More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6819 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6819  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
304 aa  603  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4517  phosphate ABC transporter permease  63.73 
 
 
300 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  63.73 
 
 
300 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4900  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  63.73 
 
 
300 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79916  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5090  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  63.05 
 
 
300 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1663  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  64.07 
 
 
300 aa  339  4e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481341  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3541  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.96 
 
 
304 aa  331  9e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10948  phosphate-transport system integral membrane ABC transporter pstA1  57.58 
 
 
304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0873  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  58.12 
 
 
303 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.501959  normal  0.143992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3924  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.52 
 
 
317 aa  286  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2935  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  48.8 
 
 
297 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8333  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  47.89 
 
 
291 aa  279  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.72 
 
 
358 aa  271  7e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2742  phosphate ABC transporter permease  49.82 
 
 
361 aa  268  8e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00664487  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37640  phosphate ABC transporter membrane protein  50.34 
 
 
364 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.43 
 
 
359 aa  258  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0364  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.67 
 
 
370 aa  257  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31850  phosphate ABC transporter membrane protein  48.76 
 
 
365 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2962  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.28 
 
 
322 aa  251  8.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2080  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.02 
 
 
357 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4263  phosphate ABC transporter permease  47.02 
 
 
354 aa  246  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0204  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.51 
 
 
369 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0591  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.69 
 
 
299 aa  245  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2966  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.94 
 
 
317 aa  245  8e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3424  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.79 
 
 
309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.61 
 
 
694 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735974  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4979  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.83 
 
 
359 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0354  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.88 
 
 
354 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0932568  normal  0.0141277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0660  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.78 
 
 
354 aa  237  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4650  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.17 
 
 
362 aa  229  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06960  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  40.33 
 
 
383 aa  222  4.9999999999999996e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01630  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  43.45 
 
 
367 aa  219  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25600  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  43.13 
 
 
388 aa  215  5.9999999999999996e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0714898  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1070  phosphate ABC transporter permease  45.8 
 
 
332 aa  203  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0223  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  42.76 
 
 
345 aa  199  6e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  44.96 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2215  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  40.07 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.136565 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.03 
 
 
298 aa  189  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1138  phosphate transport system permease protein 2  40.07 
 
 
281 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.743483  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1600  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.88 
 
 
288 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.86 
 
 
281 aa  185  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1291  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.27 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1268  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.83 
 
 
298 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1348  ABC transporter phosphate permease  39.76 
 
 
287 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.607986  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1284  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.76 
 
 
287 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5387  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.73 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1488  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.15 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2370  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.64 
 
 
293 aa  172  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.643879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3145  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.79 
 
 
297 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2204  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.71 
 
 
290 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00541  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  38.95 
 
 
289 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.175645  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.04 
 
 
280 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001094  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2658  phosphate ABC transporter inner membrane protein  39.36 
 
 
297 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.249444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2166  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.36 
 
 
297 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1516  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.04 
 
 
280 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.313214  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1309  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.22 
 
 
287 aa  170  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2856  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.1 
 
 
298 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2812  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.82 
 
 
288 aa  169  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2628  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.76 
 
 
294 aa  169  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4139  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.41 
 
 
296 aa  168  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2268  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.11 
 
 
299 aa  168  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0581  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.37 
 
 
294 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0884  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.29 
 
 
298 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0561416 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4186  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.64 
 
 
296 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4064  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.64 
 
 
296 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.517165  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0199  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.64 
 
 
277 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.998664  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4136  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.64 
 
 
296 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03610  phosphate transporter subunit  37.41 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4090  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.41 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4268  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.41 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4445  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.38 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5155  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.41 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.546708 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4237  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.41 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03554  hypothetical protein  37.41 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3941  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.41 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4243  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.64 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1179  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.38 
 
 
297 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4202  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.41 
 
 
296 aa  166  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2018  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.11 
 
 
297 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4916  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.09 
 
 
294 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.348017 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4080  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.41 
 
 
296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2254  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.96 
 
 
286 aa  165  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7662  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.01 
 
 
412 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1620  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.11 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2771  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.85 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1293  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.11 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0576  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.11 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0575  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.11 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1487  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.11 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1517  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.11 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1191  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.01 
 
 
297 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403091  normal  0.235503 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4241  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.05 
 
 
296 aa  162  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4001  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.62 
 
 
296 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4210  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.15 
 
 
295 aa  162  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.18 
 
 
280 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1719  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.6 
 
 
280 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1850  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.6 
 
 
280 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0821  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.29 
 
 
297 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1273  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.29 
 
 
297 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1302  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.29 
 
 
297 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.512627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>