242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3848 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3848  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  97.7 
 
 
287 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  97.7 
 
 
287 aa  169  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  97.7 
 
 
287 aa  169  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  96.55 
 
 
287 aa  168  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  90.8 
 
 
287 aa  159  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  90.8 
 
 
287 aa  159  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  88.51 
 
 
309 aa  159  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  89.66 
 
 
287 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  89.66 
 
 
287 aa  158  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  89.66 
 
 
287 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  89.66 
 
 
287 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  89.66 
 
 
287 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  88.51 
 
 
287 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  88.51 
 
 
287 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  88.51 
 
 
287 aa  157  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  87.36 
 
 
287 aa  155  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4572  hypothetical protein  89.66 
 
 
129 aa  152  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000166313 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  80.46 
 
 
287 aa  149  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  81.61 
 
 
287 aa  148  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  81.61 
 
 
288 aa  147  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  81.61 
 
 
288 aa  147  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  78.16 
 
 
288 aa  144  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  80.46 
 
 
287 aa  144  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  80.46 
 
 
287 aa  144  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  78.16 
 
 
287 aa  143  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  74.71 
 
 
287 aa  143  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  80.46 
 
 
287 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  80.46 
 
 
287 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  80.46 
 
 
287 aa  141  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  80.46 
 
 
287 aa  141  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  80.46 
 
 
287 aa  141  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3979  hypothetical protein  80.46 
 
 
287 aa  141  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.200033  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  80.46 
 
 
287 aa  141  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  75.86 
 
 
290 aa  141  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  80.46 
 
 
287 aa  141  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  80.46 
 
 
287 aa  141  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  79.31 
 
 
287 aa  140  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  80.46 
 
 
287 aa  140  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  79.31 
 
 
287 aa  140  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  79.31 
 
 
287 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  79.31 
 
 
287 aa  140  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03453  hypothetical protein  81.18 
 
 
285 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  77.01 
 
 
287 aa  137  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  77.01 
 
 
287 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  77.01 
 
 
287 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4015  hypothetical protein  77.01 
 
 
287 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4061  hypothetical protein  77.01 
 
 
287 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.879365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3934  hypothetical protein  77.01 
 
 
287 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.818058  hitchhiker  0.00001038 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  75.86 
 
 
287 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  72.41 
 
 
287 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  72.41 
 
 
287 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  72.41 
 
 
287 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  72.41 
 
 
287 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  71.26 
 
 
287 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  71.26 
 
 
287 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  71.26 
 
 
287 aa  129  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  71.26 
 
 
287 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  71.26 
 
 
287 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  70.11 
 
 
287 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  67.82 
 
 
287 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  71.76 
 
 
289 aa  123  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  70.11 
 
 
287 aa  122  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  70.11 
 
 
288 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  66.67 
 
 
287 aa  121  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  66.67 
 
 
287 aa  120  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  66.67 
 
 
287 aa  120  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  68.97 
 
 
289 aa  120  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0180  hypothetical protein  70.45 
 
 
288 aa  120  7e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02368  hypothetical protein  62.79 
 
 
282 aa  118  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  64.37 
 
 
288 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  62.79 
 
 
286 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  65.52 
 
 
288 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  65.52 
 
 
288 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  62.07 
 
 
297 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  66.67 
 
 
288 aa  115  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1781  hypothetical protein  62.07 
 
 
287 aa  115  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.843974  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0406  hypothetical protein  62.07 
 
 
287 aa  115  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.71757  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0844  hypothetical protein  59.77 
 
 
300 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0757  hypothetical protein  59.77 
 
 
300 aa  114  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  62.07 
 
 
288 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  63.53 
 
 
288 aa  114  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  64.37 
 
 
288 aa  114  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  59.77 
 
 
288 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1204  hypothetical protein  62.07 
 
 
295 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118666 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  61.63 
 
 
287 aa  111  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1534  hypothetical protein  63.1 
 
 
296 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0415329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3848  hypothetical protein  61.18 
 
 
288 aa  110  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2474  hypothetical protein  59.77 
 
 
311 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0758  hypothetical protein  57.47 
 
 
295 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1061  hypothetical protein  60.92 
 
 
295 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  58.62 
 
 
288 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0855  hypothetical protein  61.18 
 
 
311 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1267  hypothetical protein  57.65 
 
 
298 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2156  hypothetical protein  58.62 
 
 
311 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239599  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2277  hypothetical protein  58.62 
 
 
311 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268275  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1957  hypothetical protein  58.62 
 
 
311 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.330049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2441  hypothetical protein  57.47 
 
 
294 aa  107  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000733927 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  58.62 
 
 
302 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0575  hypothetical protein  55.17 
 
 
299 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>