More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0394 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0394  quinolinate synthetase complex, A subunit  100 
 
 
332 aa  683    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  87.35 
 
 
332 aa  598  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10830  quinolinate synthetase  72.24 
 
 
335 aa  474  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324254  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5730  quinolinate synthetase  70.44 
 
 
339 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  69.02 
 
 
326 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2965  quinolinate synthetase complex, A subunit  69.72 
 
 
348 aa  461  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3068  quinolinate synthetase  68.21 
 
 
337 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.736779  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3085  quinolinate synthetase  68.21 
 
 
337 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3128  quinolinate synthetase  68.21 
 
 
337 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3619  quinolinate synthetase  69.4 
 
 
347 aa  455  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170829  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2798  quinolinate synthetase  68.65 
 
 
347 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3459  quinolinate synthetase complex, A subunit  72.41 
 
 
462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11610  quinolinate synthetase  68.34 
 
 
349 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.681965  normal  0.363525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2010  quinolinate synthetase complex, A subunit  68.24 
 
 
349 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.701511  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3166  quinolinate synthetase  66.99 
 
 
334 aa  424  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000173598  hitchhiker  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2476  quinolinate synthetase complex, A subunit  60.38 
 
 
320 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  53.75 
 
 
318 aa  367  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  57.78 
 
 
346 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  51.14 
 
 
323 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0960  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.9 
 
 
336 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.257162  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  49.36 
 
 
331 aa  303  4.0000000000000003e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  46.93 
 
 
308 aa  290  2e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  46.35 
 
 
308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  47.71 
 
 
307 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  48.72 
 
 
334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  49.04 
 
 
334 aa  271  9e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  48.72 
 
 
334 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  46.67 
 
 
306 aa  269  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.23 
 
 
317 aa  269  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  48.73 
 
 
334 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  44.76 
 
 
304 aa  266  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.65 
 
 
324 aa  264  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  46.56 
 
 
303 aa  264  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  47.39 
 
 
302 aa  263  4e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  46.18 
 
 
302 aa  262  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.73 
 
 
332 aa  261  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.16 
 
 
298 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.59 
 
 
303 aa  260  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.81 
 
 
334 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.86 
 
 
301 aa  257  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  45.89 
 
 
322 aa  257  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  45.86 
 
 
302 aa  256  3e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  44.48 
 
 
304 aa  256  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  43.63 
 
 
304 aa  255  8e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  44.59 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.82 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.63 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.67 
 
 
304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  41.72 
 
 
304 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  42.36 
 
 
304 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.37 
 
 
307 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  43.67 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.3 
 
 
330 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  42.99 
 
 
304 aa  252  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  41.72 
 
 
304 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  43.23 
 
 
323 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  42.37 
 
 
308 aa  250  3e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  42.95 
 
 
306 aa  249  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  41.72 
 
 
324 aa  249  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  43.63 
 
 
310 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  43.49 
 
 
305 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  41.1 
 
 
325 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  42.36 
 
 
304 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  41.8 
 
 
325 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  39.47 
 
 
322 aa  246  4e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  41.19 
 
 
328 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.85 
 
 
308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  43.79 
 
 
304 aa  245  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  42.36 
 
 
304 aa  245  6.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  40.88 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  41.99 
 
 
311 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  40.63 
 
 
304 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.19 
 
 
329 aa  243  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  41.59 
 
 
348 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  41.48 
 
 
323 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  39.81 
 
 
312 aa  242  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.67 
 
 
302 aa  241  9e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  41.14 
 
 
314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.61 
 
 
303 aa  239  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  41.03 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0015  quinolinate synthetase  40.19 
 
 
313 aa  238  1e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.86 
 
 
357 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1448  quinolinate synthetase  42.14 
 
 
320 aa  238  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.56 
 
 
310 aa  237  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  40.85 
 
 
329 aa  236  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  41.72 
 
 
304 aa  235  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  40.57 
 
 
310 aa  235  7e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.24 
 
 
347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.24 
 
 
357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.52 
 
 
322 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  37.93 
 
 
318 aa  232  5e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  43.2 
 
 
343 aa  231  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.85 
 
 
338 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1229  quinolinate synthetase  45.45 
 
 
370 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  41.42 
 
 
321 aa  231  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  38.74 
 
 
332 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.81 
 
 
304 aa  230  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.91 
 
 
303 aa  231  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.19 
 
 
358 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  40.58 
 
 
301 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>