More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06960 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_06960  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  100 
 
 
383 aa  761    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01630  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  49.44 
 
 
367 aa  310  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0364  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.56 
 
 
370 aa  301  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4650  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.83 
 
 
362 aa  296  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.56 
 
 
358 aa  286  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37640  phosphate ABC transporter membrane protein  47.37 
 
 
364 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0204  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.27 
 
 
369 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2742  phosphate ABC transporter permease  46.94 
 
 
361 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00664487  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2962  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.02 
 
 
322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2966  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.17 
 
 
317 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.16 
 
 
359 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3424  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.45 
 
 
309 aa  262  8e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31850  phosphate ABC transporter membrane protein  47.67 
 
 
365 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0223  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  48.89 
 
 
345 aa  253  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2935  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  47.71 
 
 
297 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1070  phosphate ABC transporter permease  49.68 
 
 
332 aa  250  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2080  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.99 
 
 
357 aa  250  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0660  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.56 
 
 
354 aa  249  7e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8333  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  45.72 
 
 
291 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25600  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  47.11 
 
 
388 aa  232  8.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0714898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6819  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.33 
 
 
304 aa  222  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4263  phosphate ABC transporter permease  43.13 
 
 
354 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3924  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.1 
 
 
317 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3541  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.12 
 
 
304 aa  208  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0591  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.63 
 
 
299 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0354  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.31 
 
 
354 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0932568  normal  0.0141277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4979  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.3 
 
 
359 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.52 
 
 
694 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735974  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  40.6 
 
 
291 aa  189  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4900  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.14 
 
 
300 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79916  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4517  phosphate ABC transporter permease  40.14 
 
 
300 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.14 
 
 
300 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5090  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.07 
 
 
300 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0873  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.47 
 
 
303 aa  175  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.501959  normal  0.143992 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10948  phosphate-transport system integral membrane ABC transporter pstA1  39.87 
 
 
304 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2370  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.99 
 
 
293 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.643879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1488  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.11 
 
 
293 aa  172  9e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.33 
 
 
281 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4445  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.46 
 
 
297 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1268  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.43 
 
 
298 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0884  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.43 
 
 
298 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0561416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1663  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.35 
 
 
300 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481341  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2215  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  39.48 
 
 
306 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.136565 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1273  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.11 
 
 
297 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0821  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.11 
 
 
297 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1302  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.11 
 
 
297 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.512627  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.2 
 
 
298 aa  169  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4916  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.64 
 
 
294 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.348017 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0581  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.86 
 
 
294 aa  169  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2254  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.74 
 
 
286 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1179  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.36 
 
 
297 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1191  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.73 
 
 
297 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403091  normal  0.235503 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2771  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.09 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47464  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2856  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.4 
 
 
298 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2018  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.18 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1620  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.33 
 
 
297 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2628  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.96 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1487  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.33 
 
 
297 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1517  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.33 
 
 
297 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0576  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.99 
 
 
297 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1293  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.99 
 
 
297 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0575  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.99 
 
 
297 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0014  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.76 
 
 
293 aa  162  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252026  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4202  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.79 
 
 
296 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1138  phosphate transport system permease protein 2  36.43 
 
 
281 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.743483  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08641  putative phosphate ABC transporter  40.52 
 
 
297 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2204  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.52 
 
 
290 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03610  phosphate transporter subunit  35.79 
 
 
296 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4241  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.79 
 
 
296 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4237  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.79 
 
 
296 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4268  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.79 
 
 
296 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5155  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.79 
 
 
296 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.546708 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3941  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.79 
 
 
296 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4090  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.79 
 
 
296 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03554  hypothetical protein  35.79 
 
 
296 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4136  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.05 
 
 
296 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4139  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.51 
 
 
296 aa  159  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4186  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.05 
 
 
296 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2812  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.44 
 
 
288 aa  159  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4064  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.05 
 
 
296 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.517165  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0743  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.15 
 
 
277 aa  159  7e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000430828  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1886  phosphate ABC transporter permease  41.63 
 
 
281 aa  159  7e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2268  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.37 
 
 
299 aa  159  8e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0406  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  35.93 
 
 
283 aa  159  9e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.914471  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4080  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.05 
 
 
296 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4243  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.05 
 
 
296 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2313  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.21 
 
 
294 aa  159  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4150  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.44 
 
 
340 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.28828  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1600  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.88 
 
 
288 aa  159  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7662  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.99 
 
 
412 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0310  phosphate ABC transporter permease  39.29 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.557156  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09831  putative phosphate ABC transporter  39.29 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1274  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.36 
 
 
294 aa  156  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1795  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.45 
 
 
280 aa  155  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0203685  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2183  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.27 
 
 
300 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1291  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.55 
 
 
284 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2165  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.55 
 
 
300 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0795993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4265  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.26 
 
 
295 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3145  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.84 
 
 
297 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2221  phosphate ABC transporter permease  37.91 
 
 
304 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.155385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>