18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3365 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3365  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  618  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3409  hypothetical protein  33.12 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0984  hypothetical protein  31.14 
 
 		 265 aa  109  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3620  hypothetical protein  34.47 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00523905  normal  0.600946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1050  hypothetical protein  29.2 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0659  hypothetical protein  30.23 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5110  hypothetical protein  30.71 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3621  hypothetical protein  30.19 
 
 		 230 aa  89  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00670204  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1692  hypothetical protein  26.81 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0660  hypothetical protein  26.64 
 
 		 223 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0918  hypothetical protein  28.51 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0020279  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3410  hypothetical protein  23.36 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04325  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  24.34 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5743  hypothetical protein  30.92 
 
 		 238 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4259  hypothetical protein  26.22 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.183136 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0917  hypothetical protein  30.93 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0467358  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2403  hypothetical protein  27.45 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1355  hypothetical protein  22.66 
 
 		 218 aa  43.5  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.231212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>