More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2832 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2832  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
294 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0606  phosphate ABC transporter, permease protein  47.5 
 
 
274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.32336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0620  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  47.5 
 
 
274 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.363148  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0067  phosphate ABC transporter, permease protein  43.73 
 
 
289 aa  240  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.191661  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28120  phosphate ABC transporter membrane protein  51.56 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05139  molybdate ABC transporter permease protein  43.05 
 
 
287 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  45.77 
 
 
278 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2590  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstA  46.64 
 
 
281 aa  236  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00589787  normal  0.413693 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001264  phosphate transport system permease protein PstA  42.37 
 
 
287 aa  234  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2120  phosphate ABC transporter, permease protein  44.6 
 
 
284 aa  230  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.79 
 
 
283 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2104  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.86 
 
 
282 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0454  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.04 
 
 
294 aa  216  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1163  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.55 
 
 
280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0140  phosphate ABC transporter, permease protein  44.18 
 
 
283 aa  208  8e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1095  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.13 
 
 
282 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_148  phosphate ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 
283 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.44 
 
 
283 aa  205  6e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1669  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.62 
 
 
278 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1603  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.86 
 
 
291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0162233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.01 
 
 
284 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.8 
 
 
284 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.12 
 
 
288 aa  185  6e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0349  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.19 
 
 
288 aa  185  8e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000182732 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1958  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.24 
 
 
287 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0763  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.21 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.763641  normal  0.179278 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1953  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.43 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.22501  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.86 
 
 
604 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  40.15 
 
 
627 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1060  phosphate ABC transporter permease  37.54 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0487  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.8 
 
 
288 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1964  phosphate ABC transporter, permease protein  39.19 
 
 
292 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.75 
 
 
645 aa  176  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1993  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.5 
 
 
295 aa  175  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.07 
 
 
294 aa  172  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1377  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.65 
 
 
270 aa  172  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176933  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0549  ABC-type phosphate transport system, permease component  35.61 
 
 
296 aa  172  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00903188  hitchhiker  2.03288e-22 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0222  phosphate ABC transporter, permease protein  37.45 
 
 
478 aa  172  5.999999999999999e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.017754  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1008  ABC-type phosphate transport system, permease component  38.39 
 
 
294 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  44.29 
 
 
649 aa  172  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2394  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.31 
 
 
304 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.45 
 
 
293 aa  170  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0019112  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1879  ABC-type phosphate transport system, permease component  35.74 
 
 
297 aa  169  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.68 
 
 
290 aa  169  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0154936  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4078  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.85 
 
 
293 aa  168  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.89 
 
 
297 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4580  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.44 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  0.447387 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0591  ABC-type phosphate transport system, permease component  32.63 
 
 
294 aa  166  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0564  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.33 
 
 
306 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000405763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.93 
 
 
280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2839  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.28 
 
 
596 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2888  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.85 
 
 
288 aa  165  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.107723 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1780  phosphate ABC transporter, permease protein  44.2 
 
 
307 aa  165  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4585  putative phosphate ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 
306 aa  165  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.206846 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0990  phosphate ABC transporter, permease protein PstA, putative  31.74 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.164904  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.15 
 
 
289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.34 
 
 
322 aa  163  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0113  phosphate ABC transporter permease  33.11 
 
 
310 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.38 
 
 
284 aa  162  6e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0752  putative phosphate ABC transporter, permease protein  37.3 
 
 
306 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0772  putative phosphate ABC transporter, permease protein  36.89 
 
 
306 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000179508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0786  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  36.89 
 
 
306 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0683  phosphate ABC transporter permease  36.89 
 
 
306 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0627  phosphate ABC transporter, permease  36.89 
 
 
306 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0627  phosphate ABC transporter, permease  36.89 
 
 
306 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0846  putative phosphate ABC transporter, permease protein  36.89 
 
 
306 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.252754  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0717  phosphate ABC transporter permease  36.89 
 
 
306 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0633  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.45 
 
 
306 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.454449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0177  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.14 
 
 
307 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0750  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  35.4 
 
 
286 aa  158  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000021979  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0422  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.68 
 
 
295 aa  157  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1680  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.25 
 
 
448 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.158794  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0558  ABC-type phosphate transport system, permease component  32.4 
 
 
298 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0981  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.6 
 
 
305 aa  156  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0889131 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0582  phosphate ABC transporter permease  35.79 
 
 
277 aa  156  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3553  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.91 
 
 
522 aa  156  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0605  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.5 
 
 
305 aa  155  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1243  phosphate ABC transporter permease  46.55 
 
 
448 aa  155  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.352421  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.12 
 
 
646 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4494  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.47 
 
 
312 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0945  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.38 
 
 
449 aa  153  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0911  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.8 
 
 
818 aa  151  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330088  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.63 
 
 
281 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1040  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.82 
 
 
448 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221125  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1618  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.69 
 
 
448 aa  150  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1235  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.25 
 
 
448 aa  149  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0047  phosphate ABC transporter permease  38.46 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.519128  normal  0.369042 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1477  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.27 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.508211  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2442  phosphate ABC transporter permease  37.28 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.666961  hitchhiker  0.00775863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  36.18 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1448  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.27 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2418  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.31 
 
 
940 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.420057  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2547  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.98 
 
 
346 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1791  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35 
 
 
565 aa  144  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0380745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3424  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.07 
 
 
309 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1251  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.21 
 
 
295 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.181488  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4328  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.5 
 
 
447 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33696  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0492  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.79 
 
 
337 aa  143  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0958  phosphate ABC transporter, permease protein  36.71 
 
 
301 aa  142  9e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3564  phosphate ABC transporter permease  32.32 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>