More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2166 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2658  phosphate ABC transporter inner membrane protein  99.66 
 
 
297 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.249444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2166  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
297 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3145  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  99.33 
 
 
297 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2651  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  64.91 
 
 
304 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2357  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.46 
 
 
293 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2333  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  50.53 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2479  phosphate ABC transporter permease  49.66 
 
 
293 aa  251  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.721455 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3293  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.13 
 
 
294 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2830  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.13 
 
 
294 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.824232 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2811  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.55 
 
 
293 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.108044 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15201  putative phosphate ABC transporter  45.27 
 
 
306 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0310  phosphate ABC transporter permease  43.6 
 
 
304 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.557156  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09831  putative phosphate ABC transporter  43.25 
 
 
304 aa  221  8e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08641  putative phosphate ABC transporter  43 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2806  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.85 
 
 
298 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.310536 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.24 
 
 
295 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271806  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4514  phosphate ABC transporter permease  43.48 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1398  phosphate ABC transporter permease  46.83 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.5206 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0728  phosphate ABC transporter permease  44.52 
 
 
297 aa  208  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07761  putative phosphate ABC transporter  44.17 
 
 
297 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.315399  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07761  putative phosphate ABC transporter  44.17 
 
 
297 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08651  putative phosphate ABC transporter  43.82 
 
 
297 aa  205  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1516  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.44 
 
 
280 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.313214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.44 
 
 
280 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.64 
 
 
280 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1090  phosphate ABC transporter permease  44.6 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1850  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.47 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.29 
 
 
281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1719  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.47 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778995  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4237  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.8 
 
 
296 aa  195  9e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5155  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.8 
 
 
296 aa  195  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.546708 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3941  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.8 
 
 
296 aa  195  9e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4268  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.8 
 
 
296 aa  195  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4090  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.8 
 
 
296 aa  195  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03610  phosphate transporter subunit  39.8 
 
 
296 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4241  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.13 
 
 
296 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03554  hypothetical protein  39.8 
 
 
296 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4202  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.8 
 
 
296 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2703  phosphate ABC transporter permease  37.91 
 
 
279 aa  193  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4136  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.52 
 
 
296 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4186  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.52 
 
 
296 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4064  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.52 
 
 
296 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.517165  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4080  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.52 
 
 
296 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4243  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.52 
 
 
296 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0014  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.58 
 
 
293 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252026  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4139  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.62 
 
 
296 aa  192  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1268  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.77 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7426  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.44 
 
 
312 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.506201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2935  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  38.13 
 
 
297 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2165  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.97 
 
 
300 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0795993  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0743  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.99 
 
 
277 aa  187  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000430828  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2342  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.79 
 
 
296 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367427  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1334  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.21 
 
 
285 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812024  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8333  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  36.36 
 
 
291 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2628  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.52 
 
 
294 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2856  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.57 
 
 
298 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6688  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.21 
 
 
304 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0199  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.97 
 
 
277 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.998664  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5182  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.72 
 
 
297 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1620  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.67 
 
 
297 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1517  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.67 
 
 
297 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1487  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.67 
 
 
297 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1274  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.18 
 
 
294 aa  185  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2771  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.01 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47464  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2183  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.17 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1600  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.94 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2018  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.67 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0581  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.16 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0576  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.32 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1293  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.32 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0575  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.32 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4445  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.29 
 
 
297 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4195  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.51 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.412756  normal  0.0222213 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4233  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.51 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  39.41 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1716  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.04 
 
 
294 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4169  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.51 
 
 
295 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1531  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.64 
 
 
294 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1488  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.01 
 
 
293 aa  182  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2024  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.43 
 
 
294 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.433371  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2254  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.39 
 
 
286 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4715  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.57 
 
 
279 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.412253 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1138  phosphate transport system permease protein 2  38.41 
 
 
281 aa  181  9.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.743483  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2370  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.01 
 
 
293 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.643879 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2812  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.31 
 
 
288 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2313  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.31 
 
 
294 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1191  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.24 
 
 
297 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403091  normal  0.235503 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1273  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.29 
 
 
297 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0821  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.29 
 
 
297 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37640  phosphate ABC transporter membrane protein  40.77 
 
 
364 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1179  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.24 
 
 
297 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0884  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.73 
 
 
298 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0561416 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1302  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.29 
 
 
297 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.512627  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1291  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.58 
 
 
284 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5254  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.06 
 
 
297 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4916  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.01 
 
 
294 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.348017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.02 
 
 
358 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4586  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.49 
 
 
295 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1886  phosphate ABC transporter permease  36.36 
 
 
281 aa  178  9e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4265  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.8 
 
 
295 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>