More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0379 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0379  quinolinate synthetase complex, A subunit  100 
 
 
298 aa  615  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  60.81 
 
 
307 aa  346  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  56.95 
 
 
304 aa  340  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  56.08 
 
 
304 aa  331  9e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  56.8 
 
 
324 aa  329  3e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.97 
 
 
303 aa  329  4e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  53.54 
 
 
307 aa  328  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  55.56 
 
 
304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  54.49 
 
 
304 aa  325  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  53.82 
 
 
304 aa  323  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  52.03 
 
 
306 aa  323  3e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  52.86 
 
 
303 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  52.36 
 
 
304 aa  315  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  53.2 
 
 
302 aa  314  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  54.03 
 
 
302 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.87 
 
 
306 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  53.31 
 
 
302 aa  311  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  52.03 
 
 
306 aa  310  2e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  52.36 
 
 
304 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  51.02 
 
 
304 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  51.34 
 
 
306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.97 
 
 
298 aa  302  5.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.98 
 
 
301 aa  301  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  51.52 
 
 
302 aa  300  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  51.18 
 
 
305 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  50.17 
 
 
304 aa  296  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  48.82 
 
 
304 aa  293  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.58 
 
 
308 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.64 
 
 
303 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.65 
 
 
303 aa  281  9e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.96 
 
 
304 aa  277  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  44.56 
 
 
301 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  47.99 
 
 
310 aa  264  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  44.22 
 
 
301 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  47.37 
 
 
322 aa  263  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  46.33 
 
 
311 aa  261  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  46 
 
 
332 aa  261  8.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  46.56 
 
 
334 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  45 
 
 
323 aa  256  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  46.31 
 
 
333 aa  255  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2476  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.82 
 
 
320 aa  255  8e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  45.97 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0546  quinolinate synthetase  45.21 
 
 
305 aa  253  3e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  47.35 
 
 
331 aa  252  4.0000000000000004e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  44.82 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  43.19 
 
 
323 aa  251  1e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  45.3 
 
 
310 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0556  quinolinate synthetase  44.22 
 
 
305 aa  251  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  44.97 
 
 
328 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.31 
 
 
330 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  40.92 
 
 
312 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.82 
 
 
334 aa  249  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.2 
 
 
346 aa  249  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  45.3 
 
 
325 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  45.3 
 
 
325 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  44.55 
 
 
321 aa  249  6e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0361  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.64 
 
 
295 aa  248  7e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2202  quinolinate synthetase  43.92 
 
 
330 aa  248  8e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.189573  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.85 
 
 
317 aa  247  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  44.3 
 
 
328 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.19 
 
 
331 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1664  quinolinate synthetase A  45.27 
 
 
300 aa  247  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.358853  unclonable  0.000000000000205147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.72 
 
 
323 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  45.54 
 
 
334 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  44.67 
 
 
308 aa  245  6.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.37 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  45.3 
 
 
324 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  44.88 
 
 
334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.39 
 
 
289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  45.03 
 
 
308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  43.14 
 
 
318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  42.86 
 
 
304 aa  242  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  44.88 
 
 
334 aa  241  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  44.01 
 
 
318 aa  241  1e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  44.63 
 
 
320 aa  241  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0820  quinolinate synthetase  44.82 
 
 
298 aa  240  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14914  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  42.19 
 
 
304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  41.86 
 
 
304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  46.08 
 
 
323 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.96 
 
 
322 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  41.86 
 
 
304 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.58 
 
 
338 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7188  quinolinate synthetase  46.76 
 
 
323 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.014878 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  41.81 
 
 
319 aa  235  8e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1045  quinolinate synthetase  44.75 
 
 
323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.350076  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2250  quinolinate synthetase  43.2 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340783  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2150  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.71 
 
 
311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.484842  normal  0.0905755 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  42.47 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.03 
 
 
343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  43.69 
 
 
327 aa  232  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  44.75 
 
 
323 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1431  quinolinate synthetase  42.24 
 
 
305 aa  231  9e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.918006  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0488  quinolinate synthetase  42.24 
 
 
305 aa  231  9e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0349  quinolinate synthetase  41.91 
 
 
305 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.772142  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6033  quinolinate synthetase  46.08 
 
 
323 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.452115 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  41.45 
 
 
314 aa  230  2e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  43.34 
 
 
327 aa  230  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3619  quinolinate synthetase  45.64 
 
 
347 aa  230  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170829  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11610  quinolinate synthetase  44.59 
 
 
349 aa  229  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.681965  normal  0.363525 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  40.92 
 
 
329 aa  229  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>