More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3459 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3459  quinolinate synthetase complex, A subunit  100 
 
 		 462 aa  926    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0394  quinolinate synthetase complex, A subunit  72.41 
 
 		 332 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3068  quinolinate synthetase  71.47 
 
 		 337 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.736779  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3085  quinolinate synthetase  71.47 
 
 		 337 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3128  quinolinate synthetase  71.47 
 
 		 337 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  71.16 
 
 		 332 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10830  quinolinate synthetase  70.66 
 
 		 335 aa  448  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  70.55 
 
 		 326 aa  449  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11610  quinolinate synthetase  68.37 
 
 		 349 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.681965  normal  0.363525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5730  quinolinate synthetase  68.77 
 
 		 339 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3619  quinolinate synthetase  68.77 
 
 		 347 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2798  quinolinate synthetase  68.65 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2965  quinolinate synthetase complex, A subunit  67.19 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3166  quinolinate synthetase  66.56 
 
 		 334 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000173598  hitchhiker  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2010  quinolinate synthetase complex, A subunit  67.19 
 
 		 349 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.701511  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2476  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.2 
 
 		 320 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.46 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  53.42 
 
 		 318 aa  363  3e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  54.19 
 
 		 323 aa  345  7e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  52.56 
 
 		 331 aa  317  4e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0960  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.44 
 
 		 336 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.257162  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  48.23 
 
 		 308 aa  290  3e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  48.08 
 
 		 306 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  48.55 
 
 		 302 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  48.11 
 
 		 303 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  48.23 
 
 		 302 aa  271  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.23 
 
 		 301 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  47.91 
 
 		 302 aa  270  5e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.04 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.23 
 
 		 317 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  47.47 
 
 		 322 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  47.71 
 
 		 304 aa  265  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  46.58 
 
 		 308 aa  265  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.9 
 
 		 306 aa  265  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  45.1 
 
 		 304 aa  265  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.68 
 
 		 324 aa  264  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  47.39 
 
 		 304 aa  262  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  45.1 
 
 		 307 aa  259  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  44.69 
 
 		 304 aa  259  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.94 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  44.37 
 
 		 304 aa  256  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.87 
 
 		 332 aa  255  9e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  46.01 
 
 		 310 aa  255  9e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  45.98 
 
 		 304 aa  256  9e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  46.55 
 
 		 334 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  46.13 
 
 		 334 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  41.72 
 
 		 304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.71 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  44.48 
 
 		 323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  45.95 
 
 		 334 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.13 
 
 		 334 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  43.81 
 
 		 322 aa  251  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  41.43 
 
 		 312 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  43.27 
 
 		 311 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  40.45 
 
 		 304 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  45.1 
 
 		 304 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  40.13 
 
 		 304 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.3 
 
 		 303 aa  249  7e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.56 
 
 		 307 aa  248  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  41.84 
 
 		 333 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  45.69 
 
 		 348 aa  247  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.78 
 
 		 308 aa  246  8e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  40.75 
 
 		 314 aa  245  9.999999999999999e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  39.94 
 
 		 304 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  44.12 
 
 		 305 aa  244  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  43.09 
 
 		 306 aa  244  3e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  46.96 
 
 		 334 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.11 
 
 		 330 aa  243  7e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0015  quinolinate synthetase  40.51 
 
 		 313 aa  242  7.999999999999999e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  41.21 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  42.68 
 
 		 324 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  43.45 
 
 		 310 aa  241  2e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  42.12 
 
 		 320 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.29 
 
 		 304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  41.21 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.28 
 
 		 338 aa  240  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.28 
 
 		 347 aa  240  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  42.86 
 
 		 321 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.74 
 
 		 333 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  41.5 
 
 		 304 aa  239  8e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  43.28 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.95 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  43.3 
 
 		 329 aa  237  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.95 
 
 		 357 aa  237  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0868  quinolinate synthetase  40.56 
 
 		 324 aa  236  6e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.41 
 
 		 331 aa  236  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  42.77 
 
 		 325 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  42.77 
 
 		 325 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  41.95 
 
 		 359 aa  236  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  39.55 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.88 
 
 		 338 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  37.79 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.37 
 
 		 322 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.28 
 
 		 303 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  42.62 
 
 		 304 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2250  quinolinate synthetase  42.46 
 
 		 351 aa  232  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  43.57 
 
 		 343 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4432  quinolinate synthetase  43.77 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  40.12 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  41.21 
 
 		 308 aa  230  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>