77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1687 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1687  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  413  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144857  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01963  hypothetical protein  34.21 
 
 
201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156408  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1921  protein of unknown function DUF479  33.85 
 
 
194 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37780  hypothetical protein  29.23 
 
 
193 aa  99  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3540  hypothetical protein  33.68 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0682699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2704  hypothetical protein  30.96 
 
 
198 aa  97.1  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000930637  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2195  hypothetical protein  32.64 
 
 
197 aa  96.3  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0492797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3015  hypothetical protein  28.28 
 
 
197 aa  94.7  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4050  hypothetical protein  30.73 
 
 
199 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682335  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4355  hypothetical protein  29.06 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2339  hypothetical protein  30.32 
 
 
197 aa  92.4  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.940774  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0087  hypothetical protein  32.65 
 
 
199 aa  91.3  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.906418  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2895  hypothetical protein  29.41 
 
 
197 aa  89.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.955163  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2908  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.05 
 
 
199 aa  88.6  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1753  hypothetical protein  30.3 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00151115  hitchhiker  0.00163692 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1399  hypothetical protein  27.98 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0629048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1285  hypothetical protein  26.7 
 
 
190 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1059  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  28.04 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0191008 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0710  hypothetical protein  29.17 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1468  hypothetical protein  28.34 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1066  protein of unknown function DUF479  26.06 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.226058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0988  hypothetical protein  27.37 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000194666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0961  hypothetical protein  28.42 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0922  hypothetical protein  27.87 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  28.12 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.953041  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1017  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  28.65 
 
 
193 aa  82  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2071  hypothetical protein  29.32 
 
 
206 aa  82  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.110808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3099  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  29.84 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.481027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4466  hypothetical protein  27.87 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0340975 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000200  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.28 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0363622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4924  hypothetical protein  26.78 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1928  protein of unknown function DUF479  25.89 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05934  hypothetical protein  31.44 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56600  hypothetical protein  27.6 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509431  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1122  hypothetical protein  27.23 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.886376 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4505  hypothetical protein  23.88 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2389  hypothetical protein  23.74 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000200832  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1590  hypothetical protein  21.54 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146525  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08831  hypothetical protein  24.21 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.777413  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1379  hypothetical protein  23.32 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.670968  hitchhiker  0.000107714 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0443  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.77 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0442  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.77 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2364  protein of unknown function DUF479  22.96 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0503  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.77 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0461  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.77 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146117  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1432  hypothetical protein  23.83 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.205377  hitchhiker  0.00400563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0492  protein of unknown function DUF479  23.71 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1184  hypothetical protein  24.14 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0100066  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1444  hypothetical protein  23.32 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408257  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0448  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.26 
 
 
193 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00566103  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2790  hypothetical protein  23.56 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237471  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3116  hypothetical protein  23.32 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0873  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.69 
 
 
193 aa  62.4  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2487  hypothetical protein  23 
 
 
211 aa  62  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018845  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2885  hypothetical protein  23.44 
 
 
209 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.210491  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1567  protein of unknown function DUF479  23.44 
 
 
209 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0469994  hitchhiker  0.0000024358 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2810  hypothetical protein  23.92 
 
 
209 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0120945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2033  protein of unknown function DUF479  25 
 
 
196 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0128  protein of unknown function DUF479  21.39 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00458554  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0323  acyl carrier protein phosphodiesterase  29.03 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2334  hypothetical protein  25.81 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000761485  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00356  hypothetical protein  29.03 
 
 
193 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0434  acyl carrier protein phosphodiesterase  29.03 
 
 
193 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0436  acyl carrier protein phosphodiesterase  29.03 
 
 
193 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3229  acyl carrier protein phosphodiesterase  29.03 
 
 
193 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923906  hitchhiker  0.000000145385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00352  putative glycoprotein  29.03 
 
 
193 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0474  acyl carrier protein phosphodiesterase  29.03 
 
 
193 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3205  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  29.03 
 
 
193 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.711394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3266  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  27.96 
 
 
202 aa  58.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00477241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3125  acyl carrier protein phosphodiesterase  27.96 
 
 
193 aa  58.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0307905  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0484  acyl carrier protein phosphodiesterase  29.03 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3386  hypothetical protein  27.42 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0331175  normal  0.675474 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2184  protein of unknown function DUF479  23.97 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1946  protein of unknown function DUF479  26.02 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2473  hypothetical protein  25.81 
 
 
199 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1921  hypothetical protein  27.17 
 
 
184 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.506882  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2009  protein of unknown function DUF479  25.71 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>