More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4150 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4150  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
340 aa  669    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.28828  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  42.17 
 
 
291 aa  206  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.46 
 
 
281 aa  202  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.42 
 
 
280 aa  195  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.8 
 
 
280 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1516  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.8 
 
 
280 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.313214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1850  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.11 
 
 
280 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1719  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.11 
 
 
280 aa  192  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778995  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2520  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  40.37 
 
 
276 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1138  phosphate transport system permease protein 2  41.47 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.743483  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1291  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.55 
 
 
284 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1795  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.64 
 
 
280 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0203685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2703  phosphate ABC transporter permease  34.36 
 
 
279 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1600  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.83 
 
 
288 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2973  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  35.58 
 
 
293 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2018  phosphate transporter permease subunit PtsA  45.16 
 
 
297 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09831  putative phosphate ABC transporter  36.5 
 
 
304 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0310  phosphate ABC transporter permease  38.16 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.557156  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08641  putative phosphate ABC transporter  34.91 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4445  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.78 
 
 
297 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2771  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.75 
 
 
297 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1191  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.32 
 
 
297 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403091  normal  0.235503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1179  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.32 
 
 
297 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1517  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.29 
 
 
297 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1620  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.29 
 
 
297 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3293  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.33 
 
 
294 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2830  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.33 
 
 
294 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.824232 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1273  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.32 
 
 
297 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1487  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.29 
 
 
297 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0821  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.32 
 
 
297 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1302  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.32 
 
 
297 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.512627  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2204  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.07 
 
 
290 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1531  phosphate transporter permease subunit PtsA  33.75 
 
 
294 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0884  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.55 
 
 
298 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0561416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2806  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.12 
 
 
298 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.310536 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1886  phosphate ABC transporter permease  43.64 
 
 
281 aa  176  4e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0576  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.84 
 
 
297 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0199  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.66 
 
 
277 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.998664  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1293  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.84 
 
 
297 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0575  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.84 
 
 
297 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0581  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.26 
 
 
294 aa  176  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2313  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.73 
 
 
294 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2479  phosphate ABC transporter permease  43.48 
 
 
293 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.721455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4243  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.27 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2254  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.81 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1268  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.15 
 
 
298 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4186  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.27 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4064  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.27 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.517165  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4136  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.27 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2628  phosphate transporter permease subunit PtsA  32.14 
 
 
294 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4080  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.27 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4139  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.73 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1274  phosphate transporter permease subunit PtsA  31.34 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1438  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  33.13 
 
 
284 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2856  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.7 
 
 
298 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1716  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.01 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.13 
 
 
284 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0383637  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03610  phosphate transporter subunit  42.2 
 
 
296 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2024  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.94 
 
 
294 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.433371  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03554  hypothetical protein  42.2 
 
 
296 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08651  putative phosphate ABC transporter  36.73 
 
 
297 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4237  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.2 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5155  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.2 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.546708 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3941  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.2 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4202  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.2 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4268  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.2 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4090  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.2 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2333  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  43.1 
 
 
293 aa  172  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0652  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.64 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.180662 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2165  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.27 
 
 
300 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0795993  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2183  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.27 
 
 
300 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0728  phosphate ABC transporter permease  36.02 
 
 
297 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0482  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  36.04 
 
 
310 aa  171  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4916  phosphate transporter permease subunit PtsA  31.71 
 
 
294 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.348017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0014  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.64 
 
 
293 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252026  normal  0.138563 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4241  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.2 
 
 
296 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1334  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.64 
 
 
285 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812024  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2811  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.31 
 
 
293 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.108044 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2268  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.29 
 
 
299 aa  170  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07761  putative phosphate ABC transporter  35.71 
 
 
297 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.315399  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3145  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.23 
 
 
297 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4263  phosphate ABC transporter permease  37.42 
 
 
354 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07761  putative phosphate ABC transporter  35.71 
 
 
297 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2658  phosphate ABC transporter inner membrane protein  34.23 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.249444  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4265  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.09 
 
 
295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0743  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.62 
 
 
277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000430828  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2166  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.23 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1488  phosphate transporter permease subunit PtsA  31.71 
 
 
293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2370  phosphate transporter permease subunit PtsA  31.71 
 
 
293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.643879 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1284  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.27 
 
 
287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4586  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.18 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2221  phosphate ABC transporter permease  43.78 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.155385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2357  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.2 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1348  ABC transporter phosphate permease  32.27 
 
 
287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.607986  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2812  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.67 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4001  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.56 
 
 
296 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15201  putative phosphate ABC transporter  40.74 
 
 
306 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4210  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.73 
 
 
295 aa  162  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4169  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.18 
 
 
295 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3104  phosphate ABC transporter permease  42.18 
 
 
294 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.354124  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>