18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0660 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0660  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3621  hypothetical protein  46.96 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00670204  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3410  hypothetical protein  29.61 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04325  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.9 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0984  hypothetical protein  26.4 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1692  hypothetical protein  26.91 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3365  hypothetical protein  26.64 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1050  hypothetical protein  25.69 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3409  hypothetical protein  24.71 
 
 		 327 aa  61.6  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0917  hypothetical protein  25.1 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0467358  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5110  hypothetical protein  24.88 
 
 		 311 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0189  hypothetical protein  29.52 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.776324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0659  hypothetical protein  24.43 
 
 		 335 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4259  hypothetical protein  24.71 
 
 		 281 aa  45.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.183136 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1355  hypothetical protein  25.23 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.231212  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0918  hypothetical protein  24.6 
 
 		 303 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0020279  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3620  hypothetical protein  27.31 
 
 		 359 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00523905  normal  0.600946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1620  hypothetical protein  25.12 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269687  normal  0.0195645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>