 
198 aa  148  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3540  hypothetical protein  37.63 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0682699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4505  hypothetical protein  32.49 
 
 
194 aa  116  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08831  hypothetical protein  33.15 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.777413  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1921  protein of unknown function DUF479  32.12 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4924  hypothetical protein  36.55 
 
 
190 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1590  hypothetical protein  32.16 
 
 
197 aa  111  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146525  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0961  hypothetical protein  32.51 
 
 
194 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4466  hypothetical protein  34.34 
 
 
194 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0340975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37780  hypothetical protein  37.5 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56600  hypothetical protein  35.53 
 
 
190 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509431  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4355  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0128  protein of unknown function DUF479  33.51 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00458554  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0922  hypothetical protein  32.02 
 
 
194 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2389  hypothetical protein  35.38 
 
 
222 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000200832  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2704  hypothetical protein  34.59 
 
 
198 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000930637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1399  hypothetical protein  34.59 
 
 
200 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0629048  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1753  hypothetical protein  36.22 
 
 
200 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00151115  hitchhiker  0.00163692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4050  hypothetical protein  33.99 
 
 
199 aa  104  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682335  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1285  hypothetical protein  34.39 
 
 
190 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2895  hypothetical protein  34.59 
 
 
197 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.955163  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0087  hypothetical protein  32.99 
 
 
199 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.906418  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2339  hypothetical protein  33.51 
 
 
197 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.940774  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1066  protein of unknown function DUF479  31.28 
 
 
200 aa  99.8  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.226058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1468  hypothetical protein  34.59 
 
 
197 aa  98.6  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2033  protein of unknown function DUF479  32.61 
 
 
196 aa  97.8  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0988  hypothetical protein  30.46 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000194666 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3015  hypothetical protein  31.22 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1122  hypothetical protein  36.17 
 
 
191 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.886376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2184  protein of unknown function DUF479  31.05 
 
 
196 aa  94.7  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01963  hypothetical protein  31.38 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1184  hypothetical protein  33.87 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0100066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0492  protein of unknown function DUF479  30.11 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1928  protein of unknown function DUF479  30.93 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2334  hypothetical protein  31.22 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000761485  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1921  hypothetical protein  31.31 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.506882  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1687  hypothetical protein  31.05 
 
 
199 aa  88.6  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144857  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2195  hypothetical protein  30.81 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0492797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1946  protein of unknown function DUF479  32.42 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2473  hypothetical protein  30.56 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2364  protein of unknown function DUF479  28.88 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2071  hypothetical protein  32.24 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.110808 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3116  hypothetical protein  28.04 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2885  hypothetical protein  26.56 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.210491  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1379  hypothetical protein  26.98 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.670968  hitchhiker  0.000107714 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2810  hypothetical protein  26.56 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0120945  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1567  protein of unknown function DUF479  27.6 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0469994  hitchhiker  0.0000024358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1432  hypothetical protein  26.98 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.205377  hitchhiker  0.00400563 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2790  hypothetical protein  27.6 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237471  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1444  hypothetical protein  26.46 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408257  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2487  hypothetical protein  27.6 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018845  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2009  protein of unknown function DUF479  23.6 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>