77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2389 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2389  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  448  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000200832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1184  hypothetical protein  63.54 
 
 		 194 aa  257  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0100066  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2334  hypothetical protein  55.96 
 
 		 203 aa  225  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000761485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2184  protein of unknown function DUF479  56.38 
 
 		 196 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2033  protein of unknown function DUF479  54.92 
 
 		 196 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2364  protein of unknown function DUF479  50 
 
 		 195 aa  192  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4924  hypothetical protein  44.92 
 
 		 190 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56600  hypothetical protein  44.39 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1285  hypothetical protein  44.39 
 
 		 190 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1921  protein of unknown function DUF479  36.13 
 
 		 194 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4355  hypothetical protein  42.02 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4050  hypothetical protein  42.02 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1122  hypothetical protein  42.78 
 
 		 191 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.886376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0961  hypothetical protein  41.18 
 
 		 194 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37780  hypothetical protein  42.78 
 
 		 193 aa  141  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4466  hypothetical protein  40.64 
 
 		 194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0340975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0922  hypothetical protein  40.64 
 
 		 194 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0988  hypothetical protein  40.11 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194666 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2473  hypothetical protein  41.34 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08831  hypothetical protein  32.46 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.777413  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4505  hypothetical protein  36.07 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0710  hypothetical protein  37.04 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1066  protein of unknown function DUF479  34.36 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226058 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1590  hypothetical protein  32.79 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0128  protein of unknown function DUF479  33.7 
 
 		 187 aa  119  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00458554  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1946  protein of unknown function DUF479  39.29 
 
 		 203 aa  118  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2071  hypothetical protein  39.56 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1928  protein of unknown function DUF479  35.9 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1468  hypothetical protein  34.04 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2704  hypothetical protein  31.96 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000930637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0087  hypothetical protein  31.98 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.906418  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3540  hypothetical protein  30.32 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0682699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0492  protein of unknown function DUF479  32.46 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1753  hypothetical protein  33.66 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00151115  hitchhiker  0.00163692 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2895  hypothetical protein  32.45 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.955163  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2908  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.38 
 
 		 199 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1017  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.28 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.75 
 
 		 193 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.953041  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3099  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.16 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.481027  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2195  hypothetical protein  34.04 
 
 		 197 aa  102  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0492797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2339  hypothetical protein  31.96 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.940774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1399  hypothetical protein  33.5 
 
 		 200 aa  99.4  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0629048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1059  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.99 
 
 		 193 aa  98.6  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0191008 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05934  hypothetical protein  30.81 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0443  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.64 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00356  hypothetical protein  34.87 
 
 		 193 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0434  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.87 
 
 		 193 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3229  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.87 
 
 		 193 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923906  hitchhiker  0.000000145385 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3205  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.87 
 
 		 193 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.711394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0474  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.87 
 
 		 193 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00352  putative glycoprotein  34.87 
 
 		 193 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0436  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.87 
 
 		 193 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0442  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.11 
 
 		 193 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0448  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.11 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00566103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000200  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.07 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0363622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0503  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.11 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0461  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.11 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0873  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.74 
 
 		 193 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0323  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.87 
 
 		 193 aa  93.2  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0484  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.36 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3015  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3125  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.28 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0307905  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3386  hypothetical protein  32.11 
 
 		 202 aa  88.2  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0331175  normal  0.675474 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3266  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.11 
 
 		 202 aa  88.2  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00477241  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2009  protein of unknown function DUF479  33.53 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1921  hypothetical protein  33.15 
 
 		 184 aa  85.1  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.506882  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01963  hypothetical protein  28.21 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2487  hypothetical protein  26.6 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2810  hypothetical protein  25.77 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0120945  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2790  hypothetical protein  25.76 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2885  hypothetical protein  25.25 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.210491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1567  protein of unknown function DUF479  25.76 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0469994  hitchhiker  0.0000024358 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1444  hypothetical protein  27.98 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408257  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1687  hypothetical protein  23.74 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1432  hypothetical protein  27.98 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.205377  hitchhiker  0.00400563 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1379  hypothetical protein  27.6 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.670968  hitchhiker  0.000107714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3116  hypothetical protein  27.98 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>