75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2487 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2487  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018845  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2885  hypothetical protein  91.18 
 
 
209 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.210491  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1567  protein of unknown function DUF479  91.18 
 
 
209 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0469994  hitchhiker  0.0000024358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2790  hypothetical protein  89.71 
 
 
209 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237471  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2810  hypothetical protein  89.22 
 
 
209 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0120945  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1444  hypothetical protein  69.61 
 
 
208 aa  293  9e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408257  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1432  hypothetical protein  69.61 
 
 
208 aa  290  8e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.205377  hitchhiker  0.00400563 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1379  hypothetical protein  68.63 
 
 
208 aa  288  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.670968  hitchhiker  0.000107714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3116  hypothetical protein  65.69 
 
 
204 aa  278  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1399  hypothetical protein  50.49 
 
 
200 aa  209  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0629048  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2704  hypothetical protein  50 
 
 
198 aa  208  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000930637  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1468  hypothetical protein  49.75 
 
 
197 aa  205  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2895  hypothetical protein  48.77 
 
 
197 aa  198  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.955163  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1753  hypothetical protein  48.77 
 
 
200 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00151115  hitchhiker  0.00163692 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2339  hypothetical protein  47.78 
 
 
197 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.940774  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2195  hypothetical protein  40.89 
 
 
197 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0492797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4924  hypothetical protein  30.21 
 
 
190 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56600  hypothetical protein  29.69 
 
 
190 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509431  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4355  hypothetical protein  29.17 
 
 
199 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1122  hypothetical protein  32.12 
 
 
191 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.886376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37780  hypothetical protein  28.14 
 
 
193 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4050  hypothetical protein  28.72 
 
 
199 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682335  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4466  hypothetical protein  26.56 
 
 
194 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0340975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1285  hypothetical protein  27.08 
 
 
190 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0961  hypothetical protein  25.77 
 
 
194 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0922  hypothetical protein  26.15 
 
 
194 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08831  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.777413  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2389  hypothetical protein  26.6 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000200832  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0988  hypothetical protein  25.39 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000194666 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0087  hypothetical protein  24.38 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.906418  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1066  protein of unknown function DUF479  23.59 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.226058 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3540  hypothetical protein  29.22 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0682699 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05934  hypothetical protein  25 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1184  hypothetical protein  27.18 
 
 
194 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0100066  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000200  acyl carrier protein phosphodiesterase  23.44 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0363622  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0710  hypothetical protein  23.28 
 
 
193 aa  72  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1590  hypothetical protein  24.87 
 
 
197 aa  72  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146525  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2071  hypothetical protein  25.65 
 
 
206 aa  72  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.110808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3099  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  25.74 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.481027  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1921  protein of unknown function DUF479  23.74 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2033  protein of unknown function DUF479  22.92 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4505  hypothetical protein  22.68 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2184  protein of unknown function DUF479  22.4 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01963  hypothetical protein  25.13 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2908  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  27.6 
 
 
199 aa  62.8  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1687  hypothetical protein  23 
 
 
199 aa  62  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144857  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2334  hypothetical protein  25.91 
 
 
203 aa  61.6  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000761485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0492  protein of unknown function DUF479  22.45 
 
 
193 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  23.71 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.953041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2473  hypothetical protein  22.83 
 
 
199 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1017  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  23.71 
 
 
193 aa  58.9  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0873  acyl carrier protein phosphodiesterase  24.23 
 
 
193 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0323  acyl carrier protein phosphodiesterase  26.18 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0128  protein of unknown function DUF479  26.04 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00458554  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00356  hypothetical protein  25.65 
 
 
193 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0434  acyl carrier protein phosphodiesterase  25.65 
 
 
193 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0484  acyl carrier protein phosphodiesterase  25.65 
 
 
193 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3205  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  25.65 
 
 
193 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.711394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0474  acyl carrier protein phosphodiesterase  25.65 
 
 
193 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00352  putative glycoprotein  25.65 
 
 
193 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0436  acyl carrier protein phosphodiesterase  25.65 
 
 
193 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3229  acyl carrier protein phosphodiesterase  25.65 
 
 
193 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923906  hitchhiker  0.000000145385 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1059  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  23.35 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0191008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0443  acyl carrier protein phosphodiesterase  24.21 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0442  acyl carrier protein phosphodiesterase  23.56 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1946  protein of unknown function DUF479  27.27 
 
 
203 aa  52.8  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0448  acyl carrier protein phosphodiesterase  23.56 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00566103  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0503  acyl carrier protein phosphodiesterase  23.56 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0461  acyl carrier protein phosphodiesterase  23.56 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146117  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3015  hypothetical protein  20.83 
 
 
197 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2009  protein of unknown function DUF479  17.16 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1928  protein of unknown function DUF479  24.38 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3386  hypothetical protein  23.44 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0331175  normal  0.675474 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3266  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  23.47 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00477241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3125  acyl carrier protein phosphodiesterase  23.59 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0307905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>