More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5463 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  100 
 
 
338 aa  687    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  84.78 
 
 
357 aa  578  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  83.85 
 
 
347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  83.85 
 
 
357 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  78.01 
 
 
333 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  74.7 
 
 
333 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  72.59 
 
 
343 aa  499  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0295  quinolinate synthetase complex, A subunit  69.28 
 
 
345 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  74.68 
 
 
324 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  71.88 
 
 
327 aa  490  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  70.85 
 
 
327 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  72.06 
 
 
323 aa  467  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  69.5 
 
 
323 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  71.48 
 
 
307 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7188  quinolinate synthetase  71.11 
 
 
323 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.014878 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6033  quinolinate synthetase  70.48 
 
 
323 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.452115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1183  quinolinate synthetase complex, A subunit  69.65 
 
 
347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244907  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1429  quinolinate synthetase complex, A subunit  67.79 
 
 
328 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  71.62 
 
 
323 aa  440  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1045  quinolinate synthetase  71.28 
 
 
323 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.350076  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  66.23 
 
 
358 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  63.29 
 
 
359 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23170  quinolinate synthetase A  63.06 
 
 
375 aa  404  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1107  quinolinate synthetase  61.59 
 
 
370 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1229  quinolinate synthetase  59.7 
 
 
370 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4338  quinolinate synthetase  60.57 
 
 
370 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.230361  normal  0.0900103 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4432  quinolinate synthetase  57.01 
 
 
350 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558643  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1247  quinolinate synthetase  60.63 
 
 
370 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1434  quinolinate synthetase  60.63 
 
 
343 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582213  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0791  quinolinate synthetase  61.59 
 
 
369 aa  396  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4308  quinolinate synthetase  59.25 
 
 
365 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1541  quinolinate synthetase complex, A subunit  63.46 
 
 
326 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.258054  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2250  quinolinate synthetase  53.89 
 
 
351 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340783  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  50.15 
 
 
343 aa  329  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  50.61 
 
 
343 aa  325  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0785  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.23 
 
 
347 aa  279  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  44.26 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.95 
 
 
303 aa  271  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.97 
 
 
301 aa  269  4e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  45.92 
 
 
305 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  47.8 
 
 
302 aa  266  5e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  47.64 
 
 
304 aa  262  6e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  48.14 
 
 
302 aa  260  2e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0419  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.23 
 
 
344 aa  260  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.748276  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  44.93 
 
 
304 aa  258  9e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.92 
 
 
298 aa  256  5e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  44.52 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  46.78 
 
 
302 aa  253  3e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.48 
 
 
303 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  44.59 
 
 
304 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  44.19 
 
 
304 aa  252  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  45.81 
 
 
334 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  45.51 
 
 
334 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.24 
 
 
306 aa  249  7e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.88 
 
 
302 aa  248  8e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  46.71 
 
 
331 aa  248  9e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.67 
 
 
307 aa  248  9e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  45.51 
 
 
334 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  42.57 
 
 
303 aa  247  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.06 
 
 
304 aa  246  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  44.9 
 
 
304 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  45.61 
 
 
304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  42.95 
 
 
307 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.16 
 
 
332 aa  242  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  40.92 
 
 
323 aa  241  1e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.82 
 
 
304 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  43 
 
 
304 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.14 
 
 
324 aa  239  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  42.05 
 
 
322 aa  239  4e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3085  quinolinate synthetase  44.69 
 
 
337 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  42.03 
 
 
306 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  42.24 
 
 
310 aa  239  5e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3068  quinolinate synthetase  44.69 
 
 
337 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.736779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3128  quinolinate synthetase  44.69 
 
 
337 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3619  quinolinate synthetase  45.42 
 
 
347 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170829  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  41.36 
 
 
304 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  43.11 
 
 
334 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  45.42 
 
 
326 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0361  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.63 
 
 
295 aa  236  3e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  40.86 
 
 
325 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  40.86 
 
 
325 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  41 
 
 
334 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2353  quinolinate synthetase  44.97 
 
 
300 aa  236  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.48 
 
 
346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  44.65 
 
 
332 aa  236  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  41.02 
 
 
304 aa  235  9e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  41.44 
 
 
304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  40.46 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  40.54 
 
 
304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.81 
 
 
323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  41.56 
 
 
318 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  42.28 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  42.02 
 
 
322 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  38.94 
 
 
323 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0394  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.85 
 
 
332 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2965  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.99 
 
 
348 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  39.4 
 
 
308 aa  230  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5730  quinolinate synthetase  43.75 
 
 
339 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.86 
 
 
308 aa  229  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10830  quinolinate synthetase  43.87 
 
 
335 aa  229  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324254  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>