More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4432 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4432  quinolinate synthetase  100 
 
 		 350 aa  723    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2250  quinolinate synthetase  73.28 
 
 		 351 aa  555  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  55.89 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  57.01 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  56.38 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1107  quinolinate synthetase  55.15 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  56.29 
 
 		 347 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4338  quinolinate synthetase  55.45 
 
 		 370 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.230361  normal  0.0900103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  56.65 
 
 		 357 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0295  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.03 
 
 		 345 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1229  quinolinate synthetase  55.72 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1247  quinolinate synthetase  54.85 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.89 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  56.17 
 
 		 307 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1434  quinolinate synthetase  52.87 
 
 		 343 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582213  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.73 
 
 		 343 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  53.61 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  54.09 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  54.04 
 
 		 323 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  54.11 
 
 		 333 aa  364  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4308  quinolinate synthetase  58.31 
 
 		 365 aa  363  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  53.63 
 
 		 324 aa  360  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  51.9 
 
 		 333 aa  353  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6033  quinolinate synthetase  54.29 
 
 		 323 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.452115 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  56.66 
 
 		 323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7188  quinolinate synthetase  54.29 
 
 		 323 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.014878 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1045  quinolinate synthetase  56.31 
 
 		 323 aa  350  2e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.350076  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  52.22 
 
 		 323 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1183  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.87 
 
 		 347 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0791  quinolinate synthetase  53 
 
 		 369 aa  346  3e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897217 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1429  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.85 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23170  quinolinate synthetase A  53.35 
 
 		 375 aa  334  1e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1541  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.72 
 
 		 326 aa  329  4e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.258054  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  46.02 
 
 		 343 aa  303  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  44.91 
 
 		 343 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.95 
 
 		 301 aa  262  6.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0785  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.67 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  46.58 
 
 		 304 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  45.21 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  42.81 
 
 		 304 aa  257  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0419  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.61 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.748276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.52 
 
 		 303 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  42.12 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  45.21 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  42.81 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  46.82 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  46.82 
 
 		 334 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.52 
 
 		 298 aa  245  6.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.28 
 
 		 332 aa  245  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  42.18 
 
 		 304 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.78 
 
 		 338 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  41.78 
 
 		 304 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  46.15 
 
 		 334 aa  242  6e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  43.05 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  42.62 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.46 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  43.05 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  40.33 
 
 		 304 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  42.07 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  40.33 
 
 		 304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  40.96 
 
 		 306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  42.47 
 
 		 304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.49 
 
 		 306 aa  239  5e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  46.13 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  41.61 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  42.52 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.64 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  43.24 
 
 		 302 aa  237  3e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  40.86 
 
 		 304 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  43.58 
 
 		 302 aa  237  3e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.37 
 
 		 331 aa  235  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  40.33 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.54 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  42.66 
 
 		 302 aa  232  6e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  38.89 
 
 		 323 aa  232  7.000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  39.18 
 
 		 301 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  40.68 
 
 		 304 aa  232  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  41.78 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.14 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  40.26 
 
 		 304 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  39.18 
 
 		 301 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  42.72 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  39.8 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  39.67 
 
 		 308 aa  228  9e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.25 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  40.73 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.42 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  41.47 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.87 
 
 		 310 aa  226  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.85 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  40.33 
 
 		 310 aa  226  6e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10830  quinolinate synthetase  39.33 
 
 		 335 aa  225  7e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.53 
 
 		 329 aa  225  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  40.45 
 
 		 323 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.67 
 
 		 330 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  42.28 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3085  quinolinate synthetase  41.36 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3068  quinolinate synthetase  41.36 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.736779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3128  quinolinate synthetase  41.36 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.12 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>