More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2479 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2479  phosphate ABC transporter permease  100 
 
 
293 aa  567  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.721455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2333  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  86.69 
 
 
293 aa  481  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2357  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  68.73 
 
 
293 aa  357  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3293  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  62.46 
 
 
294 aa  330  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2830  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  62.46 
 
 
294 aa  330  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.824232 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2806  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  60.98 
 
 
298 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.310536 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  57.19 
 
 
295 aa  306  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271806  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1398  phosphate ABC transporter permease  49.65 
 
 
305 aa  266  2e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.5206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3145  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50 
 
 
297 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2658  phosphate ABC transporter inner membrane protein  49.66 
 
 
297 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.249444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2166  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.66 
 
 
297 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0310  phosphate ABC transporter permease  51.21 
 
 
304 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.557156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15201  putative phosphate ABC transporter  51.94 
 
 
306 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09831  putative phosphate ABC transporter  50.87 
 
 
304 aa  255  6e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2811  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.17 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.108044 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1090  phosphate ABC transporter permease  53.26 
 
 
304 aa  246  3e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2651  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.26 
 
 
304 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08641  putative phosphate ABC transporter  46.92 
 
 
297 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124061 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08651  putative phosphate ABC transporter  47.64 
 
 
297 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4514  phosphate ABC transporter permease  48.58 
 
 
293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0728  phosphate ABC transporter permease  46.76 
 
 
297 aa  231  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07761  putative phosphate ABC transporter  46.76 
 
 
297 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07761  putative phosphate ABC transporter  46.76 
 
 
297 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.315399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.09 
 
 
280 aa  226  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.73 
 
 
280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1516  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.73 
 
 
280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.313214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1719  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.01 
 
 
280 aa  219  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1850  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.01 
 
 
280 aa  218  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.57 
 
 
281 aa  218  7e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2703  phosphate ABC transporter permease  41.67 
 
 
279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1600  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.03 
 
 
288 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1291  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.24 
 
 
284 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2204  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.64 
 
 
290 aa  203  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.79 
 
 
284 aa  202  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0383637  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1438  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  40.79 
 
 
284 aa  202  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1795  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.09 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0203685  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  42.58 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1488  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.07 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4445  phosphate transporter permease subunit PtsA  45.28 
 
 
297 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2183  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.34 
 
 
300 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2370  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.65 
 
 
293 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.643879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4916  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.72 
 
 
294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.348017 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4202  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.22 
 
 
296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03610  phosphate transporter subunit  39.86 
 
 
296 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3941  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.22 
 
 
296 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4237  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.22 
 
 
296 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4268  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.22 
 
 
296 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4090  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.22 
 
 
296 aa  199  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1191  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.88 
 
 
297 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403091  normal  0.235503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5155  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.22 
 
 
296 aa  199  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.546708 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03554  hypothetical protein  39.86 
 
 
296 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1179  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.88 
 
 
297 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2165  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.73 
 
 
300 aa  198  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0795993  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0821  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.49 
 
 
297 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1302  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.49 
 
 
297 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.512627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1273  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.49 
 
 
297 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2628  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.86 
 
 
294 aa  198  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4243  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.65 
 
 
296 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4241  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.22 
 
 
296 aa  198  9e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4064  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.65 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.517165  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4136  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.65 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0581  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.64 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4080  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.65 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2973  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  40.66 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4186  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.65 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2018  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.39 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1886  phosphate ABC transporter permease  38.89 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2254  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.57 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4139  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.57 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1334  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.15 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812024  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0014  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.13 
 
 
293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252026  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7426  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.49 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.506201  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1531  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.73 
 
 
294 aa  195  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2342  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.69 
 
 
296 aa  195  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367427  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6688  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.61 
 
 
304 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4210  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.37 
 
 
295 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2856  phosphate transporter permease subunit PtsA  40 
 
 
298 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1716  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.3 
 
 
294 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3267  phosphate ABC transporter, permease protein  46.43 
 
 
290 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3104  phosphate ABC transporter permease  46.83 
 
 
294 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.354124  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2812  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.59 
 
 
288 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1268  phosphate transporter permease subunit PtsA  40 
 
 
298 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2024  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.88 
 
 
294 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.433371  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4001  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.13 
 
 
296 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1274  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.56 
 
 
294 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0743  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.71 
 
 
277 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000430828  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1138  phosphate transport system permease protein 2  41.15 
 
 
281 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.743483  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2313  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.45 
 
 
294 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2771  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.86 
 
 
297 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47464  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4265  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.13 
 
 
295 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5182  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.25 
 
 
297 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37640  phosphate ABC transporter membrane protein  42.76 
 
 
364 aa  186  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1620  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.73 
 
 
297 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4150  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.17 
 
 
340 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.28828  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1487  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.73 
 
 
297 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1517  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.73 
 
 
297 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3410  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.29 
 
 
279 aa  185  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0884  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.94 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0561416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4715  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.78 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.412253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5254  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.93 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>