More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3424 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3424  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
309 aa  598  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31850  phosphate ABC transporter membrane protein  74.29 
 
 
365 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0660  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  78.55 
 
 
354 aa  401  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330308 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2080  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  72.5 
 
 
357 aa  399  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2962  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  63.7 
 
 
322 aa  352  4e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37640  phosphate ABC transporter membrane protein  66.2 
 
 
364 aa  341  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2742  phosphate ABC transporter permease  63.12 
 
 
361 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00664487  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  60.49 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2966  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  61.09 
 
 
317 aa  317  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4650  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  60.99 
 
 
362 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  58.93 
 
 
358 aa  301  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2935  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  56.33 
 
 
297 aa  295  7e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8333  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  57.35 
 
 
291 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25600  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  54.87 
 
 
388 aa  290  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0714898  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1070  phosphate ABC transporter permease  57.26 
 
 
332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0364  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.29 
 
 
370 aa  280  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0223  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  50.5 
 
 
345 aa  280  2e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0204  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.31 
 
 
369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06960  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  48.45 
 
 
383 aa  262  6e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0591  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.7 
 
 
299 aa  258  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3541  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50 
 
 
304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01630  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  53.05 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4263  phosphate ABC transporter permease  54.01 
 
 
354 aa  252  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  55.46 
 
 
694 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735974  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0354  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.47 
 
 
354 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0932568  normal  0.0141277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6819  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.79 
 
 
304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4517  phosphate ABC transporter permease  48.95 
 
 
300 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.95 
 
 
300 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4900  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.95 
 
 
300 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79916  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10948  phosphate-transport system integral membrane ABC transporter pstA1  49.31 
 
 
304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5090  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.7 
 
 
300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3924  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.7 
 
 
317 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1663  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.2 
 
 
300 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481341  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0873  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.54 
 
 
303 aa  225  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.501959  normal  0.143992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4979  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.5 
 
 
359 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.46 
 
 
298 aa  208  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  45.09 
 
 
291 aa  199  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2215  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  41.02 
 
 
306 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.136565 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5387  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.26 
 
 
303 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.85 
 
 
281 aa  189  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1268  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.46 
 
 
298 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2771  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.95 
 
 
297 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47464  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2183  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.43 
 
 
300 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2856  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.94 
 
 
298 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1850  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.01 
 
 
280 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1719  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.01 
 
 
280 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778995  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2165  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.51 
 
 
300 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0795993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1138  phosphate transport system permease protein 2  40.64 
 
 
281 aa  176  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.743483  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1620  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.59 
 
 
297 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.07 
 
 
280 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1487  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.59 
 
 
297 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1517  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.59 
 
 
297 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7662  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.99 
 
 
412 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0576  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.26 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1191  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.39 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403091  normal  0.235503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1179  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.39 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1293  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.26 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0575  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.26 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4445  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.74 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.16 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1516  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.16 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.313214  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0884  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.28 
 
 
298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0561416 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2018  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.09 
 
 
297 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1488  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.6 
 
 
293 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1273  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.54 
 
 
297 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0821  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.54 
 
 
297 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1302  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.54 
 
 
297 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.512627  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2370  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.6 
 
 
293 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.643879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2024  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.28 
 
 
294 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.433371  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4064  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.6 
 
 
296 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.517165  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0067  phosphate ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 
289 aa  168  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.191661  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2268  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.75 
 
 
299 aa  168  9e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4186  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.6 
 
 
296 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4136  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.6 
 
 
296 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03610  phosphate transporter subunit  38.95 
 
 
296 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3941  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.95 
 
 
296 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4237  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.95 
 
 
296 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2831  phosphate ABC transporter permease protein  40.36 
 
 
283 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0389706  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4243  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.6 
 
 
296 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1716  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.93 
 
 
294 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2703  phosphate ABC transporter permease  38.52 
 
 
279 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05139  molybdate ABC transporter permease protein  34.59 
 
 
287 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4268  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.95 
 
 
296 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4090  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.95 
 
 
296 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5155  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.95 
 
 
296 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.546708 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2590  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstA  37.07 
 
 
281 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00589787  normal  0.413693 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2204  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.57 
 
 
290 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03554  hypothetical protein  38.95 
 
 
296 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4139  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.46 
 
 
296 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4202  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.95 
 
 
296 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4080  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.6 
 
 
296 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0014  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.5 
 
 
293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252026  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1600  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.86 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4241  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.95 
 
 
296 aa  166  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1163  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.92 
 
 
280 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001264  phosphate transport system permease protein PstA  34.25 
 
 
287 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4916  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.7 
 
 
294 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.348017 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1438  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  40.43 
 
 
284 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.43 
 
 
284 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0383637  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2120  phosphate ABC transporter, permease protein  34.69 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>