More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0742 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  100 
 
 
334 aa  686    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  75.38 
 
 
332 aa  528  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  68.57 
 
 
330 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  67.1 
 
 
324 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  68.75 
 
 
323 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  68.06 
 
 
320 aa  449  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  66.78 
 
 
325 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  66.78 
 
 
325 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  67.43 
 
 
323 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  66.78 
 
 
322 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1448  quinolinate synthetase  66.88 
 
 
320 aa  435  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  66.23 
 
 
317 aa  424  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  62.78 
 
 
322 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  62.2 
 
 
329 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.11 
 
 
331 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.64 
 
 
310 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  57.43 
 
 
310 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  57.1 
 
 
310 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  58.96 
 
 
348 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  58.33 
 
 
312 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  59.28 
 
 
329 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.66 
 
 
338 aa  388  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  55.92 
 
 
328 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  56.25 
 
 
328 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  56.54 
 
 
333 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  56.77 
 
 
304 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  56.77 
 
 
304 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  57 
 
 
332 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  55.92 
 
 
304 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  56.77 
 
 
304 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  56.59 
 
 
311 aa  363  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  55.63 
 
 
318 aa  361  8e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  54.87 
 
 
314 aa  350  2e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0015  quinolinate synthetase  54.98 
 
 
313 aa  347  2e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  53.95 
 
 
319 aa  346  3e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0868  quinolinate synthetase  55.59 
 
 
324 aa  343  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  53.33 
 
 
321 aa  343  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  56.25 
 
 
323 aa  340  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  53.07 
 
 
322 aa  335  7.999999999999999e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2150  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.27 
 
 
311 aa  328  7e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.484842  normal  0.0905755 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0969  quinolinate synthetase  51.8 
 
 
315 aa  325  6e-88  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.814185  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  49.35 
 
 
308 aa  309  5e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.83 
 
 
298 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  50.83 
 
 
307 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.04 
 
 
324 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.49 
 
 
307 aa  299  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.4 
 
 
303 aa  299  5e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  45.9 
 
 
331 aa  296  3e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  45.86 
 
 
308 aa  293  3e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  47.54 
 
 
308 aa  290  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.55 
 
 
301 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  45.21 
 
 
304 aa  288  9e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  46.41 
 
 
303 aa  288  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  47.35 
 
 
304 aa  287  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  47.68 
 
 
304 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  46.15 
 
 
304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1159  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.28 
 
 
341 aa  281  8.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  43.97 
 
 
304 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  45.21 
 
 
304 aa  280  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  44.92 
 
 
306 aa  281  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  47 
 
 
306 aa  279  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  46.49 
 
 
304 aa  279  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  47.19 
 
 
301 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  47.19 
 
 
301 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0600  quinolinate synthetase  43.93 
 
 
379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.287851  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  46.15 
 
 
318 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.18 
 
 
303 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  44.41 
 
 
326 aa  271  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.13 
 
 
304 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  46.51 
 
 
306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  45.6 
 
 
323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0026  quinolinate synthetase  43.67 
 
 
370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44147  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  44.08 
 
 
305 aa  269  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  44.9 
 
 
334 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0632  quinolinate synthetase  42.99 
 
 
379 aa  269  5e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  43.13 
 
 
334 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0746  quinolinate synthetase  42.86 
 
 
356 aa  268  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  45.15 
 
 
302 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0903  quinolinate synthetase  43.04 
 
 
377 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  43.13 
 
 
334 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.45 
 
 
323 aa  267  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  44.06 
 
 
332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0891  quinolinate synthetase  43.53 
 
 
358 aa  266  4e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000130385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1696  quinolinate synthetase  42.81 
 
 
353 aa  265  7e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  42.81 
 
 
334 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3497  quinolinate synthetase  43.67 
 
 
374 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0545578  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.57 
 
 
304 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  43.33 
 
 
304 aa  263  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.35 
 
 
306 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4097  quinolinate synthetase  43.71 
 
 
374 aa  262  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02681  quinolinate synthetase  43.4 
 
 
345 aa  262  6.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000074326  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1964  quinolinate synthetase  43.04 
 
 
395 aa  262  8e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  44.33 
 
 
302 aa  261  1e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2820  quinolinate synthetase  43.04 
 
 
374 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0394  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.81 
 
 
332 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1319  quinolinate synthetase  41.94 
 
 
378 aa  260  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2874  quinolinate synthetase  43.17 
 
 
384 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0938  quinolinate synthetase  42.72 
 
 
377 aa  259  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2449  quinolinate synthetase  43.99 
 
 
382 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  42.81 
 
 
304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>