More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4733 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  100 
 
 
331 aa  682    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  80.85 
 
 
329 aa  558  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  64.38 
 
 
330 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  63.04 
 
 
332 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.11 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  61.89 
 
 
323 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  60.26 
 
 
324 aa  401  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  60.13 
 
 
325 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1448  quinolinate synthetase  62.42 
 
 
320 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  60.13 
 
 
325 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  59.48 
 
 
323 aa  396  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  60.78 
 
 
322 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  59.34 
 
 
310 aa  392  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  57.28 
 
 
310 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  58.6 
 
 
338 aa  385  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  58.63 
 
 
320 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  58.63 
 
 
317 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  56.63 
 
 
310 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  56.29 
 
 
333 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  53.92 
 
 
322 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  56.77 
 
 
348 aa  371  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  54.89 
 
 
332 aa  364  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  55.63 
 
 
312 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  54.37 
 
 
329 aa  358  8e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  53.11 
 
 
304 aa  355  7.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  53.27 
 
 
328 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  53.27 
 
 
328 aa  352  4e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  51.8 
 
 
304 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  51.48 
 
 
304 aa  346  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  51.48 
 
 
304 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  52.94 
 
 
322 aa  331  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0868  quinolinate synthetase  52.94 
 
 
324 aa  331  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  52.46 
 
 
311 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  50.98 
 
 
318 aa  326  3e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2150  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.23 
 
 
311 aa  321  9.000000000000001e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.484842  normal  0.0905755 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  50.65 
 
 
323 aa  320  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  50.49 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.35 
 
 
303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  50.65 
 
 
319 aa  316  4e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  50 
 
 
314 aa  315  5e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  50.66 
 
 
307 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0891  quinolinate synthetase  51.12 
 
 
358 aa  310  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000130385  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0015  quinolinate synthetase  46.93 
 
 
313 aa  305  7e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.39 
 
 
324 aa  305  7e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0969  quinolinate synthetase  47.87 
 
 
315 aa  301  1e-80  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.814185  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  48.38 
 
 
308 aa  298  7e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.1 
 
 
301 aa  296  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  47.27 
 
 
304 aa  295  6e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.47 
 
 
307 aa  295  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0476  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.56 
 
 
361 aa  293  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00468623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  46.64 
 
 
303 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  45.54 
 
 
304 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  47.88 
 
 
306 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  44.95 
 
 
304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0227  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.31 
 
 
360 aa  286  5e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.456583  normal  0.144436 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  45.43 
 
 
331 aa  285  5.999999999999999e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  47.95 
 
 
318 aa  285  7e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1159  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.39 
 
 
341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  45.13 
 
 
301 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  46.93 
 
 
334 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  43.35 
 
 
308 aa  279  4e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  44.88 
 
 
304 aa  279  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  46.93 
 
 
334 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  46.93 
 
 
334 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.13 
 
 
323 aa  277  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.95 
 
 
303 aa  277  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  44.22 
 
 
304 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  45.6 
 
 
306 aa  277  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.52 
 
 
298 aa  277  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  44.81 
 
 
305 aa  276  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  44.77 
 
 
304 aa  276  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  44.95 
 
 
308 aa  276  4e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.13 
 
 
304 aa  275  8e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  44.16 
 
 
301 aa  275  9e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  46.1 
 
 
306 aa  273  3e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  46.45 
 
 
334 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  44.12 
 
 
304 aa  272  7e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1554  quinolinate synthetase  45.54 
 
 
371 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.26 
 
 
304 aa  271  9e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0768  quinolinate synthetase  44.03 
 
 
375 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.68917 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  44.44 
 
 
304 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1901  quinolinate synthetase  45.54 
 
 
349 aa  268  7e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.115299  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2449  quinolinate synthetase  45.51 
 
 
382 aa  268  8e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3071  quinolinate synthetase  43.45 
 
 
359 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003910  quinolinate synthetase  43.95 
 
 
353 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2197  quinolinate synthetase  46.03 
 
 
348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293101  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0256  quinolinate synthetase  43.58 
 
 
357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.72 
 
 
302 aa  266  4e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  44.74 
 
 
304 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2874  quinolinate synthetase  44.55 
 
 
384 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1928  quinolinate synthetase  44.94 
 
 
355 aa  266  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0143239 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0746  quinolinate synthetase  43.77 
 
 
356 aa  265  7e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1426  quinolinate synthetase  44.27 
 
 
353 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00168698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2342  quinolinate synthetase  44.27 
 
 
357 aa  264  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1888  quinolinate synthetase  43.96 
 
 
360 aa  264  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683594  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  43.48 
 
 
332 aa  263  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4505  quinolinate synthetase  43.96 
 
 
355 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2152  quinolinate synthetase  43.96 
 
 
355 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000718643  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2219  quinolinate synthetase  43.96 
 
 
355 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2015  quinolinate synthetase  45.42 
 
 
372 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.332411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>