More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1004 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  100 
 
 
343 aa  712    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  93.29 
 
 
343 aa  667    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  52.54 
 
 
324 aa  342  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  51.17 
 
 
323 aa  341  9e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  54.66 
 
 
327 aa  341  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  51.75 
 
 
323 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0295  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.4 
 
 
345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19682 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  52.47 
 
 
327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.58 
 
 
357 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.7 
 
 
357 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  52.16 
 
 
307 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.26 
 
 
347 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.75 
 
 
333 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0791  quinolinate synthetase  50.75 
 
 
369 aa  327  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.29 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.71 
 
 
343 aa  326  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  53.23 
 
 
323 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.61 
 
 
338 aa  325  7e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4338  quinolinate synthetase  51.24 
 
 
370 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.230361  normal  0.0900103 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7188  quinolinate synthetase  53.87 
 
 
323 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.014878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1183  quinolinate synthetase complex, A subunit  50 
 
 
347 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244907  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4308  quinolinate synthetase  49.42 
 
 
365 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.1 
 
 
358 aa  323  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1045  quinolinate synthetase  52.9 
 
 
323 aa  323  4e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.350076  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6033  quinolinate synthetase  53.23 
 
 
323 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.452115 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  49.85 
 
 
359 aa  319  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1229  quinolinate synthetase  49.85 
 
 
370 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1429  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.7 
 
 
328 aa  317  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1247  quinolinate synthetase  49.4 
 
 
370 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1434  quinolinate synthetase  50.6 
 
 
343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582213  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1107  quinolinate synthetase  48.8 
 
 
370 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2250  quinolinate synthetase  47.49 
 
 
351 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340783  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4432  quinolinate synthetase  44.91 
 
 
350 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558643  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1541  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.09 
 
 
326 aa  289  4e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.258054  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23170  quinolinate synthetase A  45.88 
 
 
375 aa  288  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0785  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.51 
 
 
347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.3 
 
 
301 aa  272  7e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  43.89 
 
 
302 aa  261  1e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  46.15 
 
 
304 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  43.89 
 
 
302 aa  258  7e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.48 
 
 
302 aa  258  9e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  44.03 
 
 
304 aa  258  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.95 
 
 
304 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  43.57 
 
 
304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  42.95 
 
 
302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  43.81 
 
 
304 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  42.72 
 
 
305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.91 
 
 
306 aa  251  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  39.94 
 
 
307 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  43.79 
 
 
331 aa  245  6e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  43.17 
 
 
304 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  42.63 
 
 
306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  45.87 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  43.91 
 
 
304 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.38 
 
 
303 aa  242  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.69 
 
 
331 aa  240  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  40.29 
 
 
325 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  41.99 
 
 
304 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  41.56 
 
 
306 aa  238  9e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  41.88 
 
 
304 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  40 
 
 
325 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  41.51 
 
 
303 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.49 
 
 
330 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  40.44 
 
 
323 aa  237  2e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.03 
 
 
323 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.98 
 
 
317 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  42.31 
 
 
306 aa  238  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  43.31 
 
 
332 aa  236  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.96 
 
 
303 aa  236  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2965  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.55 
 
 
348 aa  236  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.38 
 
 
329 aa  235  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1975  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.75 
 
 
311 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.1 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  40.68 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  39.18 
 
 
304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  40.82 
 
 
304 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.64 
 
 
332 aa  233  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.85 
 
 
324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  40.88 
 
 
323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.7 
 
 
334 aa  232  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  39.2 
 
 
333 aa  232  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.18 
 
 
338 aa  232  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.12 
 
 
308 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0394  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.2 
 
 
332 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  39.6 
 
 
323 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  40.44 
 
 
304 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  39.29 
 
 
328 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  41.18 
 
 
322 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  39.64 
 
 
318 aa  229  5e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  40.13 
 
 
304 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.88 
 
 
322 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0361  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.82 
 
 
295 aa  228  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.31 
 
 
304 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.71 
 
 
346 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  38.99 
 
 
328 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  40.62 
 
 
308 aa  226  4e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  40.68 
 
 
334 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  39.81 
 
 
304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5730  quinolinate synthetase  43.56 
 
 
339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.32 
 
 
303 aa  225  8e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>