More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1879 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1879  ABC-type phosphate transport system, permease component  100 
 
 
297 aa  580  1e-164  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1008  ABC-type phosphate transport system, permease component  64.31 
 
 
294 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0990  phosphate ABC transporter, permease protein PstA, putative  63.67 
 
 
295 aa  375  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.164904  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0591  ABC-type phosphate transport system, permease component  61.95 
 
 
294 aa  364  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0558  ABC-type phosphate transport system, permease component  61.15 
 
 
298 aa  344  1e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0549  ABC-type phosphate transport system, permease component  58.72 
 
 
296 aa  343  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00903188  hitchhiker  2.03288e-22 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.44 
 
 
293 aa  304  9.000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0019112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4585  putative phosphate ABC transporter, permease protein  52.04 
 
 
306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.206846 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1993  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.65 
 
 
295 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0113  phosphate ABC transporter permease  46.84 
 
 
310 aa  281  8.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0633  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.38 
 
 
306 aa  278  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.454449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1953  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.67 
 
 
294 aa  277  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.22501  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0177  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50 
 
 
307 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0454  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.19 
 
 
294 aa  275  6e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0683  phosphate ABC transporter permease  52.01 
 
 
306 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0627  phosphate ABC transporter, permease  52.01 
 
 
306 aa  275  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0627  phosphate ABC transporter, permease  52.01 
 
 
306 aa  275  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0717  phosphate ABC transporter permease  52.01 
 
 
306 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0846  putative phosphate ABC transporter, permease protein  52.01 
 
 
306 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.252754  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0772  putative phosphate ABC transporter, permease protein  52.01 
 
 
306 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000179508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0786  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  52.01 
 
 
306 aa  275  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0605  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.01 
 
 
305 aa  271  7e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0752  putative phosphate ABC transporter, permease protein  52.04 
 
 
306 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2394  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.67 
 
 
304 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1669  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.52 
 
 
278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331352  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2590  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstA  37.2 
 
 
281 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00589787  normal  0.413693 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2832  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.74 
 
 
294 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  37.85 
 
 
649 aa  168  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1603  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.38 
 
 
291 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0162233  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001264  phosphate transport system permease protein PstA  37.63 
 
 
287 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05139  molybdate ABC transporter permease protein  38.54 
 
 
287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2120  phosphate ABC transporter, permease protein  39.1 
 
 
284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2104  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.2 
 
 
282 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0140  phosphate ABC transporter, permease protein  38.64 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1163  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.71 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0067  phosphate ABC transporter, permease protein  37.85 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.191661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3505  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.12 
 
 
298 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0620  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  34.26 
 
 
274 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.363148  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0606  phosphate ABC transporter, permease protein  33.91 
 
 
274 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.32336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2839  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.52 
 
 
596 aa  161  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_148  phosphate ABC transporter, permease protein  39.92 
 
 
283 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.96 
 
 
604 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.92 
 
 
283 aa  159  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1095  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.13 
 
 
282 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1964  phosphate ABC transporter, permease protein  39.39 
 
 
292 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.81 
 
 
322 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl234  phosphate ABC transporter permease component  41.67 
 
 
715 aa  155  6e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.86 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.34 
 
 
284 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28120  phosphate ABC transporter membrane protein  38.89 
 
 
285 aa  151  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1377  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.28 
 
 
270 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176933  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0222  phosphate ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 
478 aa  151  2e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.017754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1780  phosphate ABC transporter, permease protein  39.19 
 
 
307 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.86 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.22 
 
 
645 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  33.67 
 
 
627 aa  144  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.07 
 
 
294 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.38 
 
 
284 aa  142  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1060  phosphate ABC transporter permease  35.9 
 
 
297 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0763  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.47 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.763641  normal  0.179278 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1509  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.15 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  37.6 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0349  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.31 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000182732 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1958  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.7 
 
 
287 aa  139  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2888  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.6 
 
 
288 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.107723 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0582  phosphate ABC transporter permease  32.76 
 
 
277 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0981  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.43 
 
 
305 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0889131 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.44 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.98 
 
 
646 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0750  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  33.67 
 
 
286 aa  136  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000021979  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2742  phosphate ABC transporter permease  34.01 
 
 
361 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00664487  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0564  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.42 
 
 
306 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000405763  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0945  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.3 
 
 
449 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4580  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.94 
 
 
294 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  0.447387 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.84 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4263  phosphate ABC transporter permease  33.78 
 
 
354 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21610  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  41.95 
 
 
200 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0487  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.88 
 
 
288 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0703  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.14 
 
 
281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1558  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.11 
 
 
276 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.64 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1680  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.25 
 
 
448 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.158794  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34 
 
 
290 aa  126  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0189  phosphate transport system permease  33.58 
 
 
731 aa  125  6e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.52 
 
 
292 aa  125  6e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06960  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  34.44 
 
 
383 aa  125  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  30.59 
 
 
298 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00541  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  37.74 
 
 
289 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.175645  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2418  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.7 
 
 
940 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.420057  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1284  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.82 
 
 
287 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.54 
 
 
290 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0154936  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1348  ABC transporter phosphate permease  37.82 
 
 
287 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.607986  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3553  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.47 
 
 
522 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0911  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.05 
 
 
818 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330088  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1930  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.18 
 
 
282 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.19172  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0484  phosphate ABC transporter, permease, putative  39.57 
 
 
696 aa  124  2e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0317247  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.61 
 
 
270 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1917  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.77 
 
 
289 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  30.3 
 
 
289 aa  124  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>