16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0659 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0659  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  693    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5110  hypothetical protein  49.53 
 
 
311 aa  288  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3620  hypothetical protein  45.03 
 
 
359 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00523905  normal  0.600946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3409  hypothetical protein  36.23 
 
 
327 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2403  hypothetical protein  27.67 
 
 
298 aa  95.9  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3365  hypothetical protein  30.23 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0917  hypothetical protein  28.32 
 
 
303 aa  93.2  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0467358  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1050  hypothetical protein  33.81 
 
 
288 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0984  hypothetical protein  29.71 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4259  hypothetical protein  29.69 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.183136 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0918  hypothetical protein  27.4 
 
 
303 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0020279  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1692  hypothetical protein  25.76 
 
 
229 aa  63.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3621  hypothetical protein  28.46 
 
 
230 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00670204  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5743  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0660  hypothetical protein  24.43 
 
 
223 aa  46.2  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1355  hypothetical protein  25.81 
 
 
218 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.231212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>