More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2767 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  95.39 
 
 
347 aa  679    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  95.52 
 
 
357 aa  697    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  100 
 
 
357 aa  726    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  84.78 
 
 
338 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  77.11 
 
 
333 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  74.54 
 
 
333 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  68.79 
 
 
343 aa  487  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  72.47 
 
 
324 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  72.7 
 
 
323 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0295  quinolinate synthetase complex, A subunit  70.35 
 
 
345 aa  479  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19682 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  70 
 
 
327 aa  478  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  68.65 
 
 
327 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  69.18 
 
 
323 aa  461  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  70.36 
 
 
307 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1183  quinolinate synthetase complex, A subunit  65.12 
 
 
347 aa  455  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244907  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6033  quinolinate synthetase  69.21 
 
 
323 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.452115 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7188  quinolinate synthetase  69.21 
 
 
323 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.014878 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  70.95 
 
 
323 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1045  quinolinate synthetase  70.61 
 
 
323 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.350076  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1429  quinolinate synthetase complex, A subunit  66.25 
 
 
328 aa  435  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  66.67 
 
 
358 aa  435  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  62.03 
 
 
359 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4308  quinolinate synthetase  58.53 
 
 
365 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23170  quinolinate synthetase A  65.06 
 
 
375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1434  quinolinate synthetase  60.7 
 
 
343 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4338  quinolinate synthetase  56.68 
 
 
370 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.230361  normal  0.0900103 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1541  quinolinate synthetase complex, A subunit  63.14 
 
 
326 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.258054  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1229  quinolinate synthetase  55.79 
 
 
370 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0791  quinolinate synthetase  58.82 
 
 
369 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1247  quinolinate synthetase  55.14 
 
 
370 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1107  quinolinate synthetase  54 
 
 
370 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4432  quinolinate synthetase  56.65 
 
 
350 aa  388  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558643  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2250  quinolinate synthetase  54.43 
 
 
351 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340783  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  49.7 
 
 
343 aa  332  6e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  52.26 
 
 
343 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0785  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.93 
 
 
347 aa  283  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  46.94 
 
 
305 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.63 
 
 
301 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.61 
 
 
303 aa  269  7e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  42.91 
 
 
304 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.26 
 
 
298 aa  262  6e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  46.28 
 
 
304 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  44.93 
 
 
304 aa  258  9e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0419  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.31 
 
 
344 aa  258  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.748276  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  47 
 
 
307 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.44 
 
 
303 aa  256  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.95 
 
 
302 aa  256  4e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.24 
 
 
306 aa  256  5e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  46.1 
 
 
302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  44.19 
 
 
304 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.4 
 
 
304 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  46.44 
 
 
302 aa  252  6e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  46.67 
 
 
334 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  49.01 
 
 
334 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  43.85 
 
 
304 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  45.76 
 
 
302 aa  251  1e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  45.18 
 
 
310 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  43.73 
 
 
306 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  46.67 
 
 
334 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  43.92 
 
 
304 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  45.27 
 
 
304 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  45.18 
 
 
322 aa  247  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  42.86 
 
 
333 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.85 
 
 
324 aa  247  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  46.28 
 
 
331 aa  246  6e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  44.22 
 
 
304 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  42.9 
 
 
303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  45.34 
 
 
332 aa  242  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  41.88 
 
 
318 aa  242  6e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.38 
 
 
323 aa  242  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.19 
 
 
334 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  46.03 
 
 
334 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.91 
 
 
332 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  43.67 
 
 
325 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  43.67 
 
 
325 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  40.53 
 
 
323 aa  239  5e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2965  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.61 
 
 
348 aa  239  6.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0394  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.86 
 
 
332 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  40.07 
 
 
308 aa  238  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  39.69 
 
 
323 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.27 
 
 
346 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  41.61 
 
 
307 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  41.28 
 
 
304 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  42.86 
 
 
310 aa  237  3e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  46.25 
 
 
326 aa  235  8e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  43.14 
 
 
323 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3085  quinolinate synthetase  43.61 
 
 
337 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3068  quinolinate synthetase  43.61 
 
 
337 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.736779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3128  quinolinate synthetase  43.61 
 
 
337 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  43 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.14 
 
 
304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  40.07 
 
 
312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  38.14 
 
 
301 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  42.86 
 
 
311 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.58 
 
 
338 aa  233  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  37.54 
 
 
301 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3619  quinolinate synthetase  44.01 
 
 
347 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170829  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  42.52 
 
 
324 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.19 
 
 
330 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.45 
 
 
317 aa  230  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>