More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1502 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5327  phosphate ABC transporter inner membrane protein  56.86 
 
 
556 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.401326  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3641  phosphate ABC transporter, permease protein  61.82 
 
 
545 aa  707    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1724  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  82.61 
 
 
552 aa  902    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.57 
 
 
556 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.731136  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1534  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  85.33 
 
 
552 aa  942    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.814496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3167  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  88 
 
 
550 aa  1003    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2817  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  84.96 
 
 
552 aa  941    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1567  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  84.96 
 
 
552 aa  941    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235566  normal  0.31699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5235  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.86 
 
 
556 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268129  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1502  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
550 aa  1108    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125389  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5374  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  57.04 
 
 
556 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.642346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1409  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  83.09 
 
 
550 aa  921    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650343  normal  0.0594948 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2583  phosphate ABC transporter permease  81.7 
 
 
552 aa  902    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.129477  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2744  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  86.73 
 
 
550 aa  974    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0855633  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  83.33 
 
 
552 aa  929    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2626  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  82.97 
 
 
552 aa  926    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157698  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1358  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  83.54 
 
 
553 aa  930    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.221857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  84.78 
 
 
552 aa  941    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446083  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1435  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  83.33 
 
 
552 aa  927    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2733  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  83.15 
 
 
552 aa  928    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1699  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  85.27 
 
 
550 aa  954    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.934676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5613  phosphate ABC transporter permease  56.49 
 
 
556 aa  631  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70830  phosphate ABC transporter, permease protein  58.76 
 
 
558 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.666315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6146  phosphate specific transporter transmembrane protein  58.58 
 
 
558 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0181  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  57.89 
 
 
558 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.21 
 
 
550 aa  619  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48580  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  57.27 
 
 
556 aa  615  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0259  phosphate ABC transporter, permease protein  55.96 
 
 
548 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5039  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.44 
 
 
556 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5485  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  55.35 
 
 
557 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2397  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  57.27 
 
 
550 aa  596  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.610678  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004379  phosphate transport system permease protein PstA  56.76 
 
 
557 aa  592  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4415  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.92 
 
 
570 aa  589  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0704042  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01032  hypothetical protein  56.76 
 
 
557 aa  586  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1229  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  53.65 
 
 
570 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1346  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.65 
 
 
570 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3115  phosphate ABC transporter permease PstA  53.65 
 
 
570 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0955  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.16 
 
 
555 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.258386  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2651  phosphate ABC transporter, permease protein  55.66 
 
 
550 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2453  phosphate import protein, transmembrane component PstA  53.3 
 
 
509 aa  567  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0538  phosphate ABC transporter permease  52.17 
 
 
548 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1335  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.01 
 
 
548 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1238  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.18 
 
 
548 aa  536  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.572534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2943  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.46 
 
 
548 aa  534  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1136  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.9 
 
 
555 aa  525  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.479467  normal  0.87192 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.69 
 
 
558 aa  522  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2670  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.09 
 
 
548 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3159  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.8 
 
 
532 aa  498  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0620  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.75 
 
 
530 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0657  ABC-type phosphate transport system, permease component  45.06 
 
 
532 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.667392  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1304  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.24 
 
 
584 aa  441  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.637055 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3266  phosphate ABC transporter permease  45.39 
 
 
457 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03150  phosphate ABC transporter, permease protein  41.74 
 
 
519 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0420  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.47 
 
 
304 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.865104 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.39 
 
 
304 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4146  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.99 
 
 
304 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4004  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  52.99 
 
 
304 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.757198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.68 
 
 
284 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.54 
 
 
294 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1060  phosphate ABC transporter permease  40.68 
 
 
297 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2888  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.23 
 
 
288 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.107723 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.39 
 
 
284 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0564  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.54 
 
 
306 aa  182  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000405763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.47 
 
 
280 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0981  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.11 
 
 
305 aa  176  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0889131 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0763  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.4 
 
 
309 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.763641  normal  0.179278 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1780  phosphate ABC transporter, permease protein  38.78 
 
 
307 aa  166  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.64 
 
 
604 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2547  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.13 
 
 
346 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  39.16 
 
 
649 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0750  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  34.87 
 
 
286 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000021979  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4580  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.27 
 
 
294 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  0.447387 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.35 
 
 
339 aa  161  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.183597  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.5 
 
 
645 aa  160  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  35.88 
 
 
627 aa  157  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1163  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.45 
 
 
280 aa  156  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.96 
 
 
290 aa  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0154936  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0945  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.12 
 
 
449 aa  152  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1680  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.23 
 
 
448 aa  151  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.158794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.63 
 
 
284 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0703  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.02 
 
 
281 aa  150  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2104  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.66 
 
 
282 aa  150  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.09 
 
 
297 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1040  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.98 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221125  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.02 
 
 
646 aa  148  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05139  molybdate ABC transporter permease protein  35.32 
 
 
287 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001264  phosphate transport system permease protein PstA  35.71 
 
 
287 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2120  phosphate ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 
284 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1958  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.72 
 
 
287 aa  144  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.6 
 
 
424 aa  143  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.740309  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1097  phosphate ABC transporter, permease protein  34.44 
 
 
306 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1243  phosphate ABC transporter permease  35.98 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.352421  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2590  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstA  35.71 
 
 
281 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00589787  normal  0.413693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0047  phosphate ABC transporter permease  39.21 
 
 
299 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.519128  normal  0.369042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4549  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.49 
 
 
433 aa  140  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0067  phosphate ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 
289 aa  140  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.191661  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.7 
 
 
307 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.389648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1095  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.2 
 
 
282 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4494  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.47 
 
 
312 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3999  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.63 
 
 
416 aa  138  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>