More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2080 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2080  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
357 aa  686    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31850  phosphate ABC transporter membrane protein  66.21 
 
 
365 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0660  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  67.44 
 
 
354 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3424  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  72.5 
 
 
309 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37640  phosphate ABC transporter membrane protein  59.13 
 
 
364 aa  352  7e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2962  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  61.43 
 
 
322 aa  344  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2742  phosphate ABC transporter permease  55.11 
 
 
361 aa  338  7e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00664487  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.14 
 
 
358 aa  337  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4650  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.14 
 
 
362 aa  335  5.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  58.86 
 
 
359 aa  326  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0364  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.49 
 
 
370 aa  322  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25600  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  54.18 
 
 
388 aa  301  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0714898  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0204  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.81 
 
 
369 aa  301  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2966  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  58.08 
 
 
317 aa  296  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1070  phosphate ABC transporter permease  53.67 
 
 
332 aa  272  8.000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8333  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  51.22 
 
 
291 aa  272  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4263  phosphate ABC transporter permease  51.84 
 
 
354 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2935  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  54.26 
 
 
297 aa  266  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0223  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  50.67 
 
 
345 aa  261  2e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01630  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  47.01 
 
 
367 aa  251  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06960  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  42.99 
 
 
383 aa  250  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0354  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.67 
 
 
354 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0932568  normal  0.0141277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6819  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.02 
 
 
304 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4979  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.78 
 
 
359 aa  245  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3541  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.13 
 
 
304 aa  242  6e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0591  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.63 
 
 
299 aa  232  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4517  phosphate ABC transporter permease  47.31 
 
 
300 aa  229  8e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.56 
 
 
694 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735974  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4900  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.31 
 
 
300 aa  229  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79916  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.31 
 
 
300 aa  229  8e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5090  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.24 
 
 
300 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10948  phosphate-transport system integral membrane ABC transporter pstA1  48.53 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1663  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.24 
 
 
300 aa  212  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481341  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0873  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.18 
 
 
303 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.501959  normal  0.143992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3924  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.32 
 
 
317 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2215  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  44.52 
 
 
306 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.136565 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5387  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.71 
 
 
303 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.58 
 
 
281 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.52 
 
 
298 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  43.8 
 
 
291 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7662  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.42 
 
 
412 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2590  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstA  36.17 
 
 
281 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00589787  normal  0.413693 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001264  phosphate transport system permease protein PstA  35.66 
 
 
287 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0067  phosphate ABC transporter, permease protein  35.27 
 
 
289 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.191661  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2831  phosphate ABC transporter permease protein  40.66 
 
 
283 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0389706  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05139  molybdate ABC transporter permease protein  35.66 
 
 
287 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2120  phosphate ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 
284 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2183  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.89 
 
 
300 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1138  phosphate transport system permease protein 2  37.63 
 
 
281 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.743483  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4064  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.11 
 
 
296 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.517165  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4445  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.81 
 
 
297 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4136  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.11 
 
 
296 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4186  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.11 
 
 
296 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4080  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.11 
 
 
296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4243  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.11 
 
 
296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1273  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.46 
 
 
297 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4150  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.34 
 
 
340 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.28828  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4139  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.99 
 
 
296 aa  153  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0576  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.93 
 
 
297 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0821  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.46 
 
 
297 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0575  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.93 
 
 
297 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1302  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.46 
 
 
297 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.512627  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1293  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.93 
 
 
297 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2771  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.21 
 
 
297 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1268  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.65 
 
 
298 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4202  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.77 
 
 
296 aa  152  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03610  phosphate transporter subunit  35.99 
 
 
296 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3941  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.99 
 
 
296 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4268  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.99 
 
 
296 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5155  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.99 
 
 
296 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.546708 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4237  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.99 
 
 
296 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4090  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.99 
 
 
296 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03554  hypothetical protein  35.99 
 
 
296 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0014  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.85 
 
 
293 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252026  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1620  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.57 
 
 
297 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1191  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.46 
 
 
297 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403091  normal  0.235503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4916  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.44 
 
 
294 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.348017 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1517  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.57 
 
 
297 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1487  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.57 
 
 
297 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2856  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.64 
 
 
298 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1179  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.46 
 
 
297 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6688  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.86 
 
 
304 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0916  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.15 
 
 
396 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5424  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4241  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.99 
 
 
296 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2685  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.98 
 
 
301 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206864  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3271  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.98 
 
 
301 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176924  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2370  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.53 
 
 
293 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.643879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3145  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.46 
 
 
297 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2342  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.25 
 
 
296 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367427  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1719  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.37 
 
 
280 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1850  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.37 
 
 
280 aa  150  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07761  putative phosphate ABC transporter  38.18 
 
 
297 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1531  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.76 
 
 
294 aa  149  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2658  phosphate ABC transporter inner membrane protein  38.46 
 
 
297 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.249444  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2165  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.18 
 
 
300 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0795993  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1600  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.44 
 
 
288 aa  149  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1488  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.93 
 
 
293 aa  149  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2166  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.46 
 
 
297 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0728  phosphate ABC transporter permease  37.29 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.76 
 
 
280 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>