190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6596 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6596  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
202 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2293  thioredoxin family protein  24.12 
 
 
183 aa  55.1  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2908  Redoxin domain protein  30.91 
 
 
177 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.63 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7128  hypothetical protein  23.7 
 
 
369 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  25.16 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0089  Redoxin domain protein  32 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.31 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.36 
 
 
288 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1400  Redoxin domain protein  24.36 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3043  thioredoxin family protein  24.34 
 
 
433 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2109  redoxin  21.97 
 
 
271 aa  49.3  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0722  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 
280 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.43 
 
 
187 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2276  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.97 
 
 
342 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.54286  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  24.81 
 
 
195 aa  48.9  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0341  redoxin domain-containing protein  33.78 
 
 
203 aa  48.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2372  hypothetical protein  37.7 
 
 
202 aa  48.1  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000519623  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.87 
 
 
157 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0330837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2869  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.04 
 
 
200 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3163  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.91 
 
 
457 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.07 
 
 
445 aa  47.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  35.71 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
280 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  21.52 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0908  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.24 
 
 
405 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000924853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  23.12 
 
 
165 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  25.3 
 
 
182 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  20.25 
 
 
183 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2065  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.91 
 
 
484 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  40.35 
 
 
172 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  27.14 
 
 
196 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  25.69 
 
 
167 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2650  hypothetical protein  31.03 
 
 
304 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.141577 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  25.66 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.58 
 
 
240 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.41 
 
 
194 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.41 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  34.69 
 
 
447 aa  46.2  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3240  redoxin domain-containing protein  34.85 
 
 
198 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1036  Redoxin domain protein  32.53 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.97 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4009  Redoxin domain protein  23.42 
 
 
636 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598188  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0628  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.37 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603467  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  29.8 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0866  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.5 
 
 
183 aa  45.8  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  29.82 
 
 
183 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  26.88 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  26.88 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  26.88 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  26.88 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  24.81 
 
 
223 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  22.48 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00935  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like protein  26.11 
 
 
189 aa  45.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.263507  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  32.31 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  22.48 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5664  redoxin domain-containing protein  38.3 
 
 
223 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5746  redoxin domain-containing protein  34.85 
 
 
188 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487229  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  26.88 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5347  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.3 
 
 
223 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1674  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
344 aa  45.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3710  redoxin domain-containing protein  38.3 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3383  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.14 
 
 
164 aa  45.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  26.88 
 
 
191 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0137  redoxin domain-containing protein  27.1 
 
 
377 aa  45.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  26.88 
 
 
191 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2982  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  45.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.0639379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1448  thioredoxin family protein  30.56 
 
 
390 aa  45.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00492149  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  32.14 
 
 
194 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  32.65 
 
 
184 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  22.48 
 
 
193 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4448  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.56 
 
 
382 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.88 
 
 
191 aa  45.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  30.36 
 
 
194 aa  45.1  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4551  redoxin domain-containing protein  26.56 
 
 
256 aa  45.1  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  26.92 
 
 
174 aa  44.7  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  21.88 
 
 
194 aa  45.1  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.54 
 
 
455 aa  45.1  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  34.55 
 
 
165 aa  45.1  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2523  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.74 
 
 
369 aa  44.7  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.434668  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  27.21 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  27.21 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2205  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.55 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183966 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  22.39 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  28.57 
 
 
183 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2908  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  38.46 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629655  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  26.19 
 
 
180 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  28.07 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  28.07 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  28.07 
 
 
183 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.51 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0984  thioredoxin  31.71 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  27.21 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2010  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
399 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0199  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20 
 
 
177 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5432  redoxin domain-containing protein  34.55 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.97982  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  26.88 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3793  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.81 
 
 
393 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3943  redoxin domain-containing protein  25.32 
 
 
659 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1405  putative thioredoxin related protein  30.86 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.436959 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>