More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2356 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  100 
 
 		 304 aa  621  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  70.63 
 
 		 304 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  65.44 
 
 		 303 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  59.06 
 
 		 301 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  60.26 
 
 		 304 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  59.93 
 
 		 304 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  56.95 
 
 		 303 aa  366  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  55.96 
 
 		 305 aa  361  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  58.67 
 
 		 307 aa  358  9e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  57.53 
 
 		 304 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  56.86 
 
 		 304 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  55.63 
 
 		 304 aa  349  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  57.43 
 
 		 306 aa  348  5e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  56.33 
 
 		 304 aa  348  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  53.14 
 
 		 306 aa  347  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  54.18 
 
 		 303 aa  332  5e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.33 
 
 		 324 aa  331  8e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  53.64 
 
 		 304 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  52.32 
 
 		 304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.48 
 
 		 302 aa  323  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  52.33 
 
 		 302 aa  323  2e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  53.2 
 
 		 302 aa  322  4e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  51.18 
 
 		 298 aa  322  4e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  50.84 
 
 		 301 aa  322  6e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.02 
 
 		 307 aa  321  9.000000000000001e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.83 
 
 		 308 aa  321  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  50.17 
 
 		 301 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  51.16 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  52 
 
 		 302 aa  317  2e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.51 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.17 
 
 		 306 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.66 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  46.6 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  49.84 
 
 		 308 aa  301  8.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  47.68 
 
 		 323 aa  297  1e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.27 
 
 		 331 aa  295  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0379  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.82 
 
 		 298 aa  293  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  44.85 
 
 		 321 aa  292  5e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.75 
 
 		 330 aa  288  7e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  47.88 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  46.86 
 
 		 334 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0868  quinolinate synthetase  45.42 
 
 		 324 aa  285  4e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  46.53 
 
 		 334 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  42.39 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  45.95 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  45.75 
 
 		 326 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  46.2 
 
 		 334 aa  281  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  43.65 
 
 		 318 aa  281  9e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.97 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  43.51 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  43.51 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2476  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.73 
 
 		 320 aa  279  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.34 
 
 		 317 aa  279  5e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  44.63 
 
 		 310 aa  278  9e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  45.28 
 
 		 333 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  45.51 
 
 		 310 aa  276  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.92 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  43.09 
 
 		 311 aa  275  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.26 
 
 		 338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  46.23 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  45.13 
 
 		 312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  44.3 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  45.83 
 
 		 318 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  44.26 
 
 		 323 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.02 
 
 		 310 aa  267  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2965  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.27 
 
 		 348 aa  267  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  45.25 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.91 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3166  quinolinate synthetase  45.1 
 
 		 334 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000173598  hitchhiker  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0394  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.76 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  43.32 
 
 		 324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  45.42 
 
 		 304 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3068  quinolinate synthetase  44.37 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.736779  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  43 
 
 		 323 aa  266  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3128  quinolinate synthetase  44.37 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3085  quinolinate synthetase  44.37 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  44.13 
 
 		 332 aa  265  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.97 
 
 		 329 aa  266  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.91 
 
 		 357 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  44.19 
 
 		 308 aa  265  7e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  45.42 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  42.62 
 
 		 320 aa  264  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.2 
 
 		 333 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  44.55 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.86 
 
 		 322 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.57 
 
 		 347 aa  264  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1448  quinolinate synthetase  42.48 
 
 		 320 aa  263  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0361  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.49 
 
 		 295 aa  264  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.83 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.13 
 
 		 346 aa  262  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  40.45 
 
 		 323 aa  263  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  45.54 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  41.5 
 
 		 348 aa  261  8.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  43.2 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  43.39 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2202  quinolinate synthetase  46.15 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.189573  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  44.03 
 
 		 343 aa  258  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  43.75 
 
 		 343 aa  257  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  42.02 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3619  quinolinate synthetase  43.83 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>