More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1238 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1346  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  60.18 
 
 
570 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1238  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
548 aa  1106    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.572534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1229  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  60.18 
 
 
570 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3115  phosphate ABC transporter permease PstA  60.18 
 
 
570 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2670  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  76.46 
 
 
548 aa  821    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1335  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  70.62 
 
 
548 aa  750    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  61.02 
 
 
550 aa  657    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2943  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  70.07 
 
 
548 aa  743    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1502  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.18 
 
 
550 aa  552  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125389  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3167  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.91 
 
 
550 aa  551  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3641  phosphate ABC transporter, permease protein  48.54 
 
 
545 aa  539  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.64 
 
 
552 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2817  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.82 
 
 
552 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1567  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.82 
 
 
552 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235566  normal  0.31699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1534  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.45 
 
 
552 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.814496  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1699  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49 
 
 
550 aa  537  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.934676 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2744  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49 
 
 
550 aa  535  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0855633  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2626  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.09 
 
 
552 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157698  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2733  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.09 
 
 
552 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1409  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  49 
 
 
550 aa  534  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650343  normal  0.0594948 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.91 
 
 
552 aa  531  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1435  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.91 
 
 
552 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2583  phosphate ABC transporter permease  49.18 
 
 
552 aa  526  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.129477  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1358  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.46 
 
 
553 aa  521  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.221857  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1724  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  48.64 
 
 
552 aa  514  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2397  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  51.74 
 
 
550 aa  502  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.610678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5613  phosphate ABC transporter permease  47.83 
 
 
556 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70830  phosphate ABC transporter, permease protein  49.91 
 
 
558 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.666315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6146  phosphate specific transporter transmembrane protein  49.73 
 
 
558 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0259  phosphate ABC transporter, permease protein  46.87 
 
 
548 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0955  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.65 
 
 
555 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.258386  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.28 
 
 
556 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.731136  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004379  phosphate transport system permease protein PstA  47.03 
 
 
557 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2453  phosphate import protein, transmembrane component PstA  48.09 
 
 
509 aa  493  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01032  hypothetical protein  47.75 
 
 
557 aa  490  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5327  phosphate ABC transporter inner membrane protein  47.31 
 
 
556 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.401326  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5039  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.38 
 
 
556 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0181  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.73 
 
 
558 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4415  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.49 
 
 
570 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0704042  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48580  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  48.64 
 
 
556 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5235  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.13 
 
 
556 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268129  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5374  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.13 
 
 
556 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.642346 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5485  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  47.37 
 
 
557 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0538  phosphate ABC transporter permease  43.49 
 
 
548 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1136  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.96 
 
 
555 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.479467  normal  0.87192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2651  phosphate ABC transporter, permease protein  46.18 
 
 
550 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3159  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.42 
 
 
532 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.13 
 
 
558 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0620  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.49 
 
 
530 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0657  ABC-type phosphate transport system, permease component  39.67 
 
 
532 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.667392  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1304  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.88 
 
 
584 aa  353  4e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.637055 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03150  phosphate ABC transporter, permease protein  39.4 
 
 
519 aa  338  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3266  phosphate ABC transporter permease  55.56 
 
 
457 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4004  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  55.78 
 
 
304 aa  239  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.757198  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4146  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.38 
 
 
304 aa  239  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.38 
 
 
304 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0420  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.99 
 
 
304 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.865104 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.09 
 
 
284 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.83 
 
 
294 aa  183  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.62 
 
 
280 aa  177  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0564  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.58 
 
 
306 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000405763  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0981  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.18 
 
 
305 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0889131 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1060  phosphate ABC transporter permease  41.6 
 
 
297 aa  170  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2888  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.6 
 
 
288 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.107723 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4580  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.6 
 
 
294 aa  163  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  0.447387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2547  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.5 
 
 
346 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.54 
 
 
339 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.183597  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.31 
 
 
284 aa  158  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  43.43 
 
 
649 aa  157  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0763  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.55 
 
 
309 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.763641  normal  0.179278 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0750  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  37.75 
 
 
286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000021979  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1780  phosphate ABC transporter, permease protein  42.06 
 
 
307 aa  154  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.92 
 
 
604 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  40.56 
 
 
627 aa  152  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0499  phosphate ABC transporter permease  30.68 
 
 
396 aa  150  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.34 
 
 
284 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.54 
 
 
645 aa  148  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.73 
 
 
424 aa  147  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.740309  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0945  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.05 
 
 
449 aa  145  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.37 
 
 
646 aa  145  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0703  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.69 
 
 
281 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.08 
 
 
290 aa  143  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0154936  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1680  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.33 
 
 
448 aa  143  8e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.158794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4494  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.19 
 
 
312 aa  143  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.84 
 
 
588 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.569683  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1040  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.36 
 
 
448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221125  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0349  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.74 
 
 
288 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000182732 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3637  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.41 
 
 
311 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.103396  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0587  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.98 
 
 
419 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.286112 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.03 
 
 
289 aa  137  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3627  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  28.7 
 
 
424 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.091097  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2681  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.55 
 
 
386 aa  137  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4549  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.02 
 
 
433 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1509  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.02 
 
 
276 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.09 
 
 
297 aa  136  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1448  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.66 
 
 
305 aa  136  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0047  phosphate ABC transporter permease  39.81 
 
 
299 aa  136  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.519128  normal  0.369042 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1477  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.66 
 
 
305 aa  136  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.508211  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.37 
 
 
288 aa  136  9e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2442  phosphate ABC transporter permease  39.45 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.666961  hitchhiker  0.00775863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>