More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2742 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2742  phosphate ABC transporter permease  100 
 
 
361 aa  703    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00664487  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  71.47 
 
 
359 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2962  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  66.55 
 
 
322 aa  365  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2966  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  64.29 
 
 
317 aa  341  9e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37640  phosphate ABC transporter membrane protein  60.43 
 
 
364 aa  338  7e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2080  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.11 
 
 
357 aa  338  7e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31850  phosphate ABC transporter membrane protein  64.54 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4650  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.74 
 
 
362 aa  332  8e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0364  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.82 
 
 
370 aa  330  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3424  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  63.12 
 
 
309 aa  329  6e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.9 
 
 
358 aa  322  6e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8333  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  59.14 
 
 
291 aa  316  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0204  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.27 
 
 
369 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0660  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  63.29 
 
 
354 aa  311  7.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2935  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  59.22 
 
 
297 aa  306  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25600  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  55.56 
 
 
388 aa  290  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0714898  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4263  phosphate ABC transporter permease  53.72 
 
 
354 aa  286  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0354  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  57.75 
 
 
354 aa  285  9e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0932568  normal  0.0141277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0591  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.29 
 
 
299 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06960  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  46.94 
 
 
383 aa  271  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01630  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  51.48 
 
 
367 aa  268  8e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6819  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.82 
 
 
304 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3541  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.11 
 
 
304 aa  257  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1070  phosphate ABC transporter permease  50.99 
 
 
332 aa  257  3e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4979  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53 
 
 
359 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0223  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  48.33 
 
 
345 aa  245  6.999999999999999e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5090  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10948  phosphate-transport system integral membrane ABC transporter pstA1  50 
 
 
304 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50 
 
 
694 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735974  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4900  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.47 
 
 
300 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79916  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4517  phosphate ABC transporter permease  49.47 
 
 
300 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.47 
 
 
300 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1663  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.29 
 
 
300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481341  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0873  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.17 
 
 
303 aa  232  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.501959  normal  0.143992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3924  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.92 
 
 
317 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  44.93 
 
 
291 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.55 
 
 
298 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2215  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  42.25 
 
 
306 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.136565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7662  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.84 
 
 
412 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5387  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.75 
 
 
303 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.18 
 
 
281 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2685  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.3 
 
 
301 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206864  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3271  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.3 
 
 
301 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176924  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0884  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.01 
 
 
298 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0561416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.22 
 
 
280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1138  phosphate transport system permease protein 2  38.08 
 
 
281 aa  167  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.743483  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.37 
 
 
280 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0576  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.52 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1516  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.37 
 
 
280 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.313214  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0916  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.09 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5424  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1293  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.52 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0575  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.52 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4445  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.77 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4202  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.18 
 
 
296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1268  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.13 
 
 
298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1620  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.16 
 
 
297 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1517  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.16 
 
 
297 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2856  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.35 
 
 
298 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0728  phosphate ABC transporter permease  38.33 
 
 
297 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1487  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.16 
 
 
297 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08651  putative phosphate ABC transporter  38.33 
 
 
297 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0581  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.14 
 
 
294 aa  162  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03610  phosphate transporter subunit  37.84 
 
 
296 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07761  putative phosphate ABC transporter  38.33 
 
 
297 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5182  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.28 
 
 
297 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1719  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.41 
 
 
280 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778995  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2771  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.98 
 
 
297 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1850  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.41 
 
 
280 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03554  hypothetical protein  37.84 
 
 
296 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0821  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.3 
 
 
297 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1273  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.3 
 
 
297 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.92 
 
 
295 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271806  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4268  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.84 
 
 
296 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3941  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.84 
 
 
296 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4237  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.84 
 
 
296 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1302  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.3 
 
 
297 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.512627  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5155  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.84 
 
 
296 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.546708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5254  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40 
 
 
297 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07761  putative phosphate ABC transporter  37.98 
 
 
297 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.315399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4090  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.84 
 
 
296 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6688  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.63 
 
 
304 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4136  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.3 
 
 
296 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1179  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.6 
 
 
297 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4064  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.3 
 
 
296 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.517165  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4186  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.3 
 
 
296 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4241  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.84 
 
 
296 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1191  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.6 
 
 
297 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403091  normal  0.235503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4715  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.29 
 
 
279 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.412253 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4080  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.3 
 
 
296 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4243  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.3 
 
 
296 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1795  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.99 
 
 
280 aa  159  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0203685  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2018  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.02 
 
 
297 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001264  phosphate transport system permease protein PstA  34.26 
 
 
287 aa  159  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1291  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.24 
 
 
284 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2812  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.99 
 
 
288 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1600  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40 
 
 
288 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4139  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.14 
 
 
296 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0310  phosphate ABC transporter permease  38.26 
 
 
304 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.557156  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05139  molybdate ABC transporter permease protein  33.91 
 
 
287 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09831  putative phosphate ABC transporter  38.26 
 
 
304 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.37508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>