More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1590 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  100 
 
 
302 aa  619  1e-176  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  94.7 
 
 
302 aa  590  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  91.69 
 
 
302 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  60.27 
 
 
324 aa  361  7.0000000000000005e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  57.48 
 
 
301 aa  351  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  55.81 
 
 
304 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.78 
 
 
298 aa  341  8e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  56.08 
 
 
306 aa  340  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  56.15 
 
 
304 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  54.82 
 
 
304 aa  334  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.51 
 
 
306 aa  333  2e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  56.57 
 
 
306 aa  329  3e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  54.15 
 
 
304 aa  328  6e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  54.49 
 
 
304 aa  324  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.87 
 
 
302 aa  322  4e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  53.2 
 
 
304 aa  322  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  53.82 
 
 
304 aa  322  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  52.86 
 
 
307 aa  322  6e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  55.37 
 
 
304 aa  322  6e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  52.65 
 
 
305 aa  321  8e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  55.22 
 
 
304 aa  321  9.000000000000001e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  51.49 
 
 
306 aa  316  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0379  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.2 
 
 
298 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  55.02 
 
 
303 aa  314  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  51.02 
 
 
304 aa  314  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.83 
 
 
308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.86 
 
 
303 aa  309  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.34 
 
 
304 aa  306  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.83 
 
 
303 aa  297  2e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  51.49 
 
 
331 aa  297  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.01 
 
 
303 aa  294  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  48.52 
 
 
308 aa  285  5e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  51.01 
 
 
307 aa  285  5e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  46.33 
 
 
318 aa  285  7e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0361  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.33 
 
 
295 aa  282  5.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  50 
 
 
346 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.23 
 
 
323 aa  279  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  47.71 
 
 
332 aa  277  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  48.2 
 
 
326 aa  276  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2476  quinolinate synthetase complex, A subunit  50 
 
 
320 aa  275  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5730  quinolinate synthetase  48.04 
 
 
339 aa  272  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3166  quinolinate synthetase  49.34 
 
 
334 aa  271  8.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000173598  hitchhiker  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  46.91 
 
 
323 aa  270  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  48.47 
 
 
359 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  46.49 
 
 
310 aa  268  7e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10830  quinolinate synthetase  47.71 
 
 
335 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324254  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1147  quinolinate synthetase  47.12 
 
 
298 aa  267  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  44.78 
 
 
301 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1185  quinolinate synthetase  47.12 
 
 
298 aa  267  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  44.44 
 
 
301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.8 
 
 
338 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  46.51 
 
 
308 aa  266  5e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  46.25 
 
 
308 aa  265  8.999999999999999e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2010  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.39 
 
 
349 aa  264  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.701511  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  44.08 
 
 
322 aa  264  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3459  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.15 
 
 
462 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3068  quinolinate synthetase  47.12 
 
 
337 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.736779  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  45.33 
 
 
311 aa  263  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3085  quinolinate synthetase  47.12 
 
 
337 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3128  quinolinate synthetase  47.12 
 
 
337 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0394  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.39 
 
 
332 aa  263  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.67 
 
 
332 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  43.89 
 
 
343 aa  261  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  46.31 
 
 
333 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.33 
 
 
334 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4338  quinolinate synthetase  46.76 
 
 
370 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.230361  normal  0.0900103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  44.51 
 
 
343 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2965  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.87 
 
 
348 aa  259  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  44.82 
 
 
325 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  44.82 
 
 
325 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  43.67 
 
 
304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.62 
 
 
343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  44.15 
 
 
323 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0295  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.46 
 
 
345 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.3 
 
 
333 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1229  quinolinate synthetase  46.94 
 
 
370 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  44.04 
 
 
304 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.3 
 
 
333 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  47.96 
 
 
327 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  43.33 
 
 
304 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.65 
 
 
358 aa  255  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3619  quinolinate synthetase  46.41 
 
 
347 aa  255  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170829  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2202  quinolinate synthetase  45.45 
 
 
330 aa  255  7e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.189573  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0791  quinolinate synthetase  46.62 
 
 
369 aa  254  8e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.76 
 
 
347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.1 
 
 
357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1429  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.75 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  42.48 
 
 
321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.67 
 
 
338 aa  253  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  46.94 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  42.72 
 
 
304 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.76 
 
 
357 aa  252  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.3 
 
 
317 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  42.3 
 
 
318 aa  251  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1583  quinolinate synthetase  46.15 
 
 
303 aa  251  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.019582  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0546  quinolinate synthetase  46.53 
 
 
305 aa  250  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  47.78 
 
 
324 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  42.81 
 
 
323 aa  250  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  42.91 
 
 
310 aa  249  3e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.7 
 
 
329 aa  249  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>