More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0699 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  100 
 
 		 359 aa  741    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  70.88 
 
 		 358 aa  501  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4338  quinolinate synthetase  66.01 
 
 		 370 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.230361  normal  0.0900103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1247  quinolinate synthetase  67.06 
 
 		 370 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1229  quinolinate synthetase  65.99 
 
 		 370 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1107  quinolinate synthetase  63.92 
 
 		 370 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1434  quinolinate synthetase  61.28 
 
 		 343 aa  428  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582213  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  63.29 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  63.09 
 
 		 357 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  63.09 
 
 		 347 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4308  quinolinate synthetase  59.82 
 
 		 365 aa  418  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  62.07 
 
 		 327 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  60.36 
 
 		 343 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  61.25 
 
 		 327 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  62.03 
 
 		 357 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  62.58 
 
 		 324 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0791  quinolinate synthetase  59.16 
 
 		 369 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0295  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.28 
 
 		 345 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19682 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  63.46 
 
 		 323 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  61.89 
 
 		 307 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  61.02 
 
 		 323 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.39 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2250  quinolinate synthetase  55.59 
 
 		 351 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4432  quinolinate synthetase  55.89 
 
 		 350 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  60.76 
 
 		 333 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1429  quinolinate synthetase complex, A subunit  58.65 
 
 		 328 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1183  quinolinate synthetase complex, A subunit  58.28 
 
 		 347 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6033  quinolinate synthetase  61.54 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.452115 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7188  quinolinate synthetase  61.22 
 
 		 323 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.014878 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  62.67 
 
 		 323 aa  376  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1045  quinolinate synthetase  61.99 
 
 		 323 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.350076  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23170  quinolinate synthetase A  54.22 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1541  quinolinate synthetase complex, A subunit  58.06 
 
 		 326 aa  361  9e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.258054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  49.85 
 
 		 343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  49.55 
 
 		 343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  48.47 
 
 		 302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  47.8 
 
 		 302 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  47.46 
 
 		 302 aa  265  7e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.71 
 
 		 298 aa  260  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  44.67 
 
 		 304 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0785  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.43 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.77 
 
 		 301 aa  253  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.02 
 
 		 306 aa  252  7e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.44 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  44.71 
 
 		 303 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2010  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.05 
 
 		 349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.701511  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  45.11 
 
 		 326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  45.3 
 
 		 331 aa  245  6.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  43.34 
 
 		 304 aa  245  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  43.99 
 
 		 304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  43.34 
 
 		 304 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.11 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.61 
 
 		 304 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  42.37 
 
 		 304 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  40 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2965  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.93 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0419  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.82 
 
 		 344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.748276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10830  quinolinate synthetase  44.13 
 
 		 335 aa  239  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3085  quinolinate synthetase  43.87 
 
 		 337 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3068  quinolinate synthetase  43.87 
 
 		 337 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.736779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3128  quinolinate synthetase  43.87 
 
 		 337 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  40.33 
 
 		 310 aa  237  3e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  42.47 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  41.75 
 
 		 304 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.47 
 
 		 332 aa  236  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3619  quinolinate synthetase  43.24 
 
 		 347 aa  236  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5730  quinolinate synthetase  42.2 
 
 		 339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  42.62 
 
 		 306 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.34 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  40.26 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.42 
 
 		 303 aa  232  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  40 
 
 		 325 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  40 
 
 		 325 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.8 
 
 		 334 aa  232  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.16 
 
 		 303 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  43.83 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3166  quinolinate synthetase  45.13 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000173598  hitchhiker  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.72 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2798  quinolinate synthetase  43.75 
 
 		 347 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  39.34 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  39.27 
 
 		 328 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.2 
 
 		 317 aa  229  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  38.94 
 
 		 328 aa  229  8e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  37.05 
 
 		 333 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.2 
 
 		 331 aa  228  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  40.33 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.34 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0361  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.41 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.59 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  39.12 
 
 		 304 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11610  quinolinate synthetase  43.89 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.681965  normal  0.363525 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  40.52 
 
 		 308 aa  227  3e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  41.1 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  38.78 
 
 		 304 aa  225  8e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0394  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.72 
 
 		 332 aa  225  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  38.78 
 
 		 304 aa  225  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2202  quinolinate synthetase  41.24 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.189573  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  38.93 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3459  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.95 
 
 		 462 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  39.67 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>