More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1719 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1719  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
280 aa  553  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1850  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  99.29 
 
 
280 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  96.79 
 
 
280 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1516  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  80.94 
 
 
280 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.313214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  80.94 
 
 
280 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2703  phosphate ABC transporter permease  77.62 
 
 
279 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2973  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  53.52 
 
 
293 aa  287  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0014  phosphate transporter permease subunit PtsA  47.27 
 
 
293 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252026  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4139  phosphate transporter permease subunit PtsA  47.62 
 
 
296 aa  259  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1274  phosphate transporter permease subunit PtsA  49.8 
 
 
294 aa  260  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4186  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.89 
 
 
296 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4064  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.89 
 
 
296 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.517165  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4136  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.89 
 
 
296 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4916  phosphate transporter permease subunit PtsA  47.6 
 
 
294 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.348017 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4080  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.89 
 
 
296 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4243  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.89 
 
 
296 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3941  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.52 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4237  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.52 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4268  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.52 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5155  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.52 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.546708 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4202  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.52 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4090  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.52 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4586  phosphate transporter permease subunit PtsA  47.45 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03610  phosphate transporter subunit  46.52 
 
 
296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03554  hypothetical protein  46.52 
 
 
296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4265  phosphate transporter permease subunit PtsA  47.45 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2165  phosphate transporter permease subunit PtsA  52.46 
 
 
300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0795993  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4241  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.52 
 
 
296 aa  253  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4169  phosphate transporter permease subunit PtsA  47.45 
 
 
295 aa  252  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4195  phosphate transporter permease subunit PtsA  47.45 
 
 
295 aa  252  5.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.412756  normal  0.0222213 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4233  phosphate transporter permease subunit PtsA  47.45 
 
 
295 aa  252  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1334  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.92 
 
 
285 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812024  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4210  phosphate transporter permease subunit PtsA  47.45 
 
 
295 aa  252  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2812  phosphate transporter permease subunit PtsA  51.42 
 
 
288 aa  249  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0581  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.91 
 
 
294 aa  249  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2254  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.52 
 
 
286 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4001  phosphate transporter permease subunit PtsA  47.65 
 
 
296 aa  249  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2204  phosphate transporter permease subunit PtsA  47.25 
 
 
290 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2313  phosphate transporter permease subunit PtsA  52.4 
 
 
294 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1488  phosphate transporter permease subunit PtsA  47.08 
 
 
293 aa  248  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2183  phosphate transporter permease subunit PtsA  50.41 
 
 
300 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2370  phosphate transporter permease subunit PtsA  47.06 
 
 
293 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.643879 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1438  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  49.81 
 
 
284 aa  246  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.81 
 
 
284 aa  246  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0383637  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1138  phosphate transport system permease protein 2  49.28 
 
 
281 aa  246  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.743483  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2831  phosphate ABC transporter permease protein  47.39 
 
 
283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0389706  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2628  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.93 
 
 
294 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1600  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.64 
 
 
288 aa  244  8e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1620  phosphate transporter permease subunit PtsA  48.68 
 
 
297 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1487  phosphate transporter permease subunit PtsA  48.68 
 
 
297 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1517  phosphate transporter permease subunit PtsA  48.68 
 
 
297 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0576  phosphate transporter permease subunit PtsA  48.68 
 
 
297 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1293  phosphate transporter permease subunit PtsA  48.68 
 
 
297 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0575  phosphate transporter permease subunit PtsA  48.68 
 
 
297 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1531  phosphate transporter permease subunit PtsA  45.66 
 
 
294 aa  242  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2771  phosphate transporter permease subunit PtsA  48.68 
 
 
297 aa  242  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2018  phosphate transporter permease subunit PtsA  47.39 
 
 
297 aa  241  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4445  phosphate transporter permease subunit PtsA  47.21 
 
 
297 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1716  phosphate transporter permease subunit PtsA  48.99 
 
 
294 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0821  phosphate transporter permease subunit PtsA  50.62 
 
 
297 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1273  phosphate transporter permease subunit PtsA  50.62 
 
 
297 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1302  phosphate transporter permease subunit PtsA  50.62 
 
 
297 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.512627  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1191  phosphate transporter permease subunit PtsA  47.74 
 
 
297 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403091  normal  0.235503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1179  phosphate transporter permease subunit PtsA  50.21 
 
 
297 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2024  phosphate transporter permease subunit PtsA  46.13 
 
 
294 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.433371  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1268  phosphate transporter permease subunit PtsA  45.66 
 
 
298 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1291  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50 
 
 
284 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0199  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.6 
 
 
277 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.998664  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0884  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.91 
 
 
298 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0561416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2856  phosphate transporter permease subunit PtsA  45.66 
 
 
298 aa  235  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3410  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.72 
 
 
279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.45 
 
 
281 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6688  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.82 
 
 
304 aa  232  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1309  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.02 
 
 
287 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1795  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.7 
 
 
280 aa  229  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0203685  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1886  phosphate ABC transporter permease  41.28 
 
 
281 aa  229  3e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1988  high-affinity phosphate ABC transporter membrane protein  47.62 
 
 
291 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7426  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.82 
 
 
312 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.506201  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2342  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.93 
 
 
296 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367427  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1284  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.44 
 
 
287 aa  224  9e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1348  ABC transporter phosphate permease  50.44 
 
 
287 aa  224  9e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.607986  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3267  phosphate ABC transporter, permease protein  45.77 
 
 
290 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3104  phosphate ABC transporter permease  44.53 
 
 
294 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.354124  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4921  phosphate ABC transporter permease  44.16 
 
 
300 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.50457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3271  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.67 
 
 
301 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176924  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2685  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.67 
 
 
301 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206864  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0743  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.2 
 
 
277 aa  223  4e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000430828  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0778  phosphate ABC transporter permease  43.8 
 
 
281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00541  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  45.67 
 
 
289 aa  222  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.175645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2357  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.24 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0508  phosphate transport system permease protein 2  46.83 
 
 
281 aa  220  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.782199 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0651  phosphate ABC transporter permease  49.82 
 
 
289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0717211  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  44.2 
 
 
291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0637  phosphate ABC transporter permease  46.83 
 
 
281 aa  218  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2830  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.19 
 
 
294 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.824232 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3293  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.19 
 
 
294 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2520  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  45.65 
 
 
276 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5254  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.8 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5182  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.12 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4715  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.12 
 
 
279 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.412253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>