More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0620 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0620  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
530 aa  1073    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3159  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  68.61 
 
 
532 aa  747    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0657  ABC-type phosphate transport system, permease component  57.33 
 
 
532 aa  597  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.667392  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.73 
 
 
556 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.731136  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5327  phosphate ABC transporter inner membrane protein  50.09 
 
 
556 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.401326  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5613  phosphate ABC transporter permease  48.63 
 
 
556 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5235  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.09 
 
 
556 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268129  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5374  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.73 
 
 
556 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.642346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70830  phosphate ABC transporter, permease protein  48.73 
 
 
558 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.666315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5039  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.18 
 
 
556 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6146  phosphate specific transporter transmembrane protein  48.73 
 
 
558 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5485  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  49.36 
 
 
557 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4415  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.21 
 
 
570 aa  488  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0704042  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2397  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  49.28 
 
 
550 aa  486  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.610678  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3641  phosphate ABC transporter, permease protein  46.55 
 
 
545 aa  481  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0181  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.53 
 
 
558 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48580  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  48.63 
 
 
556 aa  481  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1502  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.75 
 
 
550 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125389  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1534  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.57 
 
 
552 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.814496  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1358  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.44 
 
 
553 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.221857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1435  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.55 
 
 
552 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2817  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.2 
 
 
552 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2453  phosphate import protein, transmembrane component PstA  45.05 
 
 
509 aa  464  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3167  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.89 
 
 
550 aa  465  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1699  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.57 
 
 
550 aa  463  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.934676 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1567  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.2 
 
 
552 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235566  normal  0.31699 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.02 
 
 
552 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446083  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0259  phosphate ABC transporter, permease protein  44.89 
 
 
548 aa  457  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0538  phosphate ABC transporter permease  45.6 
 
 
548 aa  455  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2583  phosphate ABC transporter permease  45.13 
 
 
552 aa  456  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.129477  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.18 
 
 
552 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2626  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.18 
 
 
552 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157698  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2733  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.18 
 
 
552 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1136  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.11 
 
 
555 aa  455  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.479467  normal  0.87192 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1409  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  45.08 
 
 
550 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650343  normal  0.0594948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2744  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.46 
 
 
550 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0855633  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1724  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  44 
 
 
552 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0955  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.55 
 
 
555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.258386  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2651  phosphate ABC transporter, permease protein  46.72 
 
 
550 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004379  phosphate transport system permease protein PstA  44.22 
 
 
557 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01032  hypothetical protein  44.5 
 
 
557 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.12 
 
 
558 aa  432  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1304  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.46 
 
 
584 aa  434  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.637055 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3115  phosphate ABC transporter permease PstA  44.16 
 
 
570 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1229  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  44.16 
 
 
570 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1346  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.16 
 
 
570 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.21 
 
 
550 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1335  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44 
 
 
548 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2943  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.46 
 
 
548 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1238  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.49 
 
 
548 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.572534  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2670  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.9 
 
 
548 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3266  phosphate ABC transporter permease  41.63 
 
 
457 aa  343  5.999999999999999e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03150  phosphate ABC transporter, permease protein  47.88 
 
 
519 aa  318  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.28 
 
 
304 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0420  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.81 
 
 
304 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.865104 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4004  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  52.87 
 
 
304 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.757198  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4146  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.46 
 
 
304 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.8 
 
 
284 aa  191  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0981  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.28 
 
 
305 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0889131 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.82 
 
 
294 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1060  phosphate ABC transporter permease  41.57 
 
 
297 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.02 
 
 
284 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0750  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  39.45 
 
 
286 aa  180  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000021979  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2547  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.06 
 
 
346 aa  180  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0564  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.29 
 
 
306 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000405763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.85 
 
 
280 aa  173  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4580  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.55 
 
 
294 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  0.447387 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0763  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.17 
 
 
309 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.763641  normal  0.179278 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.53 
 
 
604 aa  171  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2888  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.16 
 
 
288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.107723 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  40.46 
 
 
649 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.02 
 
 
645 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1780  phosphate ABC transporter, permease protein  36.42 
 
 
307 aa  163  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.98 
 
 
297 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.27 
 
 
339 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.183597  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1163  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.23 
 
 
280 aa  158  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.8 
 
 
284 aa  156  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0945  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  30.51 
 
 
449 aa  156  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  37.02 
 
 
627 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1097  phosphate ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 
306 aa  154  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1791  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.35 
 
 
565 aa  154  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0380745 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1040  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.92 
 
 
448 aa  153  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221125  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4494  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.85 
 
 
312 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1095  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39 
 
 
282 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2681  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.6 
 
 
386 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4549  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.76 
 
 
433 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2442  phosphate ABC transporter permease  40.89 
 
 
303 aa  150  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.666961  hitchhiker  0.00775863 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1680  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.88 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.158794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1618  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.24 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0620  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  42.63 
 
 
274 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.363148  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1051  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.73 
 
 
311 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.0000167786 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.37 
 
 
646 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1930  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.72 
 
 
282 aa  147  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.19172  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1022  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.6 
 
 
311 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2104  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.02 
 
 
282 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.55 
 
 
424 aa  147  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.740309  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1251  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.86 
 
 
295 aa  146  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.181488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0606  phosphate ABC transporter, permease protein  42.11 
 
 
274 aa  146  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.32336  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.74 
 
 
307 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.389648  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1243  phosphate ABC transporter permease  39.69 
 
 
448 aa  146  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.352421  normal  0.824545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>