More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1474 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  100 
 
 		 302 aa  620  1e-176  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  94.7 
 
 		 302 aa  590  1e-167  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  93.36 
 
 		 302 aa  579  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  59.6 
 
 		 324 aa  357  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  57.14 
 
 		 301 aa  351  7e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  55.15 
 
 		 304 aa  338  7e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  55.07 
 
 		 306 aa  333  3e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  54.42 
 
 		 298 aa  332  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  55.48 
 
 		 304 aa  331  9e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  53.49 
 
 		 304 aa  329  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  52.82 
 
 		 304 aa  323  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.19 
 
 		 306 aa  321  7e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  55.22 
 
 		 304 aa  319  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  53.82 
 
 		 304 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  54.67 
 
 		 306 aa  318  5e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  52.86 
 
 		 305 aa  317  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  55.03 
 
 		 304 aa  317  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  52 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.54 
 
 		 302 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0379  quinolinate synthetase complex, A subunit  54.03 
 
 		 298 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  50.84 
 
 		 307 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  52.16 
 
 		 304 aa  310  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.67 
 
 		 308 aa  309  4e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  49.83 
 
 		 306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  50 
 
 		 304 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.68 
 
 		 303 aa  305  4.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  53.63 
 
 		 303 aa  305  9.000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.35 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  51.16 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.16 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.02 
 
 		 303 aa  285  5e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  51.01 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0361  quinolinate synthetase complex, A subunit  51 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  47.54 
 
 		 308 aa  278  8e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  46.13 
 
 		 318 aa  278  9e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.36 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.26 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  46.82 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2476  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.4 
 
 		 320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  47.87 
 
 		 326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1147  quinolinate synthetase  48.14 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1185  quinolinate synthetase  48.14 
 
 		 298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5730  quinolinate synthetase  47.92 
 
 		 339 aa  269  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3459  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.49 
 
 		 462 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3166  quinolinate synthetase  50 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000173598  hitchhiker  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  47.8 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  46.58 
 
 		 323 aa  265  8.999999999999999e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  46.15 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.67 
 
 		 332 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  43.43 
 
 		 301 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  43.1 
 
 		 301 aa  261  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  44.12 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  46.2 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.14 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  45.18 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3068  quinolinate synthetase  47.06 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.736779  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3085  quinolinate synthetase  47.06 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3128  quinolinate synthetase  47.06 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2010  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.04 
 
 		 349 aa  259  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.701511  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10830  quinolinate synthetase  46.41 
 
 		 335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  44 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  43.89 
 
 		 343 aa  258  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  44.82 
 
 		 325 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4338  quinolinate synthetase  47.44 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.230361  normal  0.0900103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  44.82 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  44.2 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  43.14 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0394  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.86 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.62 
 
 		 343 aa  255  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  43.81 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1229  quinolinate synthetase  47.62 
 
 		 370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  48.3 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0295  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.46 
 
 		 345 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2965  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.75 
 
 		 348 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1583  quinolinate synthetase  46.49 
 
 		 303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.019582  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  45.3 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3619  quinolinate synthetase  47.06 
 
 		 347 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.44 
 
 		 357 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.96 
 
 		 333 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.1 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.65 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.62 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0546  quinolinate synthetase  46.53 
 
 		 305 aa  250  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  43.71 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  42.48 
 
 		 312 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2202  quinolinate synthetase  45.12 
 
 		 330 aa  249  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.189573  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0791  quinolinate synthetase  46.28 
 
 		 369 aa  249  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1247  quinolinate synthetase  47.12 
 
 		 370 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.64 
 
 		 317 aa  249  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  42 
 
 		 338 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.1 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.36 
 
 		 329 aa  249  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  42.81 
 
 		 323 aa  248  6e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  46.94 
 
 		 327 aa  248  7e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  42.57 
 
 		 322 aa  248  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  47.44 
 
 		 323 aa  248  9e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1664  quinolinate synthetase A  46.94 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.358853  unclonable  0.000000000000205147 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1429  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.92 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  47.44 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0556  quinolinate synthetase  45.51 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>