20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3621 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3621  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  472  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00670204  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0660  hypothetical protein  46.96 
 
 
223 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3410  hypothetical protein  31.67 
 
 
231 aa  118  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0984  hypothetical protein  26.86 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3365  hypothetical protein  30.19 
 
 
303 aa  89  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1692  hypothetical protein  27.8 
 
 
229 aa  88.2  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04325  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.21 
 
 
220 aa  85.9  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1050  hypothetical protein  29.58 
 
 
288 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3409  hypothetical protein  26.61 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0917  hypothetical protein  29.17 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0467358  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0659  hypothetical protein  28.46 
 
 
335 aa  58.9  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3620  hypothetical protein  25.23 
 
 
359 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00523905  normal  0.600946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0918  hypothetical protein  24.35 
 
 
303 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0020279  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1355  hypothetical protein  26.42 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.231212  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1620  hypothetical protein  24.19 
 
 
230 aa  52.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269687  normal  0.0195645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4259  hypothetical protein  23.61 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.183136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5110  hypothetical protein  23.73 
 
 
311 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0189  hypothetical protein  25.96 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.776324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5743  hypothetical protein  22.51 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2403  hypothetical protein  27.34 
 
 
298 aa  42.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>