More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5235 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5327  phosphate ABC transporter inner membrane protein  99.64 
 
 		 556 aa  1113    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.401326  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2817  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  58.39 
 
 		 552 aa  638    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3641  phosphate ABC transporter, permease protein  56.26 
 
 		 545 aa  635    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5485  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  85.59 
 
 		 557 aa  914    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1534  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  58.21 
 
 		 552 aa  636    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.814496  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5039  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  84.68 
 
 		 556 aa  909    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5374  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  97.84 
 
 		 556 aa  1065    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6146  phosphate specific transporter transmembrane protein  79.78 
 
 		 558 aa  871    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  58.21 
 
 		 552 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446083  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2397  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  66 
 
 		 550 aa  688    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.610678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5613  phosphate ABC transporter permease  85.23 
 
 		 556 aa  975    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48580  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  76.4 
 
 		 556 aa  820    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1502  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.86 
 
 		 550 aa  646    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4415  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  65.6 
 
 		 570 aa  725    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0704042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0181  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  75.5 
 
 		 558 aa  828    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  94.77 
 
 		 556 aa  1072    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.731136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5235  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 		 556 aa  1117    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268129  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2583  phosphate ABC transporter permease  58.94 
 
 		 552 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.129477  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3167  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.86 
 
 		 550 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1358  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  58.83 
 
 		 553 aa  639    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.221857  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70830  phosphate ABC transporter, permease protein  79.6 
 
 		 558 aa  873    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.666315 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2651  phosphate ABC transporter, permease protein  60.58 
 
 		 550 aa  652    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1567  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  58.39 
 
 		 552 aa  638    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235566  normal  0.31699 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1699  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  57.56 
 
 		 550 aa  633  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.934676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  57.66 
 
 		 552 aa  631  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2626  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  57.85 
 
 		 552 aa  634  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2733  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  57.85 
 
 		 552 aa  633  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1409  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  57.95 
 
 		 550 aa  633  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650343  normal  0.0594948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2744  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.86 
 
 		 550 aa  630  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0855633  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1435  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.93 
 
 		 552 aa  623  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1724  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  57.48 
 
 		 552 aa  617  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0955  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.43 
 
 		 555 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.258386  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1136  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.61 
 
 		 555 aa  580  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.479467  normal  0.87192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.92 
 
 		 550 aa  560  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0538  phosphate ABC transporter permease  51.81 
 
 		 548 aa  560  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.58 
 
 		 558 aa  553  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01032  hypothetical protein  51.71 
 
 		 557 aa  534  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0259  phosphate ABC transporter, permease protein  49.91 
 
 		 548 aa  531  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1346  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.91 
 
 		 570 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3115  phosphate ABC transporter permease PstA  49.91 
 
 		 570 aa  528  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1229  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  49.91 
 
 		 570 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3159  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.18 
 
 		 532 aa  526  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004379  phosphate transport system permease protein PstA  50.36 
 
 		 557 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2453  phosphate import protein, transmembrane component PstA  49.27 
 
 		 509 aa  514  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0620  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.09 
 
 		 530 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1335  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.09 
 
 		 548 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0657  ABC-type phosphate transport system, permease component  48.38 
 
 		 532 aa  482  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.667392  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1238  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.13 
 
 		 548 aa  474  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.572534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2943  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.73 
 
 		 548 aa  475  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2670  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.37 
 
 		 548 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1304  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.38 
 
 		 584 aa  444  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.637055 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3266  phosphate ABC transporter permease  62.05 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03150  phosphate ABC transporter, permease protein  38.69 
 
 		 519 aa  364  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4004  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  54.86 
 
 		 304 aa  246  9e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.757198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.47 
 
 		 304 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4146  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.69 
 
 		 304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0420  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.7 
 
 		 304 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.865104 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.36 
 
 		 284 aa  207  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1060  phosphate ABC transporter permease  42.26 
 
 		 297 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.26 
 
 		 294 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.41 
 
 		 280 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2888  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.64 
 
 		 288 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.107723 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.72 
 
 		 284 aa  192  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0564  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.97 
 
 		 306 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000405763  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0763  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.25 
 
 		 309 aa  189  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.763641  normal  0.179278 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40 
 
 		 604 aa  177  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0981  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.93 
 
 		 305 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0889131 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2547  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.9 
 
 		 346 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1780  phosphate ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 		 307 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0750  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  38.41 
 
 		 286 aa  172  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000021979  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  39.02 
 
 		 649 aa  170  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  37.64 
 
 		 627 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2104  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.12 
 
 		 282 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.23 
 
 		 645 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.88 
 
 		 646 aa  158  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0945  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.72 
 
 		 449 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1040  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  30.35 
 
 		 448 aa  158  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1680  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.46 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.158794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1163  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.36 
 
 		 280 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.58 
 
 		 297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4580  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.21 
 
 		 294 aa  154  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  0.447387 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.8 
 
 		 290 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0154936  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0703  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.4 
 
 		 281 aa  153  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.21 
 
 		 339 aa  153  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.183597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1095  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.2 
 
 		 282 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2590  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstA  36.1 
 
 		 281 aa  150  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00589787  normal  0.413693 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001264  phosphate transport system permease protein PstA  35.18 
 
 		 287 aa  150  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05139  molybdate ABC transporter permease protein  34.78 
 
 		 287 aa  150  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2120  phosphate ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 		 284 aa  150  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1243  phosphate ABC transporter permease  34.57 
 
 		 448 aa  146  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.352421  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4549  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.31 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.73 
 
 		 284 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1618  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38 
 
 		 448 aa  144  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2442  phosphate ABC transporter permease  39.44 
 
 		 303 aa  143  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.666961  hitchhiker  0.00775863 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0067  phosphate ABC transporter, permease protein  34.39 
 
 		 289 aa  143  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.191661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4494  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.61 
 
 		 312 aa  143  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1097  phosphate ABC transporter, permease protein  36.03 
 
 		 306 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1930  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.02 
 
 		 282 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.19172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.98 
 
 		 424 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.740309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.92 
 
 		 307 aa  140  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.389648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>