More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1346 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1238  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  60.18 
 
 
548 aa  648    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.572534  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1335  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  64.36 
 
 
548 aa  657    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1346  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
570 aa  1152    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2670  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  62.07 
 
 
548 aa  640    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3115  phosphate ABC transporter permease PstA  100 
 
 
570 aa  1152    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1229  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  100 
 
 
570 aa  1152    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  73.35 
 
 
550 aa  793    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2943  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  64.91 
 
 
548 aa  665    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1502  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.65 
 
 
550 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125389  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1534  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.55 
 
 
552 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.814496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1567  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.36 
 
 
552 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235566  normal  0.31699 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3641  phosphate ABC transporter, permease protein  53.47 
 
 
545 aa  596  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.18 
 
 
552 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446083  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3167  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.28 
 
 
550 aa  595  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2817  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.36 
 
 
552 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2744  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.92 
 
 
550 aa  589  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0855633  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.18 
 
 
552 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2626  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.63 
 
 
552 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157698  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1409  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  52.92 
 
 
550 aa  591  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650343  normal  0.0594948 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1435  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.45 
 
 
552 aa  587  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1699  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.92 
 
 
550 aa  585  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.934676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2733  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.45 
 
 
552 aa  588  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2583  phosphate ABC transporter permease  53.64 
 
 
552 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.129477  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1724  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  53.09 
 
 
552 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1358  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.36 
 
 
553 aa  579  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.221857  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0259  phosphate ABC transporter, permease protein  52.22 
 
 
548 aa  568  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.82 
 
 
556 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.731136  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5613  phosphate ABC transporter permease  50.46 
 
 
556 aa  554  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2397  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  53.1 
 
 
550 aa  549  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.610678  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0955  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.18 
 
 
555 aa  548  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.258386  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004379  phosphate transport system permease protein PstA  50.99 
 
 
557 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6146  phosphate specific transporter transmembrane protein  51.18 
 
 
558 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2453  phosphate import protein, transmembrane component PstA  51.09 
 
 
509 aa  536  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70830  phosphate ABC transporter, permease protein  51 
 
 
558 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.666315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5327  phosphate ABC transporter inner membrane protein  49.91 
 
 
556 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.401326  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01032  hypothetical protein  50.89 
 
 
557 aa  534  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5235  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.91 
 
 
556 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268129  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5374  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.09 
 
 
556 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.642346 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5485  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  50.64 
 
 
557 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48580  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  50.73 
 
 
556 aa  518  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4415  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.41 
 
 
570 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0704042  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5039  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.46 
 
 
556 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0181  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.54 
 
 
558 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2651  phosphate ABC transporter, permease protein  49.27 
 
 
550 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0538  phosphate ABC transporter permease  47.31 
 
 
548 aa  481  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1136  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.94 
 
 
555 aa  473  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.479467  normal  0.87192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3159  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.13 
 
 
532 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.2 
 
 
558 aa  445  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0620  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.16 
 
 
530 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0657  ABC-type phosphate transport system, permease component  43.68 
 
 
532 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.667392  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1304  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.04 
 
 
584 aa  381  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.637055 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03150  phosphate ABC transporter, permease protein  40.85 
 
 
519 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3266  phosphate ABC transporter permease  57.73 
 
 
457 aa  362  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4146  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.76 
 
 
304 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4004  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  50.76 
 
 
304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.757198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.38 
 
 
304 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0420  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50 
 
 
304 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.865104 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.31 
 
 
284 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.91 
 
 
280 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.13 
 
 
294 aa  194  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0981  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.13 
 
 
305 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0889131 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0564  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.37 
 
 
306 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000405763  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1060  phosphate ABC transporter permease  35.45 
 
 
297 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2888  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.67 
 
 
288 aa  176  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.107723 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  41.73 
 
 
649 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1780  phosphate ABC transporter, permease protein  42.22 
 
 
307 aa  171  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  39.47 
 
 
627 aa  168  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0763  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.88 
 
 
309 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.763641  normal  0.179278 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.72 
 
 
339 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.183597  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1097  phosphate ABC transporter, permease protein  38.03 
 
 
306 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37 
 
 
424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.740309  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.03 
 
 
604 aa  163  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.55 
 
 
284 aa  163  7e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4580  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.64 
 
 
294 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  0.447387 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0750  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  35.07 
 
 
286 aa  161  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000021979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0703  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.35 
 
 
281 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2547  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.53 
 
 
346 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0047  phosphate ABC transporter permease  42.67 
 
 
299 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.519128  normal  0.369042 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0945  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.75 
 
 
449 aa  159  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.47 
 
 
297 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1680  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  27.14 
 
 
448 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.158794  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.78 
 
 
645 aa  156  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1022  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.96 
 
 
311 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.83 
 
 
290 aa  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0154936  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1051  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.59 
 
 
311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.0000167786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0587  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.74 
 
 
419 aa  154  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.286112 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.91 
 
 
284 aa  153  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1040  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.85 
 
 
448 aa  151  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4549  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.11 
 
 
433 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3637  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.18 
 
 
311 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.103396  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.22 
 
 
588 aa  150  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.569683  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.41 
 
 
646 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3999  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.3 
 
 
416 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0499  phosphate ABC transporter permease  36.47 
 
 
396 aa  148  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4494  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.94 
 
 
312 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2442  phosphate ABC transporter permease  40.64 
 
 
303 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.666961  hitchhiker  0.00775863 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.17 
 
 
307 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.389648  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0170  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.21 
 
 
440 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1656  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.82 
 
 
306 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0180  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.54 
 
 
440 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.407703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>