More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1827 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
297 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.9 
 
 
284 aa  302  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3637  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53 
 
 
311 aa  301  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.103396  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1097  phosphate ABC transporter, permease protein  52.13 
 
 
306 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2442  phosphate ABC transporter permease  55.48 
 
 
303 aa  288  9e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.666961  hitchhiker  0.00775863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1251  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.48 
 
 
295 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.181488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.54 
 
 
424 aa  276  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.740309  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1656  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.72 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0587  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.15 
 
 
419 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.286112 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4078  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.62 
 
 
293 aa  270  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1477  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.12 
 
 
305 aa  269  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.508211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1448  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.12 
 
 
305 aa  269  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4580  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54 
 
 
294 aa  268  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  0.447387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.84 
 
 
307 aa  267  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.389648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0850  phosphate ABC transporter, permease protein  47.22 
 
 
288 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4386  phosphate ABC transporter, permease protein  47.74 
 
 
288 aa  265  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.446606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2998  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.72 
 
 
288 aa  265  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4123  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.08 
 
 
288 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1051  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.04 
 
 
311 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.0000167786 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4172  phosphate ABC transporter permease  47.74 
 
 
288 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4494  phosphate ABC transporter permease  47.74 
 
 
288 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4010  phosphate ABC transporter, permease  47.74 
 
 
288 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4020  phosphate ABC transporter, permease  47.74 
 
 
288 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  47.39 
 
 
288 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1022  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.69 
 
 
311 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1087  phosphate ABC transporter permease  49.66 
 
 
310 aa  259  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3564  phosphate ABC transporter permease  51.28 
 
 
312 aa  258  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4350  phosphate ABC transporter, permease protein  47.74 
 
 
288 aa  258  8e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4403  phosphate ABC transporter, permease protein  47.74 
 
 
288 aa  258  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3999  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.76 
 
 
416 aa  257  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3954  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.87 
 
 
311 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.131574  normal  0.595733 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.44 
 
 
339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.183597  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0958  phosphate ABC transporter, permease protein  48.58 
 
 
301 aa  252  5.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4494  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.97 
 
 
312 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0047  phosphate ABC transporter permease  46.3 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.519128  normal  0.369042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0332  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.07 
 
 
307 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.880653  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0793  phosphate ABC transporter permease  49.3 
 
 
312 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1791  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.8 
 
 
565 aa  240  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0380745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0288  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46 
 
 
306 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00554507  normal  0.233786 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0492  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.44 
 
 
337 aa  238  6.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3316  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.79 
 
 
441 aa  237  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.234469  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0600  phosphate ABC transporter permease  49.15 
 
 
426 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889849  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1073  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  47.46 
 
 
434 aa  235  7e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2480  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.52 
 
 
296 aa  235  7e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0466  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.85 
 
 
390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0499  phosphate ABC transporter permease  50 
 
 
396 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.82 
 
 
588 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.569683  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0396  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.92 
 
 
430 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.880767  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4549  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.88 
 
 
433 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2681  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.42 
 
 
386 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232883  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0180  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.18 
 
 
440 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.407703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1535  phosphate transport system permease protein  46.12 
 
 
450 aa  226  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.55409  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4328  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.18 
 
 
447 aa  226  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33696  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0170  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.18 
 
 
440 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0769  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.26 
 
 
438 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00852875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2140  phosphate ABC transporter, permease protein  48.26 
 
 
436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2567  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.61 
 
 
389 aa  225  6e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2407  ABC phosphate transporter inner membrane protein, PstA-like protein  46.61 
 
 
451 aa  225  9e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0590236 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1478  phosphate ABC transporter permease  46.61 
 
 
388 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3820  phosphate ABC transporter, permease component  50.76 
 
 
290 aa  223  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1226  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  45.8 
 
 
430 aa  223  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.713602  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1233  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.76 
 
 
436 aa  222  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.542864 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2055  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  47.39 
 
 
436 aa  221  9e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175288  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3753  phosphate ABC transporter, permease protein  48.72 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3627  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.03 
 
 
424 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.091097  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1540  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.88 
 
 
432 aa  219  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502175  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0718  phosphate ABC transporter, permease protein PstA, putative  41.84 
 
 
362 aa  219  6e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0644  phosphate ABC transporter, permease protein PstA, putative  41.84 
 
 
362 aa  219  6e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3449  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.68 
 
 
587 aa  219  6e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0480  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50 
 
 
580 aa  217  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.274847  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1054  phosphate ABC transporter permease  41.84 
 
 
362 aa  217  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.26 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1921  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.32 
 
 
449 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.645495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2602  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstA  46.75 
 
 
449 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1260  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.75 
 
 
449 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0355  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.75 
 
 
540 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00446882  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2291  phosphate ABC transporter permease  43.82 
 
 
457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1857  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.64 
 
 
389 aa  212  5.999999999999999e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1260  phosphate ABC transporter permease  44.49 
 
 
455 aa  212  7e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.83 
 
 
440 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2360  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.34 
 
 
306 aa  210  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3119  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.03 
 
 
456 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.851285  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0378  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.74 
 
 
387 aa  206  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.706579  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0799  phosphate ABC transporter, permease protein  46.41 
 
 
362 aa  205  8e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.650299  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0491  phosphate ABC transporter permease protein  46.09 
 
 
445 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270109  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0824  phosphate ABC transporter permease  44.17 
 
 
418 aa  203  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8156  hitchhiker  0.00518788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.04 
 
 
280 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2278  phosphate ABC transporter permease  47.28 
 
 
428 aa  196  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.287967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0981  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.54 
 
 
305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0889131 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.91 
 
 
294 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0536  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.74 
 
 
421 aa  191  1e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.176666  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0492  putative phosphate ABC transporter, permease protein  42.15 
 
 
422 aa  190  2e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.68 
 
 
645 aa  188  9e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2888  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.91 
 
 
288 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.107723 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0703  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.57 
 
 
281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1060  phosphate ABC transporter permease  38.64 
 
 
297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.14 
 
 
604 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  37.5 
 
 
649 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0763  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.57 
 
 
309 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.763641  normal  0.179278 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.21 
 
 
284 aa  178  8e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>