More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0620 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0620  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  100 
 
 
274 aa  524  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.363148  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0606  phosphate ABC transporter, permease protein  98.54 
 
 
274 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.32336  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001264  phosphate transport system permease protein PstA  55.4 
 
 
287 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05139  molybdate ABC transporter permease protein  55.4 
 
 
287 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0067  phosphate ABC transporter, permease protein  56.12 
 
 
289 aa  297  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.191661  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2120  phosphate ABC transporter, permease protein  56.68 
 
 
284 aa  295  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2590  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstA  52.52 
 
 
281 aa  267  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00589787  normal  0.413693 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  50.91 
 
 
278 aa  262  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1163  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.1 
 
 
280 aa  258  6e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2104  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.47 
 
 
282 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.46 
 
 
283 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2832  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.5 
 
 
294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1669  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.13 
 
 
278 aa  240  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1603  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.36 
 
 
291 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0162233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1095  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.68 
 
 
282 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1377  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.6 
 
 
270 aa  229  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176933  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1958  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.98 
 
 
287 aa  227  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1964  phosphate ABC transporter, permease protein  44.74 
 
 
292 aa  222  6e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.53 
 
 
322 aa  209  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0454  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.76 
 
 
294 aa  209  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.27 
 
 
283 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0140  phosphate ABC transporter, permease protein  44.4 
 
 
283 aa  206  4e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_148  phosphate ABC transporter, permease protein  47.27 
 
 
283 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0349  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.29 
 
 
288 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000182732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1060  phosphate ABC transporter permease  42.24 
 
 
297 aa  202  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2839  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.38 
 
 
596 aa  202  6e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  46.04 
 
 
627 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0763  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.16 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.763641  normal  0.179278 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.94 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.34 
 
 
604 aa  194  9e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  43.48 
 
 
649 aa  193  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0487  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.58 
 
 
288 aa  192  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28120  phosphate ABC transporter membrane protein  42.91 
 
 
285 aa  192  7e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.93 
 
 
289 aa  190  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.43 
 
 
284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0564  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.95 
 
 
306 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000405763  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0582  phosphate ABC transporter permease  38.77 
 
 
277 aa  186  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.65 
 
 
294 aa  186  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2888  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.18 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.107723 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2394  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.93 
 
 
304 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0422  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.05 
 
 
295 aa  182  7e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1953  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.08 
 
 
294 aa  178  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.22501  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4585  putative phosphate ABC transporter, permease protein  36.11 
 
 
306 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.206846 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0990  phosphate ABC transporter, permease protein PstA, putative  35.99 
 
 
295 aa  175  7e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.164904  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.62 
 
 
645 aa  175  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl234  phosphate ABC transporter permease component  43.91 
 
 
715 aa  175  8e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1993  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.16 
 
 
295 aa  175  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0177  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.28 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1008  ABC-type phosphate transport system, permease component  37.5 
 
 
294 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.42 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.67 
 
 
646 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0752  putative phosphate ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
306 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.41 
 
 
280 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4580  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.31 
 
 
294 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  0.447387 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0846  putative phosphate ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
306 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.252754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0683  phosphate ABC transporter permease  38.46 
 
 
306 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0627  phosphate ABC transporter, permease  38.46 
 
 
306 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0627  phosphate ABC transporter, permease  38.46 
 
 
306 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0717  phosphate ABC transporter permease  38.46 
 
 
306 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0772  putative phosphate ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
306 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000179508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0786  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  38.46 
 
 
306 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0633  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.08 
 
 
306 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.454449  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3293  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.06 
 
 
294 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2830  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.06 
 
 
294 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.824232 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.09 
 
 
284 aa  169  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4078  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.29 
 
 
293 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0605  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.41 
 
 
305 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0222  phosphate ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 
478 aa  166  2.9999999999999998e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.017754  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1448  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.96 
 
 
305 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1477  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.96 
 
 
305 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.508211  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0591  ABC-type phosphate transport system, permease component  35.29 
 
 
294 aa  166  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0750  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  38.35 
 
 
286 aa  165  9e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000021979  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4172  phosphate ABC transporter permease  38.67 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4123  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.35 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  38.67 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559042 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4494  phosphate ABC transporter permease  38.67 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4010  phosphate ABC transporter, permease  38.67 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4020  phosphate ABC transporter, permease  38.67 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2935  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  34.77 
 
 
297 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2998  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.49 
 
 
288 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1780  phosphate ABC transporter, permease protein  42.98 
 
 
307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4350  phosphate ABC transporter, permease protein  38.28 
 
 
288 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4403  phosphate ABC transporter, permease protein  38.28 
 
 
288 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0981  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.5 
 
 
305 aa  162  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0889131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0703  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.02 
 
 
281 aa  161  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.37 
 
 
283 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1879  ABC-type phosphate transport system, permease component  34.26 
 
 
297 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0113  phosphate ABC transporter permease  33 
 
 
310 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1040  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.98 
 
 
448 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0945  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.86 
 
 
449 aa  159  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.29 
 
 
297 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.76 
 
 
424 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.740309  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.69 
 
 
290 aa  158  9e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0154936  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.55 
 
 
281 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.6 
 
 
293 aa  157  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0019112  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1680  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.99 
 
 
448 aa  157  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.158794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3424  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.56 
 
 
309 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1251  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.63 
 
 
295 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.181488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8333  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  34.32 
 
 
291 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.13 
 
 
290 aa  156  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>