17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5110 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5110  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  633  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0659  hypothetical protein  49.53 
 
 
335 aa  288  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3620  hypothetical protein  40.42 
 
 
359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00523905  normal  0.600946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3409  hypothetical protein  31.45 
 
 
327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2403  hypothetical protein  33.97 
 
 
298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1050  hypothetical protein  32.14 
 
 
288 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3365  hypothetical protein  30.71 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0918  hypothetical protein  27.9 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0020279  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4259  hypothetical protein  28.35 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.183136 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0917  hypothetical protein  27.63 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0467358  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0984  hypothetical protein  30.41 
 
 
265 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1692  hypothetical protein  24.76 
 
 
229 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0660  hypothetical protein  24.88 
 
 
223 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5743  hypothetical protein  30.65 
 
 
238 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3621  hypothetical protein  23.73 
 
 
230 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00670204  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  22.05 
 
 
440 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3470  hypothetical protein  26.24 
 
 
311 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.172698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>