More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1040 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0945  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  72.16 
 
 
449 aa  667    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1618  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  81.47 
 
 
448 aa  722    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1680  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  83.48 
 
 
448 aa  775    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.158794  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1243  phosphate ABC transporter permease  78.79 
 
 
448 aa  708    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.352421  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1235  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  74.11 
 
 
448 aa  636    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1040  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
448 aa  902    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2888  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.02 
 
 
288 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.107723 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1060  phosphate ABC transporter permease  51.42 
 
 
297 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50 
 
 
294 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0763  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.99 
 
 
309 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.763641  normal  0.179278 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.58 
 
 
284 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  46.34 
 
 
627 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  44.86 
 
 
649 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.97 
 
 
604 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.13 
 
 
645 aa  188  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1163  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.96 
 
 
280 aa  188  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0564  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.56 
 
 
306 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000405763  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.31 
 
 
284 aa  186  7e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.53 
 
 
646 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2104  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.63 
 
 
282 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1095  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.04 
 
 
282 aa  177  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0981  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.8 
 
 
305 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0889131 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1958  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.11 
 
 
287 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40 
 
 
280 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.3 
 
 
290 aa  172  9e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0154936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1780  phosphate ABC transporter, permease protein  44.86 
 
 
307 aa  170  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1669  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.15 
 
 
278 aa  169  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331352  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0750  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  41.15 
 
 
286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000021979  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2547  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.56 
 
 
346 aa  167  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0259  phosphate ABC transporter, permease protein  36.6 
 
 
548 aa  167  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.3 
 
 
289 aa  167  5e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.54 
 
 
288 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001264  phosphate transport system permease protein PstA  39.34 
 
 
287 aa  166  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2590  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstA  39.61 
 
 
281 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00589787  normal  0.413693 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05139  molybdate ABC transporter permease protein  39.34 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1791  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.61 
 
 
565 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0380745 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0067  phosphate ABC transporter, permease protein  38.84 
 
 
289 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.191661  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0703  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.55 
 
 
281 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2120  phosphate ABC transporter, permease protein  39.18 
 
 
284 aa  163  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0349  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.67 
 
 
288 aa  163  7e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000182732 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1304  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.93 
 
 
584 aa  161  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.637055 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0620  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  42.98 
 
 
274 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.363148  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.87 
 
 
556 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.731136  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0454  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.86 
 
 
294 aa  160  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3553  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.43 
 
 
522 aa  160  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3159  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  30.37 
 
 
532 aa  160  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0606  phosphate ABC transporter, permease protein  42.73 
 
 
274 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.32336  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5327  phosphate ABC transporter inner membrane protein  30.35 
 
 
556 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.401326  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5235  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  30.35 
 
 
556 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268129  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5374  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.18 
 
 
556 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.642346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5613  phosphate ABC transporter permease  32.18 
 
 
556 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0487  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.67 
 
 
288 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70830  phosphate ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 
558 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.666315 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01032  hypothetical protein  33.7 
 
 
557 aa  156  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004379  phosphate transport system permease protein PstA  33.33 
 
 
557 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6146  phosphate specific transporter transmembrane protein  31.21 
 
 
558 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4146  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.04 
 
 
304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21610  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  47.5 
 
 
200 aa  154  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2583  phosphate ABC transporter permease  35.23 
 
 
552 aa  154  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.129477  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.15 
 
 
284 aa  153  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0657  ABC-type phosphate transport system, permease component  37.31 
 
 
532 aa  153  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.667392  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4004  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  40.8 
 
 
304 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.757198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0420  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.46 
 
 
304 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.865104 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.74 
 
 
283 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0422  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.05 
 
 
295 aa  153  7e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.4 
 
 
304 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.85 
 
 
552 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446083  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1534  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.47 
 
 
552 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.814496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2817  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.47 
 
 
552 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1567  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.47 
 
 
552 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235566  normal  0.31699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.98 
 
 
552 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2626  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.98 
 
 
552 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157698  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2733  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.98 
 
 
552 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2832  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.82 
 
 
294 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1435  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  30.05 
 
 
552 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2453  phosphate import protein, transmembrane component PstA  27.8 
 
 
509 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3999  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.04 
 
 
416 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1358  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.6 
 
 
553 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.221857  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  36.61 
 
 
278 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.13 
 
 
424 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.740309  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_148  phosphate ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 
283 aa  150  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.86 
 
 
297 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.39 
 
 
283 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0620  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.81 
 
 
530 aa  150  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2744  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.98 
 
 
550 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0855633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4580  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.96 
 
 
294 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  0.447387 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1724  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  34.72 
 
 
552 aa  149  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3753  phosphate ABC transporter, permease protein  30.13 
 
 
430 aa  149  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1502  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.98 
 
 
550 aa  149  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125389  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3641  phosphate ABC transporter, permease protein  32.37 
 
 
545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3167  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.6 
 
 
550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0911  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.86 
 
 
818 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330088  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0181  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.47 
 
 
558 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1699  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.22 
 
 
550 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.934676 
 
 
-
 
NC_002936  DET0140  phosphate ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
283 aa  147  6e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1603  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.39 
 
 
291 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0162233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0587  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.66 
 
 
419 aa  146  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.286112 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1409  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  33.84 
 
 
550 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650343  normal  0.0594948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0396  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.8 
 
 
430 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.880767  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4415  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.83 
 
 
570 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0704042  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>