More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1247 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1107  quinolinate synthetase  93.51 
 
 		 370 aa  718    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4338  quinolinate synthetase  83.78 
 
 		 370 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.230361  normal  0.0900103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1229  quinolinate synthetase  92.16 
 
 		 370 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1247  quinolinate synthetase  100 
 
 		 370 aa  761    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  71.71 
 
 		 358 aa  518  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  67.06 
 
 		 359 aa  481  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1434  quinolinate synthetase  67.74 
 
 		 343 aa  478  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582213  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  63.55 
 
 		 327 aa  425  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  66.35 
 
 		 324 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0791  quinolinate synthetase  61.58 
 
 		 369 aa  424  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4308  quinolinate synthetase  62.39 
 
 		 365 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  64.76 
 
 		 327 aa  421  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1183  quinolinate synthetase complex, A subunit  62.42 
 
 		 347 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  65.8 
 
 		 307 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  63.61 
 
 		 323 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0295  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.73 
 
 		 345 aa  401  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19682 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.54 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  64.1 
 
 		 323 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  62.94 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  60.63 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6033  quinolinate synthetase  64.87 
 
 		 323 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.452115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  57.66 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.98 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7188  quinolinate synthetase  65.19 
 
 		 323 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.014878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  57.36 
 
 		 347 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1429  quinolinate synthetase complex, A subunit  59.94 
 
 		 328 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2250  quinolinate synthetase  56.75 
 
 		 351 aa  391  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.14 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  64.38 
 
 		 323 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4432  quinolinate synthetase  54.85 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1045  quinolinate synthetase  63.7 
 
 		 323 aa  378  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.350076  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1541  quinolinate synthetase complex, A subunit  59.68 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.258054  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23170  quinolinate synthetase A  56.38 
 
 		 375 aa  365  1e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  49.4 
 
 		 343 aa  315  8e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  49.55 
 
 		 343 aa  312  4.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.39 
 
 		 298 aa  256  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.58 
 
 		 303 aa  255  9e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0785  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.93 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  45.55 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  47.12 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  47.28 
 
 		 302 aa  249  6e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  46.1 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  43.99 
 
 		 304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  40.69 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.23 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  41.86 
 
 		 325 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.86 
 
 		 308 aa  239  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.67 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  43 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  43 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.66 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  45.79 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  45.79 
 
 		 334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.04 
 
 		 306 aa  236  6e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0419  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.09 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.748276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  45.12 
 
 		 334 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.98 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.03 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2202  quinolinate synthetase  41.98 
 
 		 330 aa  230  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.189573  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  41 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  44.33 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3068  quinolinate synthetase  43.32 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.736779  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3085  quinolinate synthetase  43.32 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3128  quinolinate synthetase  43.32 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.71 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  45.37 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  45.08 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2965  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.04 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  42.81 
 
 		 305 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  43.3 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10830  quinolinate synthetase  44.59 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3619  quinolinate synthetase  45.4 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  43.28 
 
 		 323 aa  227  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  41.78 
 
 		 322 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  43.64 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.72 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  40.14 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  40.75 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11610  quinolinate synthetase  45.51 
 
 		 349 aa  226  6e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.681965  normal  0.363525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2010  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.81 
 
 		 349 aa  226  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.701511  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0394  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.23 
 
 		 332 aa  225  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  42.86 
 
 		 306 aa  226  7e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  39.67 
 
 		 304 aa  225  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.05 
 
 		 338 aa  225  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.31 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  43.43 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  40.33 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  41.39 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  39.67 
 
 		 304 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.48 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  39.14 
 
 		 333 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  44.3 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.64 
 
 		 304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  40 
 
 		 304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5730  quinolinate synthetase  42.52 
 
 		 339 aa  223  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  40.59 
 
 		 310 aa  222  6e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  40.84 
 
 		 323 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  40.61 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  41.69 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3166  quinolinate synthetase  45.4 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000173598  hitchhiker  0.0000524317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>