More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3519 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  100 
 
 		 304 aa  625  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  98.03 
 
 		 304 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  80.59 
 
 		 304 aa  519  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  77.63 
 
 		 304 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  77.3 
 
 		 304 aa  500  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  73.77 
 
 		 305 aa  471  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  71.67 
 
 		 304 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  67.97 
 
 		 306 aa  441  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  63.82 
 
 		 304 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.64 
 
 		 301 aa  381  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  60.26 
 
 		 304 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  59.86 
 
 		 306 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  60.27 
 
 		 307 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.26 
 
 		 304 aa  345  4e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  56.48 
 
 		 304 aa  341  7e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  55.3 
 
 		 306 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  56.48 
 
 		 324 aa  337  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  54.82 
 
 		 302 aa  334  1e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  53.49 
 
 		 302 aa  333  3e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  53.49 
 
 		 302 aa  329  4e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  51.18 
 
 		 298 aa  328  8e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.56 
 
 		 304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.07 
 
 		 302 aa  326  3e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0379  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.82 
 
 		 298 aa  323  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.84 
 
 		 303 aa  318  6e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.36 
 
 		 306 aa  316  4e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.69 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  54.51 
 
 		 303 aa  311  9e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  51.33 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.32 
 
 		 308 aa  305  6e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.84 
 
 		 303 aa  299  3e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  50.16 
 
 		 334 aa  298  7e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  49.51 
 
 		 334 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  49.18 
 
 		 334 aa  291  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  48.1 
 
 		 318 aa  291  9e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  48.85 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  48.03 
 
 		 331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.68 
 
 		 334 aa  287  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.19 
 
 		 323 aa  285  8e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2202  quinolinate synthetase  47.99 
 
 		 330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.189573  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.68 
 
 		 332 aa  282  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  45.92 
 
 		 301 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  46.26 
 
 		 301 aa  281  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  47.88 
 
 		 308 aa  278  9e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.77 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  47.14 
 
 		 325 aa  275  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2476  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.04 
 
 		 320 aa  275  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  47.14 
 
 		 325 aa  275  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  45 
 
 		 321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  45.21 
 
 		 311 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  46.51 
 
 		 323 aa  271  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  47.4 
 
 		 308 aa  271  8.000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  46.41 
 
 		 348 aa  269  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.89 
 
 		 338 aa  268  8.999999999999999e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  45.15 
 
 		 323 aa  268  8.999999999999999e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  47.33 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  43.65 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  43.89 
 
 		 312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  45.42 
 
 		 322 aa  265  7e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.27 
 
 		 346 aa  265  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  47.1 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.07 
 
 		 317 aa  263  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0868  quinolinate synthetase  43.61 
 
 		 324 aa  262  6e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  45.79 
 
 		 323 aa  261  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.36 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  43.28 
 
 		 310 aa  259  3e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  44.08 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.92 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.61 
 
 		 333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  42.67 
 
 		 323 aa  258  7e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  44.93 
 
 		 320 aa  258  9e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  43.61 
 
 		 318 aa  258  9e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  44.85 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.93 
 
 		 333 aa  256  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.32 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0361  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.82 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  44.22 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  43.71 
 
 		 323 aa  256  3e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  45.03 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  44.52 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  42.62 
 
 		 310 aa  256  5e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  42.99 
 
 		 332 aa  255  6e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1448  quinolinate synthetase  44.88 
 
 		 320 aa  255  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0394  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.63 
 
 		 332 aa  255  7e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1429  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.07 
 
 		 328 aa  255  8e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  40.67 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0791  quinolinate synthetase  44.75 
 
 		 369 aa  253  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897217 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2150  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.36 
 
 		 311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.484842  normal  0.0905755 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  43.42 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  43.81 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.19 
 
 		 338 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.85 
 
 		 357 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.37 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  42.14 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.52 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  43.49 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  42.81 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3459  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.39 
 
 		 462 aa  250  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  45.18 
 
 		 327 aa  249  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.55 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>