18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1050 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1050  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  585  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0984  hypothetical protein  33.21 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5110  hypothetical protein  32.14 
 
 		 311 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4259  hypothetical protein  34.29 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.183136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3365  hypothetical protein  29.2 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3620  hypothetical protein  32.86 
 
 		 359 aa  96.3  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00523905  normal  0.600946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0917  hypothetical protein  29.78 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0467358  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0659  hypothetical protein  33.81 
 
 		 335 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5743  hypothetical protein  31.5 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3621  hypothetical protein  29.58 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00670204  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3409  hypothetical protein  35.19 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0918  hypothetical protein  26.12 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0020279  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0660  hypothetical protein  25.69 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2403  hypothetical protein  24.38 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1692  hypothetical protein  26.11 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3410  hypothetical protein  24.46 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1355  hypothetical protein  24.19 
 
 		 218 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.231212  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0189  hypothetical protein  26.19 
 
 		 235 aa  42.7  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.776324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>